Семейства белковрегуляторов транскрипции у эукариот. Типы транскрипционных факторов Базальные – обязательно необходимые, для связывания РНК-полимеразы с промотором. Активаторы- белки, связывающиеся с промотором и усиливающие транскрипцию Репрессоры - белки, связывающиеся с промотором и угнетающие транскрипцию В эукариотах последовательность на промоторе,узнаваемая активаторами называется response element Коактиваторы- факторы не связывающиеся с ДНК, но необходимые для связывания факторов с ДНК. Response element Heat shock response element (HRE) Glucocorticoid response element (CRE) Estrogen response element (ERE) Serum response element (SRE) Способы активации ТФ Классификация транскрипционных факторов Факторы, ДНК-связывающий домен которых обогащен положительно заряженными аминокислотными остатками -Факторы с доменами спираль-петля-спираль (bHLH) Факторы, у которых ДНК-связывающий домен формируется с участием координированных ионов цинка - zinc-coordinated DNA-binding domain Факторы, имеющие ДНК-связывающий мотив типа спираль-поворот-спираль ( helix-turn-helix DNA binding motif, 369 факторов ). -Гомеодомены Zn-finger (Цинковый палец).”Классический” C2H2 Cys-X2-4-Cys-X3-Phe-X5-Leu-X2-His-X3-His His и Cys остатки связываются с Zn благодаря чему весь мотив сворачивается в компактный домен В одном белке может Содержаться от 2 до 30 Цинковых пальцев Zn-finger C2H2 С- концевая часть каждого пальца формирует альфа-спираль. N-концевая часть Каждого пальца формирует бета-лист. Каждая альфаспираль формирует 2 специфичных контакта с ДНК Взаимодействие с ДНК Ядерные рецепторы гормонов как активаторы Лиганд-зависимые активаторы. Имеют отдельные ДНК - и лиганд – связывающие домены. Способы активации ТФ Стероидные рецепторы имеют Zn-finger типа C4 ДНК –связывающие домены стероидных рецепторов – разновидность Zn-finger, имеющих Cys ,но не His остатки. Cys-X2-Cys-X13-Cys-X2-Cys Стероидные рецепторы связываются с ДНК как димеры (палиндромный сайт посадки на ДНК) Глюкокортикоидные и эстрагеновые рецепторы 2 цинковых пальца 1ый участвует ДНК-связывании. 2ой отвечает за димеризацию. Образуют гомодимеры Тиреоидные и ретиноидные рецепторы. Образуют гетеродимеры. Сайт посадки – прямые ДНК повторы. Разным гетеродимерам соответствуют последовательности на ДНК с разной длиной между прямыми повторами. Zn-finger(Zn2C6) в структуре фактора GAL4 К вопросу о димерах и мономерах.. Белки с гомеодоменами Гомеодомен – ДНК-связывающий домен ок. 60 а.о.,образующих 3 альфаспирали. 17 а.о третьей альфа-спирали на Сконце взаимодействуют с большой бороздкой ДНК Белки с гомеодоменами могут быть как активаторами,так и репрессорами транскрипции Белки с гомеодоменами НТН-мотив встречающийся в гомеодоменах также встречается у прокариот. HTH мотив Спецефические Взаимодействия Не специфические Взаимодействия Нelix-loop-heliх helix-loop-helix (HLH) =спираль-петля-спираль – мотив,ответственный за димеризацию класса транскрипционных факторов (HLH белков) bHLH белки имеют ДНК-связывающий участок,прилегающий к HLH мотиву. HLH белки длиной 40-50 а.о.,содержат 2 амфипатический альфа-спирали,разделенные 15-16 а.о HLH белки связываясь с bHLH белками образуют гетеродимер не способный связываться с ДНК. Нelix-loop-heliх Пример регуляции при помощи HLH белков Leucine zippers – Лейциновая молния Лейциновая молния – тип димеризующего мотива. Димеризация происходит за счет амфипатической cпирали, в которой каждым седьмым аминокислотным остатком является Leu Все боковые остатки Leu выступают с одной стороны альфа-спирали и при воздействии двух полипептидных цепей переплетаются друг с другом, как в застежке-молнии Signaling