Тема: «Изучение термодинамических параметров комплекса

Тема: «Изучение термодинамических параметров комплекса
тромбина с ДНК-аптамером»
Научный руководитель
с.н.с. НИИФХБ им. Белозерского
Спиридонова В.А.
В норме организм поддерживает гемостатический баланс, который нарушается
при повреждении сосудов, а также
при патологических процессах, приводящих к
геморрагиям (кровотечения при недостаточном синтезе тромбина) или при его
избыточном синтезе (тромбоз). Нужны эффективные средства, которые позволяют тонко
регулировать данный баланс, не сдвигая равновесие в ту или другую сторону.
Используемые в настоящее время лекарственные препараты жестко сдвигают
данное равновесие, что часто вызывает побочные эффекты.
Тромбин – ключевой фермент свертывания крови. Он участвует как в реакциях
свертывания крови, так и в противосвертывающих процессах.
В настоящее время разработан метод SELEX, который позволяет нарабатывать
аптамеры, небольшие фрагменты нуклеиновых кислот, обладающих высоким сродством к
белку, в данном случае к тромбину. Аптамеры служат ингибиторами протеолитической
активности тромбина, и тем самым выступают в роли новых лекарственных препаратов,
которые к тому же не вызывают аллергических последствий.
В данной работе будет изучен специфический комплекс ДНК-аптамера с тромбином. in
vitro. Нуклеопротеидные комплексы характеризуются константами диссоциации, значения
которых позволяют оценить его стабильность, и следовательно,
специфичность
взаимодействия белка с нуклеиновой кислотой.
В работе будут использованы различные методы: получение набора радиоактивномеченных ДНК-аптамеров с помощью PCR, электрофорезы для характеристики белка,
фильтрация на нитроцеллюлозных мембранах, расчет термодинамических параметров
ДНК-тромбиновых комплексов.
Приглашаются студенты 1, 2 курсов.