под научным руководством Н.А. Пономаренко

Список лиц,
выполнивших диссертационные работы
под научным руководством Н.А. Пономаренко
Фамилия,
№
имя,
отчество
1 Дурова
Оксана
Михайловна
Наименование
ученой степени
Кандидат
биологических
наук
2
Решетняк
Андрей
Васильевич
Кандидат
химических наук
3
Белогуров
Алексей
Анатольевич
Смирнов
Иван
Витальевич
Кандидат
химических наук
5
Бобик
Татьяна
Владимировна
Кандидат
химических наук
6
Куркова
Инна
Николаевна
Кандидат
биологических
наук
4
Кандидат
химических наук
Название диссертации
Протеолитическая активность
аутоантител, специфичных к
основному белку миелина и
кардиомиозину, при аутоиммунных
нарушениях у человека и модельных
животных
Получение искусственных
биокатализаторов на основе антител,
способных осуществлять
«ковалентный катализ»
Каталитическое расщепление
основного белка миелина
антителами
Структурно-функциональное
исследование искусственного
биокатализатора, полученного на
основе антиидиотипического
антитела
Получение рекомбинантного
человеческого сывороточного
альбумина в метилотрофных
дрожжах Pichia pastoris
Структурно-функциональный анализ
каталитического антитела А.17.
Каталитический механизм
деградации фосфорорганического
пестицида параоксон.
Год
присуждения
степени
2003
2007
2008
2008
2009
2011
СПИСОК
Опубликованных научных работ
Пономаренко Натальи Александровны
№
п/
п
1
1
2
3
Наименование работы
2
Роль индуцированных Nнитрозомочевинами
изменений в структуре
нуклеоида и активности
ферментов репарации в
проявлении лекарственной
устойчивости у мышей с
лейкозом L1210
In vivo DNA damage and
resistance to 1-methyl-1nitrosourea and 1,3-bis(2chloroethyl)-1-nitrosourea in
L1210 leukemia cells.
Обнаружение
альтернативного сплайсинга в
локусе cut D. melanogaster.
Вид
работ
ы
3
статья
Соавторы
6
Дурдыева Э.Д.,
Пономаренко Н.А.,
Кукушкина Г.В.,
Горбачева Л.Б.
12
Neoplasma.
1988;35(1):314.
Gorbacheva LB,
Kukushkina GV,
Durdeva AD,
Ponomarenko NA.
статья
Докл. Акад.
Наук, 1988;
т. 303, №4,
984-986.
Докл. Акад.
Наук, 1988;
т. 303, № 2,
с. 491-493.
In “Nuclear
Structure
and
Function”.
1990. Plenum
Press, New
York; p. 4751.
Докл. Акад.
Наук 1992,
т. ;327, № (46), с. :584588.
Proc Natl
Acad Sci
USA. 1992;
89(15):6751-
3
Чуриков Н.А.,
Пономаренко Н.А.,
Георгиев Г.П.
3
Чуриков Н.А,
Пономаренко Н.А.,
Айрих Л.Г.
5
Churikov N.A.,
Ponomarenko N.A.
5
Пономаренко Н.А.,
Чистякова Л.Г.,
Чернов Б.К.,
Чуриков Н.А.
5
Tchurikov NA,
Ponomarenko NA.
статья
6
Образование параллельных
РНК-РНК-дуплекса in vivo в
клетках Escherichia coli..
статья
7
Detection of DNA domains in
Drosophila, human, and plant
chromosomes possessing mainly
50- to 150-kilobase stretches of
статья
5
4
Биохимия
1987, т. 52,
№ 8 с. 13351343.
Объем
работы, с.
5
9
статья
Выделение и характеристика
специфической фракции
хромосомной ДНК человека –
форум ДНК//
Isolation and properties of a
novel specific fraction of
chromosomal DNA from
Human, drosophila and plant
cells.
4
Выходные
данные
статья
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
DNA.
Альтернативный сплайсинг
ОРА-подобных элементов в
локусе cut D. melanogaster.
5.
статья Докл. Акад. 4
Наук, 1993
т. 330, № (1),
с. 123-126.
Образование параллельных статья Докл. Акад.
7
РНК-РНК-дуплексов in
Наук, 1994, т.
vitro.
339, № (1), с.
113-119.
Ретротранспозон дрозофилы статья Докл. Акад.
5
– суффикс – имеет древний
Наук, 1995, т.
домен и в разной
345, № (3), с.
ориентации выполняет
410-414.
некодирующие и
кодирующие функции в
ядре и цитоплазме.
The formation of parallel
статья J Biomol Struct
7
RNA-RNA duplexes in vitro.
Dyn. 1995
(3):507-13.
Пономаренко Н.А.,
Чуриков Н.А.
Чуриков Н.А,
Пономаренко Н.А.,
Голова Ю.Б.,
Чернов Б.К.
Колесников А.В.,
Чуриков Н.А,
Пономаренко Н.А.
Tchurikov N.A.,
Ponomarenko N.A.,
Golova Y.B.,
Chernov B.K.
Колесников А.В.,
Пономаренко Н.А.,
Чуриков Н.А.
Анализ копий суффикса –
ретропозона дрозофилы –
наработанных с помощью
ПЦР на геномной ДНК.
Молекулярный анализ
копии нового мобильного
элемента – репейник
(burdock) – и района его
инсерции в локусе cut D.
melanogaster.
Изучение транскрипции
мобильного элемента
репейник(burdock) на
разных стадиях развития
дрозофилы.
Burdock, a novel
retrotransposon in Drosophila
melanogaster, integrates into
the coding region of the cut
locus.
Forum domain in Drosophila
melanogaster cut locus
possesses looped domains
inside.
статья
Генетика, 1996,
т.32, № 1, с. 150153
4
статья
Генетика, 1997,
т.33, № 1, с. 1218.
7
Пономаренко Н.А.,
Айрих Л.Г.,
Банников В.М.,
Анащенко В.А.,
Чуриков Н.А.
статья
Докл. Акад.
Наук, 1997,
т.355, № 2, с.266268
3
Пономаренко Н.А.,
Айрих Л.Г.,
Мезохот К.,
Чуриков Н.А.
статья
FEBS Lett. 1997;
413(1):7-10.
4
Ponomarenko NA,
Bannikov VM,
Anashchenko VA,
Tchurikov NA.
статья
7
Nucleic Acids
Res. 1998;
26(13):3221-3227.
Обнаружение новых ткане-
статья
Генетика, 1999,
Tchurikov NA,
Krasnov AN,
Ponomarenko NA,
Golova YB,
Chernov BK.
Павлова Г.В.,
5
специфичных энхансеров в
регуляторной области ct6
локуса cut дрозофилы.
18
19
т. 35, № 2, с. 412416
Локализация транскриптов, статья Генетика, 1999,
соответствующих
т. 35, № 5, с. 716различным областям локуса
720
cut, в эмбрионах дрозофилы.
Каталитическая активность статья Доклады
нативных антител у мышей
Академии Наук,
с аутоиммунными
2000. Т. 375. С.
нарушениями.
224-227.
5
4
20
Система экспрессии
растворимой формы
онконазы.
статья Биоорганическая
химия (2001);
27(4):257-264
8
21
Новый вариант
экспериментальной модели
множественной миеломы.
статья Бюл. Экс. Биол.
Мед. 2001, т. 131,
№ (6), с. 717-720.
4
22
Catalytic antibodies in
clinical and experimental
pathology: human and mouse
models.
статья J. Immunol.
Methods. 2002 . v.
269. №1-2 p.197211.
15
23
Антитела – протеазы:
статья Биохимия, (2002)
14
Чуриков Н.А.,
Корочкин Л.И.,
Пономаренко Н.А.,
Шостак Н.Г.
Чуриков Н.А.,
Пономаренко Н.А.,
Мезахот К.,
Шостак Н.Г.
Н.А. Пономаренко,
Е.С. Александрова,
И.И. Воробьев,
О.М. Дурова,
А.В. Козырь,
А.В. Колесников,
Г.Б. Телегин,
А.Р. Калинина,
С.В. Сучков,
А.Г. Габибов.
Воробьев И.И.,
Пономаренко Н.А.,
Дурова О.М.,
Козырь А.В.,
Демин А.В.,
Колесников А.В.,
Сащенко Л.П.,
Карпейский М.Я.,
Габибов А.Г.
Телегин Г.Б.,
Калинина А.Р.,
Пономаренко Н.A.,
Овсепян А.А.,
Смирнов С.В.,
Цыбенко В.В.,
Хомерики С.Г.
N.A. Ponomarenko,
O.M. Durova,
I.I. Vorobiev,
E.S. Aleksandrova,
G.B. Telegin,
O.G. Chamborant,
L.L. Sidorik,
S.V. Suchkov,
Z.S. Alekberova,
N.V. Gnuchev,
A.G. Gabibov.
А.Г. Габибов,
подходы к индукции
каталитического ответа.
т. 67, с. 1413-1426.
24
. Catalytic Antibodies in
Immune-Mediated Disorders.
статья
25
Method for producing
catalytic antibodies
(variants), antigens for
immunisation and nucleotide
sequence
патент US Patent
Application No:
2004/0265,975
1
26
Каталитические антитела в
медицине: специфическая
деградация аутоантигенов
и новые подходы к
инактивации патогенов
статья
Молекулярная
медицина, 2004,
№3, с.48-55.
8
27
К вопросу о
каталитической активности
аутоантител при
рассеянном склерозе.
статья
Доклады
Академии Наук,
2004 т.395, с.839842
4
28
Рекомбинантная
плазмидная ДНК pES1-6,
кодирующая полипептид
соматотропин, и штамм
патент №2233879
RU 2233879 С1
2002133932/13
Дата публикации:
1
Frontiers in
18
Autoimmunity,
Fundamental
Aspects and Clinical
Perspectives; NATO
Science series; series
I, IOS Press 2003, V.
354 p. 126-143.
А. Фрибуле,
Д. Тома,
А.В. Демин,
Н.А. Пономаренко,
И.И. Воробьев,
Д. Пиле,
М. Паон,
Е.С. Александрова,
Г.Б. Телегин,
А.В. Решетняк,
О.В. Григорьева,
Н.В. Гнучев,
К.А. Малышкин,
Д.Д. Генкин
E. S. Alexandrova,
N.A. Ponomarenko,
I. I. Vorobiev,
O. M. Durova,
S.V. Suchkov,
Z.S Alekberova,
F.N. Paleev,
L. P. Sashenko,
N. V. Gnuchev,
A. G. Gabibov
Gabibov A. G.
Ponomarenko NA
Kolesnikov AV, ,
Vorobiev II.
Alexandrova E. S.,
Demin AV.
Воробьев И.И.,
Пономаренко Н.А.,
Решетняк А.В.,
Дурова О.М.,
Мисиков В.К.,
Сучков С.В.,
Габибов А.Г.
Н.А. Пономаренко,
О.М. Дурова,
И.И. Воробьев,
С.В. Сучков,
А.Г. Габибов.
Габибов А.Г.
Пономаренко Н.А.
Воробьев И.И
Демин А.В.
29
Esherichia Coli
BL21(DE3)/pES1-6продуцент
рекомбинантного
соматотропина
Каталитические
аутоантитела при
рассеянном склерозе:
патогенетические и
клинические аспекты.
Мартьянов В.А.
Шустер А.М.
Баирамашвили Д.И.
Мирошников А.И.
2004.08.10
статья
Бюл. Экс. Биол.
Мед. 2005 т. 139.
№(1), с. 98-101.
4
30
Достижения и
перспективы клинической
абзимологии
статья
Вестник РАМН,
2005, №9, С. 38-43.
6
31
Каталитические
аутоантитела при
аутоиммунном
миокардите: клиническое и
патогенетическое значение
статья
Терапевтический
архив, 2005, №(9),
с. 65-70.
6
32
Аутоантитела при
рассеянном склерозе:
патогенетическая и
клиническая зависимость
статья
Неврологический 6
журнал, 2005, №4,
т.10, с. 49-54.
33
Новые механизмы
антителоопосредованной
цитотоксичности и их
возможная роль в
патогенезе аутоиммунных
заболеваний.//
статья
Молекулярная
медицина, 2005,
№1, С. 32-36.
5
В.К. Мисиков,
М.В. Кимова,
О.М. Дурова,
А.Г. Габибов,
С.В. Сучков,
И.И. Воробьев,
Н.А.Пономаренко
С.В. Сучков,
З.С. Алекберова,
Ф.Н. Палеев,
Т.Е. Наумова,
В.К. Мисиков,
Е.С. Кряжева,
Н.А. Пономаренко
А.Г. Габибов
Е.В. Калинина,
Н.А. Пономаренко,
О.М. Дурова,
Ф.Н. Палеев,
И.И. Воробьев,
Н.Н. Кекенадзе,
З.А. Шогенов,
М.Е. Земцова,
Н.В. Гнучев,
А.Г. Габибов,
С.В. Сучков
Сучков С.В.,
Мисиков В.К.,
Дурова О.М.,
Черепахина Н.Е.,
Кимова М.В.,
Введенская О.Ю.,
Пономаренко Н.А.,
Пронина О.А., Котов
С.В., Габибов А.Г.
С.В. Сучков,
Т.Е. Наумова,
А.Н. Хитров,
В.А. Агеев,
Е.А. Огнева,
З.С. Алекберова
34
Высокоэффективный
процесс получения
гормона роста человека
статья
Биотехнология,
2005, №5, с 44-48
35
ДНК-абзимы при
ревматоидном артрите:
патогенетическая и
клиническая значимость//
статья
Терапевтический 6
архив, 2005, № 11,
с.75-80
36
Рекомбинантная
плазмидная ДНК pES3-7,
кодирующая полипептид с
последовательностью
гранулоцитарного
колониестимулирующего
фактора человека, и штамм
Escherichia Coli
BL21(DE3)/pES3-7 –
продуцент
рекомбинантного
гранулоцитарного
колониестимулирующего
фактора человека
Рекомбинантная
плазмидная ДНК pES4-4,
кодирующая полипептид
интерферон альфа-2b
человека, и штамм
Escherichia Coli BDEES4 –
продуцент
рекомбинантного
интерферона альфа-2b
патент
Патент РФ №
2260049,
Заявка №
2003122739/13,
24.07.2003
RU 2260049 С2
Дата публикации:
10.03.2005
1
патент
№2258081
RU 2258081 С1
2003136863/13
Дата публикации:
10.08.2005
1
37
5
О.М. Дурова,
Н.А. Пономаренко,
А.Г. Габибов
Воробьев И.И.,
Пономаренко Н.А.
Александрова Е.С.
Мурашов А.Н.,
Демин А.В.
Шустер А.М.
Мартьянов В.А.
Костромина Т.И.
Байрамашвили Д.И.
Габибов А.Г.
Мирошников А.И
Хитров А.Н.,
Ромаданова Н.Б.,
Огнева Е.А.,
Наумова Т.Е.,
Алекберова З.С.,
Воробьев И.И.,
Габибов А..Г,
Пономаренко Н.А.,
Сучков С.В.
Габибов А.Г.
Пономаренко Н.А.
Воробьев И.И.
Демин А.В.
Мартьянов В.А.
Шустер А.М.
Баирамашвили Д.И.
Мирошников А.И.
Габибов А.Г.
Пономаренко Н.А.
Воробьев И.И.
Демин А.В.
Мартьянов В.А.
Шустер А.М.
Баирамашвили Д.И.
Мирошников А.И.
38
39
человека
Рекомбинантная
плазмидная ДНК pES6-1,
кодирующая полипептид
интерферон бета-1b
человека, и штамм
Escherichia Coli BDEES6продуцент
рекомбинантного
интерферона бета-1b
человека
Catalytic activity of
autoantibodies toward myelin
basic protein correlates with
the scores on the multiple
sclerosis expanded disability
status scale.
патент
№2261913
RU 2261913 С1
2004100722/13
Дата публикации:
10.10.2005
статья
6
Immunol Lett.
2006. Т. 103. № 1 С.
45-50.
1
40
Autoantibodies from MS
patients and EAE developing
mice exhibit site-specific
cleavage of myelin basic
protein. //
статья
Proc. Natl. Acad.
Sci. USA, 2006. V.
103. № 2, P.281286.
6
41
Каталитические
аутоантитела - новый
молекулярный инструмент
в кардиологии и
офтальмологии.
статья
Терапевтический
архив, 2006, №11,
стр.70-76
7
Габибов А.Г.
Пономаренко Н.А.
Воробьев И.И
Демин А.В
Мартьянов В.А.
Шустер А.М.
Баирамашвили Д.И.
Мирошников А.И
N.A. Ponomarenko,
O.M. Durova,
I.I. Vorobiev,
A.A. Belogurov,
G.B. Telegin,
S.V. Suchkov,
V.K. Misikov,
H.C. 3rd Morse,
A.G. Gabibov.
N. A. Ponomarenko,
O. M. Durova, I. I.
Vorobiev, A. A.
Belogurov, A. G.
Petrenko, G. B.
Telegin, S. V.
Suchkov, V. K.
Misikov, S. L.
Kiselev, M. A.
Lagarkova, V. M.
Govorun, M. V.
Serebryakova, B.
Avalle, P. Tornatore,
A. Karavanov, H. C.
Morse III, D. Thomas,
A. Friboulet, A. G.
Gabibov.
К.А. Мальцев, А.Н.
Хитров, О.Ю.
Введенская, Н.А.
Пономаренко, М.А.
Исаева, М.В.
Кимова,
Е.Б.Третьяк, З.С.
Шогенов, З.С.
Алекберова, А.Г.
42
Каталитические
аутоантитела как новый
молекулярный инструмент
в ревматологической
практике.
статья
Терапевтический
архив, 2006, №6,
стр.59-66.
8
43
Catalytic autoantibodies in
clinical autoimmunity and
modern medicine.
статья
Autoimmun Rev.
2006, №(5) p. 324330
7
44
Induction of a proteintargeted catalytic response in
autoimmune prone mice:
antibody-mediated cleavage
of HIV-1 glycoprotein
GP120.
статья
Biochemistry. 2006 7
Jan 10;45(1):324330.
45
Феномен
статья
антителоопосредованного
катализа при
аутоиммунном миокардите.
46
Anti-idiotypic antibody
mimics proteolytic function
of parent antigen.
статья
Молекулярная
медицина, 2006,
№1, с.36-41.
6
Biochemistry.
2007, v. 46, №(50),
p. 14598-14609.
12
Габибов, С.В.
Сучков.
А.Н. Хитров,
К.А. Мальцев,
О.Ю. Введенская,
Н.А. Пономаренко,
М.А. Исаева,
М.В. Кимова,
Е.Б.Третьяк,
З.С. Шогенов,
З.С. Алекберова,
А.Г. Габибов,
С.В. Сучков
Gabibov A.G.,
Ponomarenko N.A.,
Tretyak E.B.,
Paltsev M.A.,
Suchkov S.V.
Ponomarenko N.A.,
Vorobiev I.I.,
Alexandrova E.S.,
Reshetnyak A.V.,
Telegin G.B.,
Khaidukov S.V.,
Avalle B.,
Karavanov A.,
Morse H.C. 3rd,
Thomas D.,
Friboulet A.,
Gabibov A.G.
Калинина Е.В.,
Воробьев И.И.,
Шогенов З.С.,
Пономаренко Н.А.,
Земцова М.Е.,
Дурова О.М.,
Палеев Ф.Н.,
Кекенадзе Н.Н.,
Габибов А.Г.,
Гнучев Н.В.,
Джанашия П.Х.,
Мальцев К. А.,
Сучков С.В.
Ponomarenko N.A.,
Pillet D.,
Paon M.,
47
Routes to covalent catalysis
by reactive selection for
nascent protein
nucleophiles.//
статья
J Am Chem Soc.
2007; v. 129,
№(51), p. 1617516182.
8
48
Механизмзависимая
селекция библиотек генов
иммуноглобулинов для
получения ковалентных
биокатализаторов.//
статья
Доклады
Академии Наук,
2007, т. 415, №2, с.
268-272.
5
49
Антителоопосредованный
протеолиз
ассоциированных с
миелином белков как
новый механизм контроля
за процессами
демиелинизации при
рассеянном склерозе.//
К вопросу о субстратной
специфичности
каталитических
аутоантител при
нейродегенеративных
процессах. //
статья
Вестник РАМН,
2007, №7, с. 32-36.
5
статья
Доклады
Академии Наук,
2007, т.413, №3, с.
408–411.
4
50
Vorobiev I..I,
Smirnov I.V.,
Adenier H.,
Avalle B.,
Kolesnikov A.V.,
Kozyr A.V.,
Thomas D.,
Gabibov A.G.,
Friboulet A.
Reshetnyak A.V.,
Armentano M.F.,
Ponomarenko N.A.,
Vizzuso D.,
Durova O.M.,
Ziganshin R.,
Serebryakova M.,
Govorun V.,
Gololobov G.,
Morse H.C .3rd,
Friboulet A.,
Makker S.P.,
Gabibov A.G.,
Tramontano A.
А.В.Решетняк,
М.Ф.Арментано,
Г.С.Морзе,
А.Фрибуле,
С.П.Маккер,
А.Трамонтано,
В.Д.Кнорре,
А.Г.Габибов,
Н.А.Пономаренко.
С.В. Сучков
О.Ю. Введенская,
И.В. Вострикова,
А.Г. Габибов,
М.В. Кимова,
Ю.А. Бурдакова,
Н.А. Пономаренко,
М.А. Пальцев.
Белогуров А.А.,
Куркова И.Н.,
Мисиков В.К.,
Сучков С.В.,
Телегин Г.Б.,
Алехин А.И.,
51
Перспективы создания
отечественных генноинженерных препаратов
для медицины. Растан –
первый отечественный
рекомбинантный гормон
роста человека.//
статья
Проблемы
эндокринологии,
2007, т. 53, №2 с.
19-24
6
52
Экспрессия человеческого
сывороточного альбумина
в метилотрофных дрожжах
Pichia Pastoris и его
структурнофункциональный анализ.
Recognition and degradation
of myelin basic protein
peptides by serum
autoantibodies: novel
biomarker for multiple
sclerosis.
статья
Биоорганическая
химия, 2008,
34(1):56-62.
7
статья
J Immunol. 2008,
v. 180, №2, p.
1258-1267.
10
54
Антиидиотипический
подход для получения
антитела-протеазы.
статья
Доклады
Академии Наук,
(2008), т.420, №1,
с. 1-4.
4
55
Высокоэффективный
процесс получения
рекомбинантного
статья
Биотехнология,
(2008) ) №4, с.4354.
12
53
Гончаров Н.Г.,
Кнорре В.Д.,
Габибов А.Г.
Пономаренко Н.А.
А.Г.Габибов,
Н.А.Пономаренко,
И.И.Воробьев,
Д.И.Баирамашвили,
В.Д.Кнорре,
А.М.Шустер,
В.А.Мартьянов,
И.К.Крылов,
В.А.Бурмистров,
И.И.Дедов,
А.И.Мирошников.
Т.В. Бобик,
И.И. Воробьев,
Н.А. Пономаренко,
А.Г. Габибов,
А.И. Мирошников.
Belogurov A.A. Jr,
Kurkova I.N.,
Friboulet A.,
Thomas D.,
Misikov V.K.,
Zakharova M.Y.,
Suchkov S.V.,
Kotov S.V.,
Alehin A.I.,
Avalle B.,
Souslova E.A.,
Morse H.C. 3rd,
Gabibov A.G.,
Ponomarenko NA.
Смирнов И.В.,
Воробьев И.И.,
Фрибуле А.,
Аваль Б.,
Тома Д.,
Кнорре В.Д.,
Габибов А.Г.
Пономаренко Н.А.
Бобик Т.В.,
Воробьев И.И.,
Пономаренко Н.А.,
56
человеческого
сывороточного альбумина
и его структурнофункциональный анализ.
Препарат рекомбинантного
человеческого
сывороточного альбумина
и способ его получения
Габибов А.Г.,
Мирошников А.И.
патент
№ 2337966
(2008.11.10)
RU 2006128449
2006128449/13
1
57
Рекомбинантная
плазмидная ДНК,
кодирующая
последовательность белка
фактора VII человека,
линии клеток BHK/F7,
трансформированная
плазмидной ДНК
патент
№ 2337965
(2008.11.10)
RU 2006128448
2006128448/13
1
58
Strategies for induction of
catalytic antibodies toward
HIV-1 glycoprotein gp120 in
autoimmune prone mice.
статья
Mol. Immunol.
(2009)
Nov;47(1):87-95
9
59
Сайт-специфическая
деградация основного
белка миелина
протеасомой.
статья
Доклады
Академии Наук,
(2009) т. 425, №2,
с. 251-255.
5
60
Антитела-антидоты для
нейтрализации
фосфорорганических
соединений.
статья
Доклады
Академии Наук,
(2009) т.425, №4,
с. 549-552
4
Воробьев АИ
Мирошников АИ
Габибов АГ
Воробьев ИИ
Костромина ТИ
Пономаренко НА
Бобик ТВ
Ажигирова МА
Карякин АВ
Коротаев ГК
Воробьев АИ
Мирошников АИ
Габибов АГ
Воробьев ИИ
Пономаренко НА
Шамборант ОГ
Шустер АМ
Мартьянов ВА
O. M. Durova,
I. I. Vorobiev,
I. V. Smirnov,
A. V. Reshetnyak,
G. B. Telegin,
O. G. Shamborant,
N. A. Orlova,
D. D.Genkin,
A. Bacon,
N. A. Ponomarenko,
A. Friboulet,
A. G. Gabibov.
Белогуров А.А.,
Пономаренко Н.А.,
Говорун В.М.,
Габибов А.Г.
Бачева А.В.
Куркова И.Н.,
Решетняк А.В.,
Дурова О.М.,
Кнорре В.Д.,
Трамонтано А.,
Фрибуле А.,
61
Suppression of ongoing
experimental allergic
encephalomyelitis in DA rats
by novel peptide drug,
structural part of human
myelin basic protein 46-62.
статья
Autoimmunity.
(2009);42(4):362-4.
3
62
RNA-hydrolyzing activity of
human serum albumin and its
recombinant analogue.
статья
Bioorg Med Chem
Lett. (2010) Feb
15;20(4):1427-31.
5
63
Диагностическое и
патогенетическое значение
феномена
сайтспецифичности
антител-протеаз при
рассеянном склерозе.
статья
Вестник
Российской
Академии
медицинских
наук, 2010.-N 4.С.8-15.
8
64
Функциональная
деградация основного
белка миелина.
Протеомный подход.
статья
Биоорг.химия
2011,37(1): 45-54
10
65
Экспрессия каталитических статья
антител в эукариотических
системах.
Молекулярная
биология, (2011)
т.45, №1, с. 86-95.
10
Пономаренко Н.А.,
Габибов А.Г.,
Смирнов И.В.
Belogurov AA Jr,
Zargarova TA,
Turobov VI,
Novikova NI,
Favorova OO,
Ponomarenko NA,
Gabibov AG.
Gerasimova YV,
Bobik TV,
Ponomarenko NA,
Shakirov MM,
Zenkova MA,
Tamkovich NV,
Popova TV,
Knorre DG,
Godovikova TS.
Салафет О. В.,
Рузина Н. Д.,
Пономаренко Н. А.,
Фрибуле А.,
Кимова М. В.,
Шмидт Т. Е.,
Габибов А. Г.,
Морс Х. К.,
Пальцев М. А.,
Сучков С. В.
А. В. Бачева,
А. А. Белогуров,
Е. С. Кузина,
М. В. Серебрякова,
Н. А. Пономаренко,
В. Д. Кнорре,
В. М. Говорун,
А. Г. Габибов.
Захаров А.В.,
Смирнов И.В.,
Серебрякова М.В.,
Дронина М.А.,
Казначеева А.В.,
Куркова И.Н.,
Белогуров А.А.,
Friboulet A.,
Пономаренко Н.А.,
66
Design of targeted B cell
killing agents.
статья
PLoS One.
2011;6(6):e20991
10
67
Combinatorial antibody
статья
library from multiple
sclerosis patients reveals
antibodies that cross-react
with myelin basic protein and
EBV antigen.
FASEB J. 2011
Dec;25(12):421121.
11
Proc Natl Acad Sci
U S A. 2011 Sep
20;108(38):159549.
6
68
Reactibodies generated by
kinetic selection couple
chemical reactivity with
favorable protein dynamics.
статья
Габибов А.Г.,
Бобик Т.В.
Stepanov AV,
Belogurov AA Jr,
Ponomarenko NA,
Stremovskiy OA,
Kozlov LV,
Bichucher AM,
Dmitriev SE,
Smirnov IV,
Shamborant OG,
Balabashin DS,
Sashchenko LP,
Tonevitsky AG,
Friboulet A,
Gabibov AG,
Deyev SM.
Gabibov AG,
Belogurov AA Jr,
Lomakin YA,
Zakharova MY,
Avakyan ME,
Dubrovskaya
VV, Smirnov
IV, Ivanov AS,
Molnar AA,
Gurtsevitch VE,
Diduk SV,
Smirnova KV,
Avalle B,
Sharanova SN,
Tramontano A,
Friboulet A,
Boyko AN,
Ponomarenko NA,
Tikunova NV.
Smirnov I ,
Carletti E,
Kurkova I,
Nachon F,
Nicolet Y,
Mitkevich V ,
Débat H,
Avalle B,
Belogurov A,
Kuznetsov N,
Reshetnyak A,
Masson P,
Tonevitsky A,
Ponomarenko N,
Makarov A,
Friboulet A,
Tramontano A,
Gabibov A.
О присвоении Пономаренко Наталье Александровне ученого звания профессора по
специальности 03.00.03 – Молекулярная биология
Пономаренко Наталья Александровна замещает в Учреждении Российской Академии
Наук Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А.
Овчинникова РАН (ИБХ РАН), г. Москва, должность ведущего научного сотрудника с
2009 г.
Пономаренко Наталья Александровна, 1962 г. рождения, Гражданка РФ, доктор
биологических наук с 2009 г., диссертацию защитила в ИБХ РАН, научный стаж – 26 лет,
опубликована 61 статья в ведущих научных изданиях, из них 13 – после защиты
докторской диссертации. Имеет 7 патентов.
Среди опубликованных работ:
Tchurikov NA, Ponomarenko NA. Detection of DNA domains in Drosophila, human, and plant
chromosomes possessing mainly 50- to 150-kilobase stretches of DNA. //Proc Natl Acad Sci U S
A. 1992;89(15):6751-5.
N. A. Ponomarenko, O. M. Durova, I. I. Vorobiev, et al. Autoantibodies from MS patients and
EAE developing mice exhibit site-specific cleavage of myelin basic protein. // Proc. Natl. Acad.
Sci. USA, 2006. V. 103. № 2, P.281-286.
Stepanov AV, Belogurov AA Jr, Ponomarenko NA, et al. Design of targeted B cell killing
agents. PLoS One. 2011;6(6):e20991. Epub 2011 Jun 6.
Smirnov I , Carletti E, Kurkova I, Nachon F, Nicolet Y, Mitkevich V , Débat H, Avalle B,
Belogurov A, Kuznetsov N, Reshetnyak A, Masson P, Tonevitsky A, Ponomarenko N,
Makarov A, Friboulet A, Tramontano A, Gabibov A. Reactibodies generated by kinetic selection
couple chemical reactivity with favorable protein dynamics. Proc Natl Acad Sci U S A. 2011 Sep
20;108(38):15954-9.
Пономаренко Наталья Александровна работает в Институте биоорганической
химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН (ИБХ РАН) с 1997
года.
С 1986 года, после окончания МГУ им. М.В. Ломоносова, она работала в Институте
молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН (ИМБ РАН) сначала в должности
стажера-исследователя, младшего научного сотрудника, а затем – научного сотрудника.
Исследования проводились сначала в лаборатории биосинтеза нуклеиновых кислот (зав.
академик Г.П. Георгиев), затем в лаборатории организации генома (зав. Н.А. Чуриков). В
1993 году Н.А. Пономаренко защитила в ИМБ РАН кандидатскую диссертацию на тему:
«Изучение транскрипции локуса cut Drosophila melanogaster» по специальности
«молекулярная биология». В 1996 году она была аттестована на должность старшего
научного сотрудника. В 1997 году она была переведена в ИБХ РАН во вновь
организованную лабораторию биокатализа (зав. Член-корр. А.Г. Габибов). Развивая новую
область исследований, Н.А. Пономаренко в 2008 году подготовила и защитила
докторскую диссертацию на тему « Каталитические антитела – протеазы» по
специальности 03.00.03 – молекулярная биология. В 2009 году она была переведена на
должность ведущего научного сотрудника.
Первые 10 лет работы Н.А. Пономаренко были посвящены изучению молекулярногенетических механизмов и структурных особенностей генома эукариот. Было обнаружен
альтернативный сплайсинг РНК в локусе cut D. Melanogaster, охарактеризован новый
ретротранпозон дрозофилы - « репейник», изучены особенности структуры генома
эукариот – «форум домены», показана возможность образования параллельных РНКдуплексов in vivo.
В последующие годы основная область научных интересов Н.А. Пономаренко –
каталитические антитела (абзимы). Это новый тип биокатализаторов, представляющий
интерес как с точки зрения механизма их возникновения и роли в функционировании
иммунной системы организма, так и как потенциальные терапевтические агенты.
В
ходе
исследований,
проведенных
Н.А.
Пономаренко,
впервые
продемонстрирована антиген-специфическая каталитическая активность аутоантител к
основному белку миелина (ОБМ) у больных рассеянным склерозом и модельных
животных, коррелирующая с тяжестью заболевания. Определены 6 преимущественных
сайтов расщепления молекулы ОБМ абзимами, и оценены кинетические параметры данной
реакции. Обнаруженная связывающая и сайт-специфическая каталитическая активность
анти-ОБМ антител при РС и других, мимикрирующих, нейродегенеративных заболеваниях
позволяет проводить разработку новых дифференциальных методов диагностики и
эффективного лечения данной патологии.
Кинетические
исследования
специфичности
протеолитического
антиидиотипического антитела 6B8E12 к субтилизину Карлсберг, проведенные под
руководством Н.А. Пономаренко, показали общее сходство данного абзима со
специфичностью
исходного
фермента.
Экспрессия
рекомбинантного
антиидиотипического антитела в виде одноцепочечного антитела и демонстрация его
каталитической
активности
явилась
наиболее
убедительным
доказательством
«абзиматической» природы обнаруженной активности.
Важным
достижением
исследований
Н.А.Пономаренко
была
демонстрация
возникновения протеолитического иммунного ответа на антиген, при одновременной
индукции аутоиммунного заболевания.. Было показано, что полученные с помощью такого
подхода антитела к поверхностному антигену ВИЧ-1 gp120 способны специфически
гидролизовать полноразмерный гликозилированный gp120, и установлен преимущественный
сайт гидролиза gp120 Pro493-Leu494, находящийся в константной области белка.
Принципиально другим подходом для получения абзимов стал разработанный под
руководством Н.А. Пономаренко метод, основанный на селекции фагдисплейных
библиотек
вариабельных
фрагментов
генов
иммуноглобулинов
человека
с
использованием различных антигенов, с последующей экспрессией полноразмерных
рекомбинантных антител или их Fab фрагментов в клетках эукариот, и их дальнейшем
изучением. Таким образом было получено рекомбинантное антитело человека, способное
гидролизовать пестицид парооксон.
Результаты работ Н.А. Пономаренко способствуют более глубокому пониманию путей
получения
искусственных
биокатализаторов.
Разработанные
подходы
могут
быть
использованы для индукции протеолитических антител, расщепляющих различные белковые
субстраты. Оригинальные методы анализа ферментативной активности протеолитических
антител могут быть использованы для изучения различных биокатализатиров.
Наряду с этими исследованиями Н.А. Пономаренко проводятся биотехнологические
работы по созданию штаммов- и клонов-продуцентов различных терапевтических препаратов,
например,
соматотропина
колониестимулирующего
(торговая
фактора
марка
(торговая
марка
«Растан»),
гранулоцитарного
«Нейпомакс»)
человеческого
сывороточного альбумина, факторов свертываемости крови и др. Она является автором 1-го
международного и 6-ти российских патентов.
Н.А. Пономаренко неоднократно выступала с докладами на отечественных и
зарубежных форумах.
Н.А. Пономаренко неоднократно являлась руководителем грантов РФФИ.
Н.А. Пономаренко много времени уделяет подготовке научных кадров, выступает с
лекциями на школах для студентов и молодых ученых.
Под руководством Н.А. Пономаренко успешно защищено 6 диссертационных работ
на соискание степени кандидата наук и выполнено более 20 студенческих курсовых и
дипломных работ.