Мета-анализ экспрессии генов в адипозной ткани человека

advertisement
Мета-анализэкспрессиигеновв
адипознойтканичеловека
СмирновД.Д.
Руководители:
ДмитриеваР.И,к.б.н.,СЗФМИЦАлмазова,СПб
ПредеусА.,Ph.D.,Институтбиоинформатики,СПб
2016
Цель
Мета-анализизмененийэкспрессиивжировойткани
человекаврезультатепеременыусловий(дифференциация,
голодание,обработкалекарствами),наосновепублично
доступныхданных
Задачи
•  Собратьбазувсехсуществующихэкспериментовпо
измерениюуровнейэкспрессиигеновв
человеческихадипоцитах
•  Освоитьобработкуэтихданных
•  Провестианализсигнальныхиметаболических
путей,устойчивопроявляющихсяприизменении
биологическихусловий
Жировая ткань
•  Адипознаятканьявляетсясамымбольшимэндокринныморганомв
организмечеловека,активносекретирующимгормоныисигнальные
молекулы.Многиеширокораспространённыезаболевания(сахарный
диабет2-готипа,хроническиевоспалительныепроцессы)связанныхс
изменениямивфункцияхадипознойткани.
ДНК-микрочип
Что сделано
Что нужно сделать
1.  Проанализироватьсигнальныеиметаболические
путиприпомощиGSEAивыявитькакие-нибудь
закономерности
2.  СобратьданныепоRNA-seqдлячеловека
Related documents
Download