Отчет_ЦКП за 2014г. - С.Ж. Асфендияров атындағы Қазақ

С.Ж.АСФЕНДИЯРОВ АТЫНДАҒЫ
ҚАЗАҚ ҰЛТТЫҚ МЕДИЦИНА
УНИВЕРСИТЕТІ
КАЗАХСКИЙ НАЦИОНАЛЬНЫЙ
МЕДИЦИНСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ
С.Д.АСФЕНДИЯРОВА
НИИ ФПМ ИМЕНИ Б.А. АТЧАБАРОВА
ЦЕНТР КОЛЛЕКТИВНОГО ПОЛЬЗОВАНИЯ
ОТЧЕТ
Отчёт по научной лаборатории «Центр Коллективного Пользования» за 2014г
Научная лаборатория Центр Коллективного Пользования образована на основании
Приказа Министерства Здравоохранения Республики Казахстан № 134 от 14.03.2011г.
Торжественное открытие ЦКП состоялось 30 октября 2012 г. Общая стоимость
оборудования, закупленного для лаборатории, составляет 608 млн тг. Основная цель
деятельности Центра – формирование лабораторной базы для проведения современных
биомедицинских исследований.
Новый качественный уровень исследований и разработок возможен только на
современной экспериментальной базе, в основе которой – исследовательские
многофункциональные комплексы, позволяющие существенно расширить возможности
экспериментов и интенсифицировать процесс их проведения. Повышение эффективности
использования исследовательских комплексов должно обеспечиваться за счёт их высокой
загрузки, что успешно осуществляется в специально создаваемых центрах коллективного
пользования научным оборудованием (ЦКП).
Центры коллективного пользования решают основные задачи:
• обеспечивают возможность проведения исследований широкому кругу учёных и
научных коллективов на современном и дорогостоящем оборудовании;
• организуют возможности использования оборудования последнего поколения;
• реализация научных программ и проектов в области высокопроизводительного
типирования ДНК, транскрипционному профилированию тканей и поиску новейших
биомаркеров для ранней диагностики и прогноза генетически обусловленных
заболеваний;
• проведение совместных научных исследований с отечественными и зарубежными
университетами и научными центрами;
• создание условий для коммерциализации результатов научной и (или) научнотехнической деятельности, в целях привлечения инвестиций в сектор высоких технологий
в практическое здравоохранение;
Штаты ЦКП на 2014-2015 учебный год
№
Ф.И.О. сотрудников
Должность
Занятые ставки
Заведующая лабораторией
1.
Оразгалиева Мадина Гиниятовна
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
9.
10.
11.
12.
Амирбеков Адай Серикханович
Бигазинова Раушан Канатовна
Карабекова Айжан Нуржигитовна
Качиева Зульфия Сабирқызы
Нурмолдин Шалкар Музабекович
Манап Алия Абайкызы
Нусупбекова
Алия
Мухаметжановна
Оразгалиева Мадина Гиниятовна
Салимбекова
Салтанат
Кенесхановна
Смагул Айбек Оразакулы
Туханова Нур Байбактыевна
Ставки
1,0
Младший научный сотрудник
Младший научный сотрудник
Младший научный сотрудник
Младший научный сотрудник
Младший научный сотрудник
лаборант
1,25
1,0
1,0
0,5
1,25
0,5
Младший научный сотрудник
1,5
Старший научный сотрудник
0,5
1,5
лаборант
Младший научный сотрудник
Старший лаборант
0,5
0,5
Страница 1 из 11
С.Ж.АСФЕНДИЯРОВ АТЫНДАҒЫ
ҚАЗАҚ ҰЛТТЫҚ МЕДИЦИНА
УНИВЕРСИТЕТІ
КАЗАХСКИЙ НАЦИОНАЛЬНЫЙ
МЕДИЦИНСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ
С.Д.АСФЕНДИЯРОВА
НИИ ФПМ ИМЕНИ Б.А. АТЧАБАРОВА
ЦЕНТР КОЛЛЕКТИВНОГО ПОЛЬЗОВАНИЯ
ОТЧЕТ
Оборудование научной лаборатории «Центр коллективного пользования»:
MagMAX Express-96
Выделяет сверхочищенные нуклеиновые кислоты
Rotor-Gene Q (QIAGEN) и LightCycler Nano, 100 канальный ПЦР-амплификатор
Количественный ПЦР-анализ, определение вирусной нагрузки при инфекциях,
определение концентрации генетически-модифицированных
ингредиентов, оценка
уровня экспрессии генов
Генетический анализатор ViiA7
Абсолютный количественный анализ; относительный качественный анализ; SNP
генотипирование; определение точечных мутаций.
Генетический анализатор 3500XL
Секвенирование по методу Сенгера с целью поиска мутаций и SNP, целевое
ресеквенирование интересующих областей генома, анализ микросателитных маркеров
ДНК, идентификация личности, типирование микробных и вирусных геномов,
мультиплексный анализ
Биоанализатор Agilent 2100
анализатор построенный на базе технологии lab-on-a-chip (лаборатория на чипе), анализ
фрагментов рестрикции ДНК; анализ продуктов ПЦР, определение генетически
модифицированных
организмов,
установление
родства;
ранняя
диагностика
онкозаболеваний по теломеразе; количественное определение белков, определение уровня
экспрессии генов.
Высокоэффективный жидкостной хроматограф
Agilent 1260 в тандеме с
времяпролетным масс спектрометром Agilent 6224 TOF
Анализ отдельных
веществ в сложных смесях органических соединений – пищевых
продуктах, объектах окружающей среды, физиологических жидкостях, фармацевтических
препаратах, например, некоторые аминокислоты и липиды при болезнях обмена веществ.
Секвенатор последнего поколения Illumina MiSeq 500
Секвенирование с целью поиска мутаций и SNP, целевое ресеквенирование
интересующих областей генома, анализ микросателитных маркеров ДНК, идентификация
личности, типирование микробных и вирусных геномов, мультиплексный анализ
Микроскоп инвертированный Axio Vert F1
Предназначен для исследования в области клеточной биологии и цитогенетики.
Высокопроизводительная чип-система QuantStudio 12K Flex с роботизированной
станцией для пробоподготовки
Фрагментный анализ ДНК; SNP генотипирование; мультиплексная детекция и анализ;
цифровая ПЦР, количественная и качественная ПЦР в режиме реального времени;
изучение экспрессии генов.
Страница 2 из 11
С.Ж.АСФЕНДИЯРОВ АТЫНДАҒЫ
ҚАЗАҚ ҰЛТТЫҚ МЕДИЦИНА
УНИВЕРСИТЕТІ
КАЗАХСКИЙ НАЦИОНАЛЬНЫЙ
МЕДИЦИНСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ
С.Д.АСФЕНДИЯРОВА
НИИ ФПМ ИМЕНИ Б.А. АТЧАБАРОВА
ЦЕНТР КОЛЛЕКТИВНОГО ПОЛЬЗОВАНИЯ
ОТЧЕТ
Научные проекты на базе лаборатории ЦКП за 2014г
Лаборатория осуществляла работу по следующим проектам:
Внутривузовские:
№
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
Наименование темы
«Клинические, биохимические,
иммунологические, патоморфологические
и молекулярно-генетические особенности
возникновения, развития, течения и
исходов инфаркта миокарда в
казахстанской популяции»
«Разработка дифференцированного
подхода к антицитокиновой терапии при
ревамтоидном артрите на основе
молекулярно-генетических исследований,
профилактика ранней инвалидизации и
смертности»
«Мажорные гены болезни Альцгеймера»
«Выявление мутаций в опухолевых тканях
методом глубокого секвенирования на
секвенаторе нового поколения»
«Клиническая валидизация
фармакогенетической модели Франзена по
предсказанию ответа на монотерапию
метотрексатом у больных казахской
национальности с ревматоидным
артритом»
«Комплексное молекулярно-генетическое
исследование деградации сустава в
популяции человека»
Профилактика осложнений при
эндодонтическом лечении осложнённого
кариеса
Исследование роли экзосом в переносе
ионов тяжёлых металлов при
экзотоксикозе
Демиелинизирующие заболевания у детей
и молодых взрослых:
иммунопатогенетическая и клиникоинструментальная характеристика
Клинико-функциональные и
иммуногенетические особенности
патологии щитовидной железы при
метаболическом синдроме
Исследование уровня гормонов жировой
ткани у детей с абдоминальным
ожирением, как фактора риска
формирования метаболического синдрома
Сумма,
тыс.тенге
Руководитель
Култаев М.С., д.м.н., профессор,
зав.каф. интернатуры и резидентуры по
ВОП№1; Куандыков Е.У., д.м.н.,
профессор, зав.каф. молекулярной
биологии и генетики.
2 000
Шортанбаев А.А., д.м.н., профессор,
зав.каф. общей иммунологии.
2 000
Садуакасова К.З., д.м.н., профессор, зав.
кафедры психиатрии.
Кайдаров Б.К., д.м.н., проф., зав.каф.
Онкологии. Бейсембаева Ш.А., к.м.н.,
доцент кафедры клинико-лабораторной
диагностики
и
молекулярной
медицины.
Исина З.Б., к.м.н., доцент кафедры
клинической фармакологии.
2 000
2 000
2 000
Сейсенбаев А.Ш. (КазНМУ им. С.Д.
Асфендиярова), Лифшиц Г. (Sackler
Faculty of Medicine, Tel Aviv University,
Israel)
Баяхметова А.А. (КазНМУ им. С.Д.
Асфендиярова)
Жаксылыкова А.К. (КазНМУ им. С.Д.
Асфендиярова)
2 000
5 000
2 000
Идрисова Ж.Р. (КазНМУ им. С.Д.
Асфендиярова)
Аканов Ж.А. (КазНМУ им. С.Д.
Асфендиярова)
7 000
Хабижанов Б.Х. д.м.н., профессор
(КазНМУ им. С.Д. Асфендиярова)
2 000
28 000
Страница 3 из 11
С.Ж.АСФЕНДИЯРОВ АТЫНДАҒЫ
ҚАЗАҚ ҰЛТТЫҚ МЕДИЦИНА
УНИВЕРСИТЕТІ
КАЗАХСКИЙ НАЦИОНАЛЬНЫЙ
МЕДИЦИНСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ
С.Д.АСФЕНДИЯРОВА
НИИ ФПМ ИМЕНИ Б.А. АТЧАБАРОВА
ЦЕНТР КОЛЛЕКТИВНОГО ПОЛЬЗОВАНИЯ
ОТЧЕТ
Проект МОН РК:
№
1
Наименование темы
«Молекулярный анализ генетических дефектов
бета-клеточной функции и совершенствование
диагностики моногенного сахарного диабета в
казахской популяции
Руководитель
Сумма,
тыс.тенге
Нурбекова А.А. – профессор
кафедры эндокринологии
КазНМУ, д.м.н.
5 450
Общая сумма финансирования по проектам за 2014 год составила - 33 450 тыс. тенге
В рамках договора о предоставлении услуги с «Национальным центром
биотехнологии» (г. Астана) в 2014 году совместно с сотрудниками НЦБ был проведён
анализ SNP генотипированием на чип-системе Quant Studio 12K Flex. Сумма договора –
375 тыс. тенге.
Научные проекты на базе лаборатории ЦКП за 2015г
Лаборатория осуществляет работу по следующим проектам:
Внутривузовские:
№
1.
2.
3.
4.
Наименование темы
Руководитель
Сумма, тыс.тенге
Сравнительный анализ состава белков
и спектра микро РНК экзосом в крови
больных ревматоидным
артритом,раком молочной железы
инфарктом миокарда и остепорозом
Накисбеков Н.О.
18000
Габдулина Г.Х., Лифшиц Г.
18000
Рамазанова Б.А.
10000
Нугманова Ж.С.
15000
Определение степени
метилирования ДНК и целевых
генов, ответственных за развитие
остеопороза: первые генетикоэпидиологические исследования в
Казахстане.
Мониторинг резистентности
возбудителей внебольничных и
нозокоминальных инфекций к
антимикробным препаратам и
изучение его молекулярных
механизмов
Молекулярно-эпидемиологические и
клинические особеннности ВИЧ,
ВИЧ/ВГС, ВИЧ/ТБ- инфекций в г.
Алматы
Страница 4 из 11
С.Ж.АСФЕНДИЯРОВ АТЫНДАҒЫ
ҚАЗАҚ ҰЛТТЫҚ МЕДИЦИНА
УНИВЕРСИТЕТІ
КАЗАХСКИЙ НАЦИОНАЛЬНЫЙ
МЕДИЦИНСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ
С.Д.АСФЕНДИЯРОВА
НИИ ФПМ ИМЕНИ Б.А. АТЧАБАРОВА
ЦЕНТР КОЛЛЕКТИВНОГО ПОЛЬЗОВАНИЯ
ОТЧЕТ
5.
Поиск биомаркеров онкогенеза на
основе анализа баз данных с микро
РНК для ранней диагностики и
типирования онкологических
заболеваний
Бейсембаева Ш.А.
3000
6.
Разработка и внедрение в
исследовательскую практику методов
исследований лекарственных средств
на основе применения тест-культур
их стволовых клеток жировой ткани
мышей
Рысулы М.Р.
9000
128000
Проекты МОН РК:
№
1.
2.
3.
4.
5.
6.
Наименование темы
Генетический скрининг на некоторые орфанные
заболевания с неврологическими проявлениями у
детей
Популяционное исследование полиморфизма гена
IL28В при вирусном гепатите С в Республике
Казахстан
Экспрессия
генов
в
клетках
органов,
ответственных
за
сперматогенез
при
урогенитальной трихомонадной инфекции
Комплексное исследование
клинических,
генетических,
иммунологических
и
биохимических маркеров риска суицидов и
депрессивных расстройств
Омикс-исследование ревматоидного артрита и его
связи с остеопорозом в казахской популяции
Молекулярно-биологические
особенности
течения
асептического
воспаления,
ассоциированного
с
экологенной
иммунодепрессией
Сумма,
тыс.тенге
Руководитель
Идрисова Жанат Рустемовна
6600
Шопаева
Амангельдиновна
Гульжан
10000
Акышбаева Гуля Сабыровна
9000
Садуакасова Корлан Зарлыковна
9000
Габдулина Гульжан Хамзенична
13000
Балабекова Марина Казыбаевна
11000
58600
Общая сумма финансирования по проектам за 2015 год составила – 131600 тыс. тг
Страница 5 из 11
С.Ж.АСФЕНДИЯРОВ АТЫНДАҒЫ
ҚАЗАҚ ҰЛТТЫҚ МЕДИЦИНА
УНИВЕРСИТЕТІ
КАЗАХСКИЙ НАЦИОНАЛЬНЫЙ
МЕДИЦИНСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ
С.Д.АСФЕНДИЯРОВА
НИИ ФПМ ИМЕНИ Б.А. АТЧАБАРОВА
ЦЕНТР КОЛЛЕКТИВНОГО ПОЛЬЗОВАНИЯ
ОТЧЕТ
Сравнительная диаграмма по результатам деятельности научной лаборатории
«Центр коллективного пользования» на 2014 и 2015 гг.
Общая сумма финансирования по проектам
131,600
тыс.тенге
140,000
120,000
100,000
80,000
Год 2014
33,825
Год 2015
60,000
40,000
20,000
0
Грантовое финансирование
Таким образом, общая сумма привлечённых средств по лаборатории ЦКП за 2015
год увеличилась в 3,9 раза.
Повышение квалификации сотрудников за 2014 год:
№
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
Название курса
BUCK Институт, г.Новато, США. «Исследования
некодирующих РНК и метилирования ДНК
маркеров для ранней диагностики заболеваний
человека»
BUCK Институт, г.Новато, США. «Создание
клеточных моделей для геномных исследований»
BUCK Институт, г.Новато, США.
«Транскриптомный анализ»
«Основы контроля качества лабораторных
исследований». Место проведения - КазНМУ,
проведен специалистами лаборатории «Tree gene»
совместно с КАМЛД.
«Пипетирование в диагностике, исследования и
безопасность». Место проведения – КазНМУ.
Проведён специалистами Института
Микробиологии Бундесвера, Отдел вирусологии
и риккетсиологии, Мюнхен, Германия.
«Импакт-фактор: анализ цитаты и его роль в мире
науки». Место проведения - Главный корпус
Академии наук РК, проведен МЦО
«EDTECH.KZ»
Тайм-менеджмент. Место проведения - КазНМУ,
проведен Международной Академией Бизнеса
Основы менеджмента качества в образовательных
Дата проведения
сентябрь 2013г сентябрь 2014г
Сотрудники
Амирбеков А.С.
6.01.14 - 6.04.14г
Нусупбекова А.М.
6.01.14 - 6.04.14г
Смагул А.О.
28.01.14
Оразгалиева М.Г.,
Качиева З.С. Карабекова
А.Н.
4.04.2014г
Оразгалиева М.Г.,
Качиева З.С. Карабекова
А.Н.
7-8 мая 2014
Качиева З.С. Карабекова
А.Н.
10-12 июня 2014
Нусупбекова А.М.
16-20 июня 2014г
Оразгалиева М.Г.
Страница 6 из 11
С.Ж.АСФЕНДИЯРОВ АТЫНДАҒЫ
ҚАЗАҚ ҰЛТТЫҚ МЕДИЦИНА
УНИВЕРСИТЕТІ
КАЗАХСКИЙ НАЦИОНАЛЬНЫЙ
МЕДИЦИНСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ
С.Д.АСФЕНДИЯРОВА
НИИ ФПМ ИМЕНИ Б.А. АТЧАБАРОВА
ЦЕНТР КОЛЛЕКТИВНОГО ПОЛЬЗОВАНИЯ
ОТЧЕТ
9.
10.
11.
12.
13.
14.
учреждениях Место проведения - КазНМУ
Проведен отделом СМК КазНМУ
2 ой международный практический семинар
«Practical Biobanking», в рамках международного
форума по проблемам биобанкинга (The 2nd
BBMRI-LPC Forum Meeting with a theme «Starting
from Scratch»), Хельсинки, Финляндия
«Training: Rapid Identification of Resistance
Mutations to Ethambutol, Isoniazid, Rifampin and
Streptomicin using the Akonni Biosystems MDR-TB
Microarray». Место проведения – КазНМУ,
тренинг проведен совместно с представителями
НИИ молекулярной биологии и биохимии им.
М.А. Айтхожина
«Quality and competiveness of export products», в
рамках IV Центрально-Азиатского Торгового
Форума
«Внутренний аудит системы менеджмента
испытательных и калибровочных лабораторий в
соответствии с требованиями МС ИСО/МЭК
17025:2005 (СТ РК ИСО/МЭК 17025-2007)»
Тренинг «Гранты Европейского Союза для
исследований и инноваций. Новые конкурсы
Рамочной Программы Европейского Союза
ГОРИЗОНТ 2020»
Тренинг «Грантына инновацию – Рамочная
Программа Европейского Союза по
исследованиям и инновациям Горизонт 2020»
Нусупбекова А.М.
24 по 27 сентября
2014
Качиева З.С.
6.10.14-10.10.14
Оразгалиева М.Г.,
Качиева З.С. Карабекова
А.Н., Смагул А.О.,
Нусупбекова А.М.
30.10.14
Нусупбекова А.М.
24-26.11.14
Нусупбекова А.М.
21-23.01.15.
Смагул А.О.
17.03.15
Нурмолдин Ш.М.
Сотрудниками ЦКП планируются и осуществляются стажировки в ведущих
зарубежных научных институтах. Согласно плану повышения квалификации ЦКП
Амирбеков А.С. успешно прошёл годичную стажировку в BUCK Институте, г. Новато,
США (по программе Болашак) с сентября 2013г по сентябрь 2014г. Стажировка
проходила в рамках проекта BUCK Институт "Исследования некодирующих РНК и
метилирования ДНК маркеров для ранней диагностики заболеваний человека".
Амирбековым проведена работа по изучению длинных некодируюших
РНК,
импринтиговых областей человеческого генома, и того как возрастные изменения в этих
регионах могут влиять на развитие заболеваний. Это исследование потенциально может
привести к разработке новых методов диагностики возрастных болезней, и его результаты
могут быть использованы для определения новых биомаркеров старения.
Двое сотрудников лаборатории, Нусупбекова А.М. и Смагул А.О., были
командированы в BUCK Институт, г.Новато, США и прошли трехмесячную стажировку с
6.01.14 по 6.04.14г. Лаборатория исследования стволовых клеток, на базе которой
специалисты КазНМУ им. С.Д. Асфендиярова проходили стажировку, специализируется
на эпигенетических принципах старения человеческих стволовых клеток. В рамках
стажировки молодые ученные освоили навыки формирования геномных исследований на
основе клинических данных, приобрели опыт работы с человеческими стволовыми
клетками, провели молекулярно-генетический сравнительный анализ стволовых клеток с
молодым и старым фенотипом. Приобретённые навыки и освоенные методики нашли своё
применение в текущей работе и дали возможность планирования более широкого круга
научных исследований. Для внедрения полученных во время стажировки навыков был
разработан и выигран НТП на внутривузовский грант «Разработка и внедрение в
Страница 7 из 11
С.Ж.АСФЕНДИЯРОВ АТЫНДАҒЫ
ҚАЗАҚ ҰЛТТЫҚ МЕДИЦИНА
УНИВЕРСИТЕТІ
КАЗАХСКИЙ НАЦИОНАЛЬНЫЙ
МЕДИЦИНСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ
С.Д.АСФЕНДИЯРОВА
НИИ ФПМ ИМЕНИ Б.А. АТЧАБАРОВА
ЦЕНТР КОЛЛЕКТИВНОГО ПОЛЬЗОВАНИЯ
ОТЧЕТ
исследовательскую практику методов исследований лекарственных средств на основе
применения тест-культур из стволовых клеток жировой ткани мышей».
Заведующая лабораторией ЦКП Оразгалиева М.Г., а также сотрудники Качиева З.С.
и Карабекова А.Н. прошли обучение по курсу - «Пипетирование в диагностике,
исследования и безопасность», проведённому специалистами Института Микробиологии
Бундесфера, отдел вирусологии и риккетсиологии, Мюнхен, Германия.
Следующие сотрудники ЦКП - Оразгалиева М.Г., Качиева З.С., Карабекова А.Н.
приняли участие в семинаре «Основы контроля качества лабораторных исследований»,
организованный казахстанской ассоциацией медицинской лабораторной диагностики.
М.н.с лаборатории Качиева З.С. и Карабекова А.Н. прошли международный
семинар-тренинг «Импакт-фактор: анализ цитаты и его роль в мире науки»
Сотрудники лаборатории приняли участие в семинаре Life Technologies в институте
педиатрии и детской хирургии по методам современной клеточной биологии (метод
определения полной нуклеотидной последовательности).
Сотрудники лаборатории прошли тренинг совместно с представителями НИИ
молекулярной биологии и биохимии им. М.А. Айтхожина «Training: Rapid Identification of
Resistance Mutations to Ethambutol, Isoniazid, Rifampin and Streptomicin using the Akonni
Biosystems MDR-TB Microarray».
В связи с разработкой проекта по созданию биобанка в рамках Инновационной
Школы «Школа молекулярно-генетических исследований в области медицины» м.н.с.
лаборатории ЦКП Качиева З.С. приняла участие в работе 2 международного
практического семинара «Practical Biobanking» в г. Хельсинки (Финляндия) в рамках
международного форума по проблемам биобанкинга (The 2nd BBMRI-LPC Forum Meeting
with a theme «Starting from Scratch»).
В рамках подготовки к аккредитации м.н.с. лаборатории Нусупбекова А.М. прошла
курсы «Quality and competiveness of export products» и «Внутренний аудит системы
менеджмента испытательных и калибровочных лабораторий в соответствии с
требованиями МС ИСО/МЭК 17025:2005 (СТ РК ИСО/МЭК 17025-2007)», сдала экзамены
и аттестована как Внутренний аудитор системы менеджмента испытательных и
калибровочных лабораторий.
КазНМУ
им.
С.Д.
Асфендиярова
стремиться
стать
инновационным
исследовательским центром в регионе, одной из важных составляющих этого процесса
является обучение сотрудников в ведущих зарубежных исследовательских центрах. В
2014 году молодые учёные лаборатории «Центр коллективного пользования» прошли
курсы повышения квалификации по многим направлениям исследований, в т.ч. в
зарубежных лабораториях и успешно применяют свои знания на практике.
Участие в конференциях:
Сотрудники ЦКП Оразгалиева М.Г., Качиева З.С., Карабекова А.Н. приняли
активное участие в работе «Зимней школы», посвященной памяти академика Б.А.
Атчабарова, проходившей 29-30 января 2015. В рамках данного мероприятия проводилась
презентация возможностей лаборатории, планирование совместных проектов с визитингпрофессорами, демонстрация работы и методологической базы студентам, желающим
проводить НИРС на базе геномной лаборатории.
Молодые учёные ЦКП Нусупбекова А.М. и Смагул А.О. выступили на
международной научно-практической конференции студентов и молодых учёных
«Интеграция студенческой науки в международное пространство», прошедшей 25-26
апреля 2014 г, с докладами о результатах работы в BUCK Insitute, США. Темы докладов:
Страница 8 из 11
С.Ж.АСФЕНДИЯРОВ АТЫНДАҒЫ
ҚАЗАҚ ҰЛТТЫҚ МЕДИЦИНА
УНИВЕРСИТЕТІ
КАЗАХСКИЙ НАЦИОНАЛЬНЫЙ
МЕДИЦИНСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ
С.Д.АСФЕНДИЯРОВА
НИИ ФПМ ИМЕНИ Б.А. АТЧАБАРОВА
ЦЕНТР КОЛЛЕКТИВНОГО ПОЛЬЗОВАНИЯ
ОТЧЕТ
«Клеточные технологии для определения возрастных изменений стволовых клеток»;
«Геномные исследования человеческих стволовых клеток».
После прохождения стажировки в BUCK Institute молодые учёные КазНМУ
представили свои доклады для ознакомления с результатами своего обучения и
демонстрации специфических проектов, которые могут быть проведены на базе
молекулярно-геномного центра.
Сотрудники лаборатории участвовали в организации и проведении конференции
«Современные технологии и методы диагностики онкологических заболеваний» 15 мая
2014г.
Для подведения итогов работы лаборатории ЦКП организована конференция
«Современная медицина: от клинических испытаний до персонализированных
исследований» 4 июня 2014г. В рамках конференции с докладами выступили молодые
ученые: Нусупбекова А.М. – «Создание клеточных моделей для геномных исследований»;
Смагул А.О. – «Транскриптомный анализ мезенхимальных стволовых клеток, полученных
из жировой ткани человека»; Карабекова А.Н. – «Роль семейства аполипопротеидов в
метаболическом синдроме»; Качиева З.С. – «Роль геномных исследований в
персонализации медицины в Казахстане». В программе конференции участвовали
специалисты из различных НИИ и медицинских организаций Казахстана и России:
Российской медицинской Академии последипломного образования, Казахского
Государственного Женского Педагогического Университета, Физико-Технического
факультета КазНУ, Казахского научно-исследовательского института онкологии и
радиологии, Казахского национального технического университета имени К. И. Сатпаева,
КазНИИ глазных болезней, Центральной лаборатории биоконтроля и сертификации
предклинических испытаний. Во время дискуссии обсуждались перспективы
сотрудничества научной лаборатории «Центр коллективного пользования» с научными
центрами и институтами Казахстана, ближнего и дальнего зарубежья. Проведение
конференции лабораторией будет ежегодным, с целью освещения технических
возможностей и методологической базы
Центра коллективного пользования для
заинтересованных в научном сотрудничестве организаций.
В связи с разработкой проекта по созданию биобанка в рамках Инновационной
Школы «Школа молекулярно-генетических исследований в области медицины» м.н.с.
лаборатории ЦКП Качиева З.С. приняла участие в работе международного форума по
проблемам биобанкинга (The 2nd BBMRI-LPC Forum Meeting with a theme «Starting from
Scratch»). Форум открылся 23 сентября 2014 года в г. Таллинн (Эстония) и продолжался в
г. Хельсинки (Финляндия), где с 24 по 27 сентября 2014 года прошла научная
конференция «HandsOn: Biobanks (HOBB) 2014» и 2ой международный практический
семинар «Practical Biobanking».
Сотрудник лаборатории ЦКП Смагул А.О. принял участие в работе Азиатской
Тихоокеанской конференции по проблеме инфекций передающихся половым путем в г.
Бангкок, Таиланд с 10.11.14 по 14.11.14г, с докладами «Trichomonas vaginalis and
spermatogenesis in men», «Chlamidia trachomatis as etiological agent for prostatits».
Молодые специалисты геномной лаборатории Качиева З.С. и Смагул А.О.
выступили с докладами на III конгрессе специалистов лабораторной службы РК
«Современная лабораторная медицина: инновационные технологии лабораторного
анализа и новые возможности их клинического применения в Казахстане», в рамках «Дни
Университета», посвящённых 125-летию Санжара Асфендиярова. Тема доклада Качиевой
З.С.: «Роль фармакогенетических исследований в персонализации медицины в
Страница 9 из 11
С.Ж.АСФЕНДИЯРОВ АТЫНДАҒЫ
ҚАЗАҚ ҰЛТТЫҚ МЕДИЦИНА
УНИВЕРСИТЕТІ
КАЗАХСКИЙ НАЦИОНАЛЬНЫЙ
МЕДИЦИНСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ
С.Д.АСФЕНДИЯРОВА
НИИ ФПМ ИМЕНИ Б.А. АТЧАБАРОВА
ЦЕНТР КОЛЛЕКТИВНОГО ПОЛЬЗОВАНИЯ
ОТЧЕТ
Казахстане». Тема доклада Смагул А.О.: «Применение метода секвенирования нового
поколения (NGS) в биомедицинских исследованиях».
Младший научный сотрудник лаборатории ЦКП Смагул А.О. принял участие в
научном форуме молодых ученых-медиков «Медицинская наука в современном мире» с
докладом «Основные перспективные направления науки в Казахстане» 23 декабря 2014г,
за что сотрудником получена благодарность от СНО и Совета молодых ученых.
Количество публикаций:
Тезисы – 5 шт
№
Наименование
Role
of
SINE/Alu retrotransposons in
Human
Adult Mesenchymal Stem Cells
Aging
Opposing
activities
of
oncogenic MIR17HG and tumor
suppressive MIR100HG clusters
and their gene targets regulate
replicative senescence in human
adult stem cells.
Выходные данные
Molecular genetics of
aging Cold Spring Harbor
Laboratory,
USA,
September 29-October 3,
2014
Molecular genetics of
aging Cold Spring Harbor
Laboratory,
USA,
September 29-October 3,
2014
Characterizing qualitative and
quantitative global changes in
the aging heart using a
novel hybrid DA method
HUPO 13th Annual World
Congress, Madrid, Spain,
October 5-8, 2014
4
ТRICHOMONAS INFECTION
AND SPERMATOGENESIS IN
MEN
5
CHLAMIDIA
INFECTION
AND PROSTATITIS
18th IUSTI Asia-Pacific
ConferenceMay 11th –
14th November 2014 @
Bangkok Thailand
Аkyshbayeva,
18th IUSTI Asia-Pacific Kulbarshin
ConferenceMay 11th – Ramazanova, Aibek Smagul
14th November 2014 @
Bangkok Thailand
1
2
3
Авторы
Yueqiang Zhao, Ying Sha, Guillermo
Ortega, Aibek Smagul, Ping Niu, Akan
A Akanov, I King Jordan and Victoria V
Lunyak.
Ping Niu, Mary F Lopez, Lulu Wang,
David Sarracino, Amol Prakash, Maryann
Vogelsang, Bryan Krastins, Yueqiang
Zhao, Aibek Smagul, Aliya Nussupbekova,
Sirkka-Lisa Hostika, Glenn Geesman, Akan
A Akanov, I King Jorda and Victoria V
Lunyak
Maryann S Vogelsang, Amol Prakash,
David Sarracino, Gouri Vadali, Scott
Peterman,
Barbara
Аrewen, Aliya
Nussupbekova, Aibek Smagul, Yueqiang
Zhao, Shadab Ahmad, Gregory Byram,
Bryan Krastins, Victoria V Lunyak, Mary F
Lopez
Kulbarshin
Аkyshbayeva,
Bakhyt
Ramazanova,
Narymzhan Nakisbekov,
Aibek Smagul
Bakhyt
Опубликованные статьи – 5 шт
№
1
2
3
4
Наименование
Клинические особенности MODY
диабета
Выявление
факторов
и
предрасположенности к развитию
ревматоидного артрита у студентов
КазНМУ
Ген BRCA1 и его домен BRCT в
развитии рака молочной железы
Создание клеточных моделей для
геномных исследований.
Выходные данные
Медицина
№1,
2014. С.63-67.
Сборник научных
работ студентов и
молодых учёных
2013-2014г.
Онкология
и
радиология
Казахстана №3-4,
2014. С.34-36.
Онкология
и
радиология
Казахстана №3-4,
Авторы
Нурбекова А.А., Жапарханова З.С.,
Оразгалиева М.Г., Смагул А.О.
У.Онгар,
Ж.Баймуратова,
А.Жандлиева,
Накисбеков
Н.О.,
Хасенова К.Х., Рослякова Е.М.
Ш.А. Бейсембаева, Ш.М. Нурмолдин.
А.М. Нусупбекова
Страница 10 из 11
С.Ж.АСФЕНДИЯРОВ АТЫНДАҒЫ
ҚАЗАҚ ҰЛТТЫҚ МЕДИЦИНА
УНИВЕРСИТЕТІ
КАЗАХСКИЙ НАЦИОНАЛЬНЫЙ
МЕДИЦИНСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ
С.Д.АСФЕНДИЯРОВА
НИИ ФПМ ИМЕНИ Б.А. АТЧАБАРОВА
ЦЕНТР КОЛЛЕКТИВНОГО ПОЛЬЗОВАНИЯ
ОТЧЕТ
5
Молекулярно-генетические
деградации сустава
аспекты
2014. С.37-40.
Вестник КазНМУ,
№1-2015.
С.366371.
М.Г. Оразгалиева, А.М. Нусупбекова,
Г.Х. Габдулина.
Статьи поданые в печать - 2 шт
№
Наименование
Выходные данные
Авторы
Molecular
cell (импактфактор
14,464)
1
Opposing activities of oncogenic
MIR17HG and tumor suppressive
MIR100HG clusters and their gene
targets regulate replicative senescence in
human adult stem cells
Возможности
использования
мезенхимальных стволовых клеток,
выделенных из жировой ткани в
скрининге лекарственных препаратов
"Морфология
и
доказательная
медицина"
№1,
2015
Mary F Lopez, Ping Niu, Lulu Wang,
David Sarracino, Amol Prakash,
Maryann Vogelsang,Bryan Krastins,Yueq
iang Zhao, Aibek Smagul, Aliya Nussupb
ekova, SirkkaLisa Hostilka,Glenn Geesman, Akan
A Akanov, I King Jorda and Victoria
V Lunyak
Нусупбекова А.М., Оразгалиева М.Г.,
Рысулы М.Р., Дуйсенбаева А.Ж.,
Ажибекова Р.Ж.
2
Статьи в стадии подготовки – 1 шт
№
1
Наименование
Выходные данные
Авторы
Transcriptional profiling of Interleukin-2
treated
human
adipose
derived mesenchymal stem
cells
revealed
dramatic
changes
in
immunomodulation activity of stem cells
with replicative senescence.
Журнал для подачи
статьи
не
определён
Ping Niu, Aibek Smagul, Lu Wang, Laura
Martin
Perez, Aliya Nussupbekova, Sain Bahretdi
nov, Beatriz Gonzalez Galvez, Akan
A Akanov, I King Jordan and Victoria
V Lunyak.
Работа по аккредитации Центра коллективного пользования
В рамках подготовки к аккредитации лаборатории по СТ РК ИСО МЭК 17025-2007
сотрудниками ЦКП Оразгалиевой М.Г, Нусупбековой А.М. разработаны проекты
руководства по качеству, положения исследовательского центра, паспорта лаборатории,
разработаны СОПы и методические рекомендации согласно области аккредитации
исследовательского центра. Разрабатываются документированные процедуры по качеству,
формируется база данных по нормативным документам РК, и база документации к
приборному парку ЦКП.
Вовлечение студентов в научные исследования (количество, процент)
В 2014 году в двух проектах из 12 с участием ЦКП были вовлечены студенты, что
составляет 17%.
В 2015 году во все проекты с участием ЦКП включены студенты. Таким образом,
100% проектов вовлекают в научную работу студентов.
В рамках подготовки к аккредитации по СТ РК ИСО/МЭК 17025:2008 сотрудниками
лаборатории ЦКП подготовлены и утверждены на заседании Ученого Совета (Протокол
№ 2 от «_20_» ноября 2014г.) методические рекомендации «Методы выделения ДНК из
биологических образцов различных источников».
Зав. лабораторией ЦКП
Оразгалиева М.Г.
Страница 11 из 11