Фолдинг белка

advertisement
Выполнила:
Студентка 2 курса кафедры биоинженерии
Ефимова Дарья
Белки
 Белки — это биологические молекулы,
выполняющие тысячи специфических функций
внутри каждой клетки живого организма. Белки
синтезируются в рибосомах в виде длинной
полипептидной нити, но затем быстро
сворачиваются в свою естественную
пространственную структуру. Этот процесс
называется фолдинг белка.
Задача
α- угол между двумя звеньями цепи
А- некоторая константа размерности энергии
-B- энергия каждой «склейки»
Aα2/2- повышение энергии при изгибании цепочки
Одна петля с двойным хвостиком
Пусть имеется петля из m несклеенных
звеньев Характерный угол между
соседними звеньями в ней —
примерно 2π/m.
Появление петли
Оптимальное значение энергии
Оптимальное значение длины петли
Энергия петли
Вторая петля
Энергия для цепи с одной и двумя петлями
Энергия для большего числа
петель
 E1=E0-1/2(N-m)*B
 E2=2*E0-2/3(N-2*m)*B
 E3=3*E0-3/4(N-3*m)*B
…
 Функция имеет вид:
 E(k,N)=k*E0-k/(k+1)*(N-k*m)*B
Зависимость количества петель
от длины цепи
 N=50 , A=1, B=0.25
 N=102 , A=1, B=0.25
 N=250 , A=1, B=0.25
 N=400 , A=1, B=0.25
 N=600 , A=1, B=0.25
Спасибо за внимание!
Download