1. Классификация

Реферат на тему:
Кодон
План:
Введение



1 Классификация
2 Таблица кодонов РНК
3 Неканонические значения кодонов
Примечания
Введение
Кодо́н (кодирующий тринуклеотид) — единица генетического кода, тройка нуклеотидных
остатков (триплет) в ДНК или РНК, обычно кодирующих включение одной
аминокислоты. Последовательность кодонов в гене определяет последовательность
аминокислот в полипептидной цепи белка, кодируемого этим геном.
1. Классификация
Поскольку существует 4 различных нуклеотида, то общее число кодонов равняется 64, из
которых 61 кодируют определённые аминокислоты, а 3 оставшихся кодона (UGA, UAG и
UAA) сигнализируют об остановке трансляции полипептидной цепи и называются стопкодонами. Кодон UAG в мРНК носит ещё название амбер-кодон (Amber), UGA — опал
(Opal), а UAA — охра (Ochre). Стоп-кодоны выполняют важную функцию завершения
(терминацию) сборки полипептидной цепи и также называются терминаторными
кодонами. Некоторые из них вызывают обязательное прекращение синтеза, другие
являются условными[1].
Кроме того, стоп-кодон, как кодон при котором не происходит включения аминокислоты
в белок, ещё называют бессмысленным кодоном или нонсенс-кодоном.
Стартовым кодоном у эукариотических организмов является триплет AUG в мРНК,
кодирующий метионин, с которого начинается образование полипептидной цепи в
процессе трансляции. У некоторых прокариотов стартовыми кодонами так же являются
GUG, AUU, CUG, UUG.
Так как в процессе биосинтеза белка в полипептидную цепь участвует всего 20
аминокислот, то различные кодоны могут кодировать одинаковые аминокислоты, такие
кодоны принято называть изоакцепторными кодонами.
2. Таблица кодонов РНК
Таблица, отображающая 64 кодона и аминокислоты, соответствующие каждому из них.
1ое
основание
2ое основание
U,dT
C,dC
UUU (Phe/F)
Фенилаланин
UUC (Phe/F)
Фенилаланин
UUA (Leu/L) Лейцин
UUG (Leu/L) Лейцин
UCU (Ser/S)
Серин
UCC (Ser/S)
Серин
UCA (Ser/S)
Серин
UCG (Ser/S)
Серин
UGU (Cys/C)
UAU (Tyr/Y) Тирозин Цистеин
UAC (Tyr/Y) Тирозин UGC (Cys/C)
UAA Стоп-кодон
Цистеин
(Ochre)
UGA СтопUAG Стоп-кодон
кодон (Opal)
(Amber)
UGG (Trp/W)
Триптофан
C,dC
CUU (Leu/L) Лейцин
CUC (Leu/L) Лейцин
CUA (Leu/L) Лейцин
CUG (Leu/L) Лейцин
CCU (Pro/P)
Пролин
CCC (Pro/P)
Пролин
CCA (Pro/P)
Пролин
CCG (Pro/P)
Пролин
CAU (His/H)
Гистидин
CAC (His/H) Гистидин
CAA (Gln/Q)
Глутамин
CAG (Gln/Q)
Глутамин
CGU (Arg/R)
Аргинин
CGC (Arg/R)
Аргинин
CGA (Arg/R)
Аргинин
CGG (Arg/R)
Аргинин
A,dA
AUU (Ile/I)
Изолейцин
AUC (Ile/I)
Изолейцин
AUA (Ile/I)
Изолейцин
AUG (Met/M)
Метионин,
Стартовый1
ACU (Thr/T)
Треонин
ACC (Thr/T)
Треонин
ACA (Thr/T)
Треонин
ACG (Thr/T)
Треонин
AAU (Asn/N)
Аспарагин
AAC (Asn/N)
Аспарагин
AAA (Lys/K) Лизин
AAG (Lys/K) Лизин
AGU (Ser/S)
Серин
AGC (Ser/S)
Серин
AGA (Arg/R)
Аргинин
AGG (Arg/R)
Аргинин
GCU (Ala/A)
Аланин
GCC (Ala/A)
Аланин
GCA (Ala/A)
Аланин
GCG (Ala/A)
Аланин
GAU (Asp/D)
Аспарагиновая
кислота
GAC (Asp/D)
Аспарагиновая
кислота
GAA (Glu/E)
Глутаминовая кислота
GAG (Glu/E)
Глутаминовая кислота
GGU (Gly/G)
Глицин
GGC (Gly/G)
Глицин
GGA (Gly/G)
Глицин
GGG (Gly/G)
Глицин
U,dT
G,dG
GUU (Val/V) Валин
GUC (Val/V) Валин
GUA (Val/V) Валин
GUG (Val/V) Валин
Расшифровка завершена в 1966 году[1].
A,dA
G,dG
3. Неканонические значения кодонов
По крайней мере у 16 типов организмов генетический код отличается от канонического.
Например многие виды зелёных водорослей Acetabularia транслируют стандартные стопкодоны UAG и UAA в аминокислоту глицин, а гриб Candida интерпретирует РНК-кодон
CUG не как лейцин, а как серин. А у митохондрий пекарских дрожжей (Saccharomyces
cerevisiae) четыре из шести кодонов, обычно транслирующихся в лейцин, кодируют
треонин.
Существование таких вариаций свидетельствует о возможной эволюции генетического
кода.
Представители почти всех трёх доменов живых организмов иногда прочитывают
стандартный стоп-кодон UGA как 21-ю аминокислоту селеноцистеин, не относящуюся к
20 стандартным. Селеноцистеин образуется при химической модификации серина на
стадии, когда последний ещё не отсоединился от тРНК в составе рибосомы.
Аналогично у представителей двух доменов (архебактерий и бактерий) стоп-кодон UAG
прочитывается как 22-я аминокислота пирролизин.
Отличия от универсального кода имеются и в митохондриальной ДНК (см. раздел
Особенности).
Примечания
1. ↑ 1 2 Айала Ф. Д. Современная генетика. 1987.