Таблица 2. Все виды, имеющие белки, высоко гомологичные

Таблица 2. Все виды, имеющие белки, высоко гомологичные белку NP_249058,
некоторые из них являются потенциальными факторами белок-ДНКовой регуляции.
Характеристики гомолога и соответствующего сайта связывания: (1) Expect value для
ближайшего гомолога белка NP_249058.1 из семейства TetR; (2) Качество сайта:
расстояние между консенсусом и найденным сайтом перед указанными видом и геном;
(3) Количество найденных сайтов перед указанными видом и геном; обозначение «–»
указывает, что сайт перед генами pro не найден.
Вид
(1)
(2)
(3)
7.06
8.98; 9.7
7.77
8.45; 10.64
6.45; 10.64
8.38
9.28; 9.58
8.98; 10.23
9.21; 8.53
8.19; 11.85
9.96
8.6; 6.45
9.09
8.83
8.11
1
2
1
2
2
1
2
2
2
2
1
2
1
1
1
8.53
7.77; 8.11
6.04; 5.32
6.04; 5.32
6.98; 5.32
6.04; 5.32
5.74
5.32
5.32
5.74
5.32
5.74
5.32
5.32
5.74
9.09
9.09
7.7; 10.26
8; 8.49
10.19; 9.81
9.28
1
2
2
2
2
2
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
2
2
2
1
ген proA (не входящий в оперон)
Pseudomonas aeruginosa
P. putida
P. syringae
P. mendocina
P. entomophila
P. stutzeri
Marinobacter algicola
M. aquaeolei
Marine γ-proteobacterium
Oceanobacter sp. RED65
Acinetobacter sp. ADP1
A. radioresistens
Alcanivorax borkumensis
Congregibacter litoralis
Oceanospirillum sp. MED92
(Neptuniibacter caesariensis)
4·10-123
2·10-83
2·10-74
3·10-88
1·10-81
1·10-77
1·10-51
1·10-52
3·10-3
6·10-63
4·10-46
9·10-48
1·10-43
6·10-24
7·10-4
оперон proBA
Shewanella amazonensis
2·10-30
S. frigidimarina
7·10-33
S. oneidensis
8·10-32
S. sp. MR-4
1·10-31
S. sp. MR-7
3·10-33
S. sp. ANA-3
3·10-31
S. loihica PV-4
1·10-29
S. baltica
2·10-30
S. putrefaciens
2·10-29
S. benthica
9·10-32
S. sediminis
2·10-32
S. woodyi
6·10-33
S. piezotolerans
2·10-32
S. pealeana
2·10-32
S. halifaxensis
3·10-32
Aeromonas hydrophila
1·10-30
A. salmonicida
2·10-30
Vibrionales bacterium
9·10-31
Pseudoalteromonas tunicata
7·10-31
P. Haloplanktis
3·10-28
Alteromonas macleodii
8·10-13
Гены pro, сайт не найден
Pseudomonas fluorescens
1·10-87
–
Hahella chejuensis
Acinetobacter baumannii
Marinobacter sp. ELB17
Marinobacter sp. ELB17
Acinetobacter sp. ATCC 27244
Marinomonas sp. MED121
Vibrio cholerae
V. vulnificus
V. parahaemolyticus
V. sp. MED222
V. campbellii
V. splendidus
V. alginolyticus
V. shilonii
V. harveyi
V. fischeri
V. salmonicida
V. angustum
Moritella sp. PE36
Photobacterium sp. SKA34
Shewanella denitrificans
Alteromonadales bacterium TW-7
Photobacterium profundum
Reinekea sp. MED297
Hahella chejuensis
1·10-51
2·10-46
8·10-46
9·10-28
2·10-45
9·10-45
1·10-31
2·10-31
7·10-31
2·10-30
3·10-30
3·10-30
3·10-30
3·10-30
7·10-30
2·10-29
4·10-29
5·10-28
2·10-31
2·10-27
2·10-27
2·10-26
3·10-26
6·10-26
4·10-25
–
–
–
–
–
–
–
–
–
–
–
–
–
–
–
–
–
–
–
–
–
–
–
–
–