КАФЕДРА МОЛЕКУЛЯРНОЙ МЕДИЦИНЫ

advertisement
Федеральное государственное автономное образовательное учреждение
высшего профессионального образования
«МОСКОВСКИЙ ФИЗИКО-ТЕХНИЧЕСКИЙ ИНСТИТУТ
(государственный университет)»
УТВЕРЖДАЮ
Проректор по учебной работе
_______________О.А.Горшков
«____»______________ 2014 г.
ФАКУЛЬТЕТ БИОЛОГИЧЕСКОЙ И МЕДИЦИНСКОЙ ФИЗИКИ
КАФЕДРА МОЛЕКУЛЯРНОЙ МЕДИЦИНЫ
ПРОГРАММА
вступительных испытаний поступающих на обучение по программам
подготовки научно-педагогических кадров в аспирантуре
по специальной дисциплине
НАПРАВЛЕНИЕ ПОДГОТОВКИ: 06.06.01 БИОЛОГИЧЕСКИЕ НАУКИ
НАПРАВЛЕННОСТЬ (ПРОФИЛЬ): 03.01.02 БИОФИЗИКА
Форма проведения вступительных испытаний:
Вступительные экзамены проводятся в устной форме. Для подготовки
ответов поступающий использует экзаменационные листы.
ЗАВ.КАФЕДРОЙ
(подпись)
“
“
2014 года.
профессор В.М. Говорун
(фамилия)
1. БИОНАНОТЕХНОЛОГИЯ.
Особенности биомеханизмов субмикрометрового и молекулярного масштабов.
Акустические биосенсоры. Атомно-силовая микроскопия. Оптические биосенсоры.
Поверхностный плазмонный резонанс. Биосенсоры на основе измерения полного
электрического
сопротивления.
Миниатюрные
электрохимические
датчики.
Диагностические биосенсоры. Термодинамические потенциалы дисперсных систем.
Фазовые переходы в дисперсных системах. Процессы переноса в многофазных
дисперсных системах. Дизайн микрофлюидных систем. Методы литографии.
Оборудование для микро и нанофабрикации. Технологии чистых помещений.
Технологические схемы создания микрофлюидных систем.
2. БИОИНФОРМАТИКА.
Технологии чтения биологических текстов. Представление геномной информации.
Геномное картирование. Сборка геномов de novo. Биоинформатический анализ массспектрометрической информации в протеомике. Обработка транскриптомных данных.
Визуализация экспериментальных данных в постгеномной биологии. Статистический
анализ геномных, протеомных и транскриптомных данных
3. МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОЛОГИЯ.
Современные представления о строении живой клетки. Репликация ДНК у бактерий.
Репликация ДНК у эукариот. Репарация ДНК. Мобильные элементы генома. Регуляция
транскрипции у про- и эукариот. Структура и функция рибосом и биосинтез белка.
Строение и биологические функции белков и пептидов. Методы исследования в
молекулярной биологии.
4. НАНОТЕХНОЛОГИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ БИОПОЛИМЕРОВ.
Растворы биополимеров. Структура белков. Структура нуклеиновых кислот. Методы
детектирования одиночных молекул. Сканирующая зондовая микроскопия биополимеров.
Электронная микроскопия. Биологические чипы. Тенденции развития бионанотехнологий.
5. ОСНОВЫ БИОИНЖЕНЕРИИ.
Основные тенденции развития современной биоинженерии. Генетическая инженерия.
Инструменты генетической инженерии. Векторные системы. Методы генетической
инженерии. Белковая инженерия. Конструирование рекомбинантных белков. Системы
экспрессии рекомбинантных генов. Методы выделения и очистки рекомбинантных
белков. Метаболическая инженерия. «Обратная» генетика. Рекомбинационная инженерия.
Метаболомика.
6. ПРОТЕОМИКА И МЕТАБОЛОМИКА.
Протеомика как часть современной системной биологии. Электрофоретический анализ
белков. Хроматографический анализ белков. Химико-биологическая масс-спектрометрия.
Технологическая база. Практическое применение протеомики. Химико-биологическая
масс-спектрометрия. Методы анализа смесей белков и пептидов. Анализ
посттрансляционных модификаций белков и пептидов. Метаболомика. Методы и базы
данных. Метаболомика в медицине.
7. ФИЗИЧЕСКИЕ ОСНОВЫ БИОМЕДИЦИНСКИХ ТЕХНОЛОГИЙ.
Спектроскопия ядерного магнитного резонанса. Приборы и оборудование. Основные
физические принципы МРТ. Биохимически и биофизически ориентированные методы
магнитно-резонансной диагностики. Основы рентгеноструктурного анализа. Предмет и
методы. Применение рентгеновских лучей. Практические рекомендации.
ЛИТЕРАТУРА
1. Льюин Б. Гены. Москва, Бином. Лаборатория знаний. 2011
2. Молекулярная биология. Структура и биосинтез нуклеиновых кислот // Под ред.
А.С. Спирина. М.: Высш. шк. 1990
3. Microarray Analysis. Редактор Dr. M. Schena. Издательство J. Wiley & Sons (New
York)
4. DNA Microarrays: A Practical Approach. Редактор M. Schena. Издательство Oxford
University Press
5. A Beginner's Guide to Microarrays. Редактор E. M. Blalock. Издательство University
of Kentucky Medical Center, Lexington, USA
6. Proteomics. Ed. Timothy Palzkill 2002 Kluwer Academic Publishers, New York, Boston,
Dordrecht, London, Moscow
7. INTRODUCTION TO PROTEOMICS. Tools for the New Biology. Ed. DANIEL C.
LIEBLER, 2002 Humana Press Inc.
8. Л.И. Патрушев. Искусственные генетические системы. Том1. Генная и белковая
инженерия. Москва, «Наука», 2004 г., 526 стр.
9. Gene Therapy Technologies, Applications and Regulations. Ed. Anthony Meager. 1999
John Wiley & Sons, Ltd., 401 стр.
10. Лебедев А.Т. Масс-спектрометрия в органической химии. Москва. 2003 год
11. Hofstadler S. A., Sampath R., Blyn L. B., Eshoo M. W., Hall T. A., Jiang Yu., Drader J.
J., Hannis J. C., Sannes-Lowery K. A., Cummins L. L., Libby B., Walcott D. J., Schink
A., Massire C., Ranken R., Gutierrez J., Manalili S., Ivy C., Melton R., Levene H.,
Barrett-Wilt G., Li F., Zapp V., White N., Samant V., McNeil J. A., Knize D., Robbins
D., Rudnick K., Desai A., Moradi E., Ecker D. J. “TIGER: the universal biosensor”.
International Journal of Mass Spectrometry v. 242 (2005), p. 23–41
12. Mass spectrometry basics. Eds. C.G.Herbert, R.A.W. Johnstone. 2003 CRC Press.
13. Antibody Phage Display. Methods and Protocols. Edited by Philippa M. O’Brien and
14. Robert Aitken. 2002 Humana Press Inc.
15. В.Зенгер. Принципы организации нуклеиновых кислот. Москва, «Мир», 1987.
16. Альбертс Б., Брей Д., Льюис Дж., «Молекулярная биология клетки» в 3 т., Москва,
Мир, 1994.
17. Ченцов Ю.С., «Введение в клеточную биологию», Москва, «Академика», 2004.
18. Mount D.W. “Bioinformatics. Sequence and Genome Analysis:” Cols Spring Harbor
Laboratory Press. 2001.
19. Дурбин Р., Эдди Ш., Крот А., Митчисон Г. «Анализ биологических
последовательностей». Институт компьютерных исследований. R&C Dynamics.
Москва. Ижевск. 2006.
20. Pop M., Shotgun Sequence Assembly, Advanced in Computers. 60 (2004), 193-248.
Программу составил
д.б.н., профессор Лазарев В.Н.
Скачать