отзыв Асланяна М.М.
advertisement
Отзыв на автореферат диссертации Нефедовой Лидии Николаевны «Генетический контроль транспозиции и эволюция эррантивирусов у Drosophila», представленный на соискание ученой степени доктора биологических наук по специальностям: 03.02.07генетика Диссертационная работа Л.Н. Нефедовой посвящена изучению наиболее сложных по структурной генетических организации элементов и (МГЭ), функциональной а именно, активности форм мобильных ДКП-ретротранспозонов Drosophila melanogaster (gypsy (мдг4) и ZAM). Их можно считать переходными формами между МГЭ и вирусами. МГЭ открыты в семидесятых годах 20-го века как в геномах прокариот, так и эукариот. Они являются ключевыми факторами в определении нестабильности генома, участвуя в процессах репарации генетических повреждений, рекомбинации и мутагенеза. Продолжая традиционные для кафедры генетики исследования генетического контроля мутационного процесса и молекулярных механизмов активности МГЭ, диссертант определил основную цель своей работы механизмов интеграции, генетического контроля функциональной – транспозиции, исследование филогении и процессов молекулярной доместикации эррантивирусов Drosophila melanogaster. Для выполнения поставленной биплазмидную систему активность цели диссертант in vivo в клетках разработал экспериментальную Esсherichia coli, изучил интегразы ретротранспозона-ретровируса gypsy специфичную в отношении длинного концевого повтора gypsy и показал точную эксцизию ретротранспозона, получил рекомбинантную интегразу gypsy, способную узнавать ДКП других ДКП- ретротранспозонов группы gypsy. Филогенетичекий анализ D. melanogaster, в геноме которого насчитывается 36 семейств ДКП-ретротранспозонов, 27 из которых относят к группе gypsy, показал, что группа gypsy биологически неоднородна и делится на три подгруппы на основании анализа последовательностей МГЭ. Установлено, что эррантивирусы, в отличие от ретровирусов позвоночных, проявляют специфичность в отношении выбора ДНК-мишени, согласно которой эррантивирусы можно разделить на три группы: gypsy, ZAM и Idefix. Впервые обнаружено, что специфичность встраивания этих ретроэлементов коррелирует со структурными особенностями ДНК мишени: способностью к изгибанию ДНК, способностью В-формы ДНК переходить в А-форму и деформируемостью при взаимодействии с интегразой, а также с определенным строением концевых последовательностей ДКП, не характерным для ретровирусов позвоночных. 1 Полученные в работе данные позволяют по-новому взглянуть на эволюцию генома эукариот в свете коэволюции с его мобильным компонентом и могут быть использованы в дальнейшем для исследования вопросов генетического контроля мобильных элементов, интеграции и связанного с молекулярной эволюции систем генообразования, доместикацией генов ретроэлементов у эукариот. С использованием методов биоинформатики разработана новая классификация семейств ДКП- ретротранспозонов. Принципиальное значение, на наш взгляд, имеет аргументированный вывод, что в процессе эволюции доместицированный ген gag эрррантовирусов претерпел молекулярное изменение, утратив первоначальную свою функцию, и стал компонентом иммунного ответа. В целом работа выполнена с использованием классических и современных молекулярно-генетических и биоинформативных методов. Выводы диссертации адэкватны полученным экспериментальным данным. Результаты исследования успешно внедрены в разработанный диссертантом лекционный курс «Современные методы исследования в генетике», читаемый на кафедре генетики Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова и в других университетах страны. Материалы диссертационной работы опубликованы в ведущих отечественных и иностранных научных журналах и монографиях. Автореферат свидетельствует о высокой профессиональной подготовке диссертанта. Теоретическая и практическая значимость работы не вызывает сомнений. Считаю, что диссертационная работа «Генетически контроль транспозиции и эволюция эррантивирусов Drosophila» полностью отвечает требования ВАК РФ к докторским диссертациям, а еѐ автор Нефедова Л. Н. достойна присвоения ученой степени доктора биологических наук по специальности 03.02.07 – генетика. Асланян Марлен Мкртичович Д.б.н., профессор кафедры генетики 16/02/ 2015 г. ФГБОУ ВПО «Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова». Москва, Ленинские горы 1, стр.12, Биологический факультет. Телефон 8(499) 134 64 33, e.mail:marlen32@mail.ru Подпись Асланяна Марлена Мкртичевича заверяю 2
