Мирошников К.А. - Институт биоорганической химии

advertisement
Фамилия, имя, отчество научного работника: Мирошников Константин Анатольевич
Структурное подразделение: Лаборатория молекулярной биоинженерии__________
1. Наличие трудов научного работника 2009 – 2014 по разделам:
№ Разделы
1.
1
1.
2
1.
3
1.
4
1.
5
1.
6
1.
7
1.
8
Публикации в рецензируемых журналах
Колво
17
Статьи в научных сборниках и продолжающихся научных
изданиях
Монографии и главы в монографиях
Публикации в материалах научных мероприятий
33
Патенты и свидетельства о регистрации программ для
ЭВМ и баз данных
Препринты
Научно-популярные книги и статьи
4
Другие публикации по вопросам профессиональной
деятельности
2
2. Перечень трудов научного работника по соответствующим разделам
1.1. Публикации в рецензируемых журналах
1.1.1. Фильчиков М.В., Осмаков Д.И., Логовская Л.В., Сыкилинда Н.Н., Кадыков В.А.,
Курочкина Л.П., Месянжинов В.В., Бернал Р.А., Мирошников К.А.
"Пространственная реконструкция капсида и идентификация поверхностных
белков бактериофага SN Pseudomonas aeruginosa электронно-микроскопическими
методами" Биоорганическая химия (2009) т. 35, №6, с.808-815
1.1.2. Шабурова О.В., Крылов С.В., Вейко В.П., Плетенeва Е.А., Буркальцева М.В.,
Мирошников К.А., Корнелиссен А., Лавинье P., Сыкилинда Н.Н., Кадыков В.А.,
Месянжинов В.В., Волкарт Г., Крылов В.Н. "Поиск факторов разрушения
бактериальных биофильмов: Сравнение свойств группы бактериофагов
Pseudomonas putida и специфичности их продуктов, образующих ореол" Генетика.
(2009) т.45, №2, с.185-195
1.1.3. Lecoutere E., Ceyssens P.J, Miroshnikov K.A., Mesyanzhinov V.V., Krylov V.N.,
Noben J.P., Robben J., Hertveldt K., Volckaert G., Lavigne R."Identification and
comparative analysis of the structural proteomes of phiKZ and EL, two giant
Pseudomonas aeruginosa bacteriophages" Proteomics. (2009); V.9(11), P.3215-3219.
1.1.4. Ceyssens P.J., Miroshnikov K., Mattheus W., Krylov V., Robben J., Noben J.P.,
Vanderschraeghe S., Sykilinda N., Kropinski A.M., Volckaert G., Mesyanzhinov V.,
Lavigne R."Comparative analysis of the widespread and conserved PB1-like viruses
infecting Pseudomonas aeruginosa" Environ Microbiol. (2009);V.11(11), P.2874-2883.
1.1.5. Чупров-Неточин Р.Н., Файзуллина Н.М., Сыкилинда Н.Н., Симакова М.Н.,
Месянжинов В.В., Мирошников К.А. «Бета-спиральный домен бактериофага Т4
управляет укладкой фрагмента длинных хвостовых фибрилл в составе химерного
белка» Биоорганическая химия (2010) т.36, №2, с.193-199
1.1.6. Крылов В.Н., Мирошников К.А., Крылов С.В., Вейко В.П., Шабурова О.В.,
Буркальцева М.В. «Межвидовая миграция и эволюция бактериофагов семейства
phiKZ: цели и критерии поиска новых phiKZ-подобных бактериофагов» Генетика
(2010) т.46, №.2, с.159-167
1.1.7. Плетенева Е.А., Крылов С.В., Шабурова О.В., Буркальцева М.В., Мирошников
К.А., Крылов В.Н. «Псевдолизогения бактерий Pseudomonas aeruginosa,
инфицированных phiKZ-подобными бактериофагами» Генетика (2010) т.46, №1,
с.26-32
1.1.8. Timofeev V.I., Chuprov-Netochin R.N., Samygina V.R., Bezuglov V.V., Miroshnikov
K.A.. Kuranova I.P. «X-ray investigation of crystallized gene-engineered human insulin
complexed with polysialic acid» Acta Crystalogr.D (2010) v.66, №3, p.259-263
1.1.9. Крылов С.В., Плетенева Е.А., Буркальцева М.В., Шабурова О.В., Мирошников
К.А., Лавинь Р., Корнелиссен А., Крылов В.Н. Нестабильность генома фагов вида
EL Pseudomonas aeruginosa: Исследование мутантов, проявляющих вирулентность.
Генетика (2011) Т. 47. № 2. С. 183-189
1.1.10. Чертков О.В., Чупров-Неточин Р.Н., Легоцкий С.В., Сыкилинда Н.Н., Шнейдер
М.М., Иванова М.А., Плетенева Е.А., Шабурова О.В., Буркальцева М.Б.,
Кострюкова Е.С., Лазарев В.Н., Клячко Н.Л., Мирошников К.А. Свойства
пептидогликанлизирующего фермента бактериофага φPMG1 Pseudomonas
aeruginosa Биоорганическая химия. (2011) Т.37, № 6, с. 1–8
1.1.11. Chuprov-Netochin R.N., Amarantov S.V., Shneider M.M., Sykilinda N.N., Filchikov
M.V., Ivanova M.A., Mesyanzhinov V.V., Miroshnikov K.A. Peptidyl-prolyl isomerase
SLyD controls the recombinant folding of bacteriophage T4 long tail fibers
Biopharmaceutical J. (2011) V. 3.№1, p.30-36
1.1.12. Крылов С.В., Кропински А.М., Плетенева Е.А., Шабурова О.В., Буркальцева М.В.,
Мирошников К.А., Крылов В.Н. "Свойства нового D3-подобного бактриофага
рhiPMG1 Pseudomonas aeruginosa: структура генома и перспективы использования
в фаготерапии. Генетика (2012) Т.48 №9, с.1057-1067
1.1.13. Sycheva L.V., Shneider M.M., Sykilinda N.N., Ivanova M.A., Miroshnikov K.A.,
Leiman P.G."Crystal structure and location of gp131 in the bacteriophage phiKZ
virion."Virology (2012) V.434(2):P.257-64.
1.1.14. Tafoya D.A., Hildenbrand Z.L., Herrera N., Molugu S.K., Mesyanzhinov V.V.,
Miroshnikov K.A., Bernal R.A.”Enzymatic characterization of a lysin encoded by
bacteriophage EL.” Bacteriophage. (2013); V. 3(2):e25449.
1.1.15. Крылов С.В., Кропински А.М., Шабурова О.В., Мирошников К.А., Чеснокова
Е.Н., Крылов В.Н. «Новый умеренный бактериофаг phi297 Pseudomonas aeruginosa.
Специфические особенности структуры генома» Генетика. (2013). Т.49 (8): с. 806818.
1.1.16. Мирошников К.А., Куликов Е.Е., Дарбеева О.С., Лыско К.А., Игнатьев Г.М.
«Молекулярно-биологические и генетические принципы селекции терапевтических
бактериофагов Pseudomonas и Staphylococcus» Прикладная биохимия и
микробиология (2014) Т.50 (3): с.1-7
1.1.17. Sykilinda N.N., Bondar A.A., Gorshkova A.S., Kurochkina L.P., Kulikov E.E., Shneider
M.M., Kadykov V.A., Solovieva N.V., Kabilov M.R., Mesyanzhinov V.V., Vlassov
V.V., Drukker V.V., Miroshnikov K.A. “Complete Genome Sequence of the Novel
Giant Pseudomonas Phage PaBG” Genome announc (2014) V2 (1), e00929-13
1.2. Статьи в научных сборниках и продолжающихся научных изданиях
нет
1.3. Монографии и главы в монографиях
нет
1.4. Публикации в материалах научных мероприятий
1.4.1. Chuprov-Netochin R.N., Shneider M.M., Mesyanzhinov V.V., Miroshnikov K.A.
"Bacteriophage T4 beta-helical domain and peptidyl-prolyl isomerase drives the folding
of the long tail fiber fragment into a functional chimeric protein" Conference Jaques
Monod, Protein folds in infectious and neurodegenerative diseases. Aussois, France,
April 25-29, 2009
1.4.2. Мирошников К.А., Фильчиков М.В., Сыкилинда Н.Н., Курочкина Л.П., Кадыков
В.А., Бернал Р.А., Месянжинов В.В. "Электронно-микроскопическое картирование
поверхностных белков и объемная реконструкция капсидов бактериофагов
Pseudomonas aeruginosa" IV Российский симпозиум "Белки и пептиды" Казань, 2327 июня 2009
1.4.3. Чупров-Неточин Р.Н., Шнейдер М.М., Сыкилинда Н.Н., Мирошников К.А.
"Использование бета-спирального домена и пептидил-пролил изомеразы для
получения биологически активного рекомбинантного gp37 бактериофага Т4" IV
Российский симпозиум "Белки и пептиды" Казань, 23-27 июня 2009
1.4.4. Semenov A.M., Chuprov-Netochin R.N., Sykilinda N.N., Miroshnikov K.A. "Fibrous
adhesin gp131 of Pseudomonas aeruginosa giant bacteriophage phiKZ" 18th Evergreen
International Phage Biology Meeting, Olympia, WA, USA, Aug 9-14, 2009
1.4.5. Bernal R.A., Hildenbrandt Z., Natchiar K., Sernova N., Herrera N., Kurochkina L.P.,
Mesyanzhinov V.V., Miroshnikov K.A. "Cryo-EM reconstructions of a virus-encoded
chaperonin point to a unique protein folding mechanism" 18th Evergreen International
Phage Biology Meeting, Olympia, WA, USA, Aug 9-14, 2009
1.4.6. Molugu S., Hildenbrandt Z., Natchiar K., Sernova N., Kurochkina L.P., Herrera N.,
Mesyanzhinov V.V., Miroshnikov K.A., Bernal R.A. "Cryo-EM reconstruction of the
first virus-encoded chaperonin" 18th Evergreen International Phage Biology Meeting,
Olympia, WA, USA, Aug 9-14, 2009
1.4.7. Lecoultere E., Ceyssens P-J., Miroshnikov K.A., Mesyanzhinov V.V., Krylov V.N.,
Noben J-P., Robben J., Hertveldt K., Lavigne R. "The structural proteomes of phages
phiKZ and EL"18th Evergreen International Phage Biology Meeting, Olympia, WA,
USA, Aug 9-14, 2009
1.4.8. Herrera N., Filchikov M.V., Hildenbrandt Z., Molugu S., Mesyanzhinov V.V.,
Miroshnikov K.A., Bernal R. 'Cloning, expression, purification and crystallization of a
lysozyme encoded by bacteriophage SN" 18th Evergreen International Phage Biology
Meeting, Olympia, WA, USA, Aug 9-14, 2009
1.4.9. Иванова М.А., Чупров-Неточин Р.Н., Семенов А.М., Шнейдер М.М., Мирошников
К.А. "Белковая инженерия на основе пептидил-пролил изомеразы SlyD для
получения биологически активных рекомбинантных рецепторных белков
бактериофагов Pseudomonas aeruginosa" Международная научная конференция по
биоорганической химии, биотехнологии и бионанотехнологии, посвященная 75летию со дня рождения академика Ю.А. Овчинникова, Москва-Пущино, 28
сентября - 2 октября 2009
1.4.10. Фильчиков М.В., Сыкилинда Н.Н., Месянжинов В.В., Мирошников К.А.
"Пространственная реконструкция капсидов и идентификация поверхностных
белков бактериофагов Pseudomonas aeruginosa электронно-микроскопическими
методами" Международная научная конференция по биоорганической химии,
биотехнологии и бионанотехнологии, посвященная 75-летию со дня рождения
академика Ю.А. Овчинникова, Москва-Пущино, 28 сентября - 2 октября 2009
1.4.11 Чупров-Неточин Р.Н., Шнейдер М.М., Сыкилинда Н.Н., Мирошников К.А. "Бетаспиральный домен бактериофага Т4 и пептидил-пролил изомераза управляют
укладкой фрагмента длинных хвостовых фибрилл в составе химерного белка"
Международная научная конференция по биоорганической химии, биотехнологии
и бионанотехнологии, посвященная 75-летию со дня рождения академика Ю.А.
Овчинникова, Москва-Пущино, 28 сентября - 2 октября 2009
1.4.12 Шкатула С.В., Куликов Е.Е., Сыкилинда Н.Н., Мирошников К.А. "Препаративная
очистка бактериофагов Pseudomonas aeruginosa хроматографическими методами"
Международная научная конференция по биоорганической химии, биотехнологии
и бионанотехнологии, посвященная 75-летию со дня рождения академика Ю.А.
Овчинникова, Москва-Пущино, 28 сентября - 2 октября 2009
1.4.13. Chuprov-Netochin R.N., Shneider M.M., Sykilinda N.N., Mesyanzhinov V.V.,
Miroshnikov K.A. "Active recombinant bacteriophage T4 gp37 produced by protein
fusion engineering" 3rd Symposium on Phages in Interaction, Leuven, Belgium,
December 18, 2009
1.4.14. Krylov S., Pleteneva E., Shaburova O., Burkaltseva M., Miroshnikov K., Krylov
V."Virulent mutants of Pseudomonas aeruginosa bacteriophage EL" 3rd Symposium on
Phages in Interaction, Leuven, Belgium, December 18, 2009
1.4.15. Burkaltseva M., Pleteneva E., Shaburova O., Krylov S., Miroshnikov K., Pechnikova E.,
Sokolova O., Krylov V."Halo-producing Pseudomonas aeruginosa phages: Specificities
of the capsule disrupting products" 3rd Symposium on Phages in Interaction, Leuven,
Belgium, December 18, 2009
1.4.15. Miroshnikov K.A., Sykilinda N.N., Shkatula S.V., Kulikov E.E. "Liquid
chromatography for preparative purification of Pseudomonas aeruginosa bacteriophages"
3rd Symposium on Phages in Interaction, Leuven, Belgium, December 18, 2009
1.4.16. Мирошников К.А. «Современные принципы подбора компонентов для
фаготерапевтических препаратов. Селекция, характеристика, очистка» II
симпозиум «Биофарма-2010» Ереван, Армения, 17-20 мая.2010.
1.4.18. Miroshnikov K.A. “Selection and purity of the phages used in therapeutic mixtures” IV
Conference on bacteriophage research Osaka, Japan; September 9-10, 2010
1.4.19. Чупров-Неточин Р.Н., Романова И.В., Цыганова М.Р., Сыкилинда Н.Н., Куликов
Е.Е., Лыско К.А., Дарбеева О.С., Мирошников К.А. «ПЦР – генотипирование
бактериофагов Pseudomonas aeruginosa, входящих в состав лекарственных
препаратов» Вакцинология-2010. Москва. 9-10 ноября 2010
1.4.20. Browning C., Shneider M., Miroshnikov K., Leiman P. “Structure of the bacteriophage
T4 gp25 – the highly conserved protein of phages with contractile tails” Viruses of
Microbes, Paris, France, June 21-25.2010
1.4.21. Miroshnikov K., Sykilinda N., Kulikov E. “Tailed bacteriophages of different
morphology purified by liquid chromatography” Viruses of Microbes, Paris, France, June
21-25.2010
1.4.22. Ivanova M., Miroshnikov K., Shneider M., Mesyanzhinov V. “Recombinant fibrous
adhesin gp131 of Pseudomonas aeruginosa bacteriophage phiKZ produced by protein
engineering” Viruses of Microbes, Paris, France, June 21-25.2010
1.4.23. Sykilinda N., Kovadlo A., Kadykov V., Shneider M., Kurochkina L., Dutova N., Drucker
V., Miroshnikov K., Mesyanzhinov V "Bacteriophage diversity of Lake Baikal” Viruses
of Microbes, Paris, France, June 21-25.2010
1.4.24. Popov D., Pchelintsev S., Ozerov M., Popov V., Miroshnikov K., Ackermann H-W.,
Karkischenko N., Grishin D. “Phage use in therapy of anthrax” Viruses of Microbes,
Paris, France, June 21-25.2010
1.4.25. Сыкилинда_Н.Н., Ковадло А.С., Кадыков В.А., Шнейдер М.М., Курочкина Л.П,
Шишкова Н.А., Месянжинов В.В., Дрюккер В.В., Мирошников К.А.
«Молекулярно-генетические и биологические характеристики бактериофагов
Pseudomonas aeruginosa озера Байкал». 3-й Байкальский микробиологический
симпозиум с международным участием «Микроорганизмы и вирусы в водных
экосистемах», г. Иркутск, 3-8 октября 2011 г.
1.4.26. Мирошников
К.А.
«Фаготерапия
как
путь
решения
проблемы
антибиотикорезистентности" Конгресс "Инфекционные болезни у детей:
Диагностика, лечение и профилактика", Санкт-Петербург, 5-6.октября 2011
1.4.27. Miroshnikov K.A. “PCR-based genotyping of therapeutic Pseudomonas bacteriophages"
1st Sympisium on Antimicrobial Research" Beijing, China, December 1-3, 2011
1.4.28. Sycheva L., Shneider M., Miroshnikov K., Leiman P. Crystal Structure of the product of
gene 131 of the Pseudomonas aeruginosa bacteriophage phikz 25th Rhine-Knee Regional
Meeting on X-ray Chrystallography of Biomacromolecules, Sursee, Switzerland
September 28-30. 2011
1.4.29. Sycheva L., Shneider M., Miroshnikov K., Leiman P. Crystal Structure of the product of
gene 131 of the Pseudomonas aeruginosa bacteriophage phikz XXII Phage/Virus
Aseembly, Port Aransas, Texas, USA, October 9-14 2011
1.4.30. Miroshnikov K., Tsyganova M., Romanova I., Sykilinda N., Kulikov E., Darbeeva O.
PCR-based genotyping of therapeutic Pseudomonas and Staphylococcus bacteriophages.
Viruses of Microbes. From exploration to the - omics era. Brussel, Belgium, July 16-20,
2012.
1.4.31. Цыганова М.Р., Романова И.В., Мирошников К.А. ПЦР-типирование
терапевтических фагов Staphylococcus aureus и Pseudomonas aeruginosa. III научнопрактическая конференция "Постгеномные методы анализа в биологии,
лабораторной и клинической медицине". Казань, 22-24 ноября 2012.
1.4.32. Мирошников К.А., Сыкилинда Н.Н., Куликов Е.Е., Дурманова З.В., Цыганова
М.Р., Дарбеева О.С «ПЦР система типирования терапевтических бактериофагов
Pseudomonas aeruginosa” Международная научно-практическая конференция
«Бактериофаги. Теортические и практические аспекты применения в медицине,
ветеринарии и пищевой промышленности» 23-25 апреля 2013, Ульяновск.
1.4.33. Мирошников К.А., Сыкилинда Н.Н., Шнейдер М.М., Куликов Е.Е. Перспективы
NextGen секвенирования в геномике бактериофагов. Международная конференция
«Высокопроизводительное секвенирование в геномике» 21-25 июля 2013,
Новосибирск.
1.5. Патенты и свидетельства о регистрации программ для ЭВМ и баз данных
нет
1.6. Препринты
нет
1.7. Научно-популярные книги и статьи
1.7.1. Мирошников К. «Пожиратели бактерий» Популярная механика (2013) №10
http://elementy.ru/lib/432141
1.7.2. Мирошников К. Комментарий к статье А.Кучук «Врачи-инфекционисты:
«Супербактерия» может мутировать и добраться до России» Комсомольская правдаЗдоровье+ 20 сентября 2010 http://www.kp.ru/daily/24560.5/735215/
1.7.3. Мирошников К. Комментарий к статье «Эра антибиотиков кончается, но замена
им есть» Аргументы и Факты – Здоровье 12 февраля 2013 http://www.aif.ru/health/life/4028
1.7.4. интервью в статье Костина Г. «Когда антибиотики бессильны» Эксперт №9 (888)
24 февраля 2014 http://expert.ru/expert/2014/09/kogda-antibiotiki-bessilnyi/
1.8. Другие публикации по вопросам профессиональной деятельности
1.8.1. Мирошников К.А. «Альтернативные противомикробные препараты» видеолекция
на портале ПостНаука 10 марта 2013 http://postnauka.ru/video/9993
1.8.2. Мирошников К.А. «Бактериофаги» видеолекция на портале «Постнаука» 18
февраля 2013 http://postnauka.ru/video/9563
СВЕДЕНИЯ О ЛИЧНОМ УЧАСТИИ В НАУЧНЫХ МЕРОПРИЯТИЯХ
(2009–2013 гг.)
Фамилия, имя, отчество научного работника: Мирошников Константин Анатольевич
Структурное подразделение: _лаборатория молекулярной биоинженерии________
Вид1) и
наименование
(тема)
научного
мероприятия
Статус
доклада2)
Уровень
мероприятия3)
Тема доклада
Дата и место
проведения
IV
Российский
симпозиум
"Белки и
секционный
международный
Электронномикроскопическое
картирование поверхностных
белков и объемная
реконструкция капсидов
23-27
июня
2009, г.Казань
пептиды"
бактериофагов Pseudomonas
aeruginosa
18th
Evergreen
International
Phage
Biology
Meeting
пленарный
международный
Fibrous adhesin gp131 of
Pseudomonas aeruginosa giant
bacteriophage phiKZ
9-14 августа
2009,
Олимпия,
Вашингтон
США
Международная научная
конференция
по биоорганической химии,
биотехнологии
и бионанотехнологии, посвященная 75летию со дня
рождения академика Ю.А.
Овчинникова
стендовый
международный
Препаративная очистка
бактериофагов
Pseudomonas aeruginosa
хроматографи-ческими
методами
28 сент. - 2
октября 2009
МоскваПущино
3rd
Symposium
on Phages in
Interaction
стендовый
международный
Liquid chromatography for
preparative purification of
Pseudomonas aeruginosa
bacteriophages
18 декабря
2009
II
симпозиум
«Биофарма2010
секционный
международный
Современные принципы
подбора компонентов для
фаготерапевтичес-ких
препаратов. Селекция, характеристика, очистка
17-20 мая
2010, Ереван,
Армения
IV
Conference
on bacteriophage
research
секционный
международный
Selection and purity of the
phages used in therapeutic
mixtures
9-10 сентября
2010, Осака,
Япония
Вакцинология-2010
секционный
всероссий-ский
ПЦР – генотипирова-ние
бактерио-фагов Pseudomonas aerugi-nosa,
входящих в состав
лекар-ственных препаратов
9-10 ноября,
Москва
Viruses of
Microbes
стендовый
международный
Tailed bacteriophages of
different morphology
purified by liquid
chromatography
21-25 июня
2011, Париж,
Франция
Конгресс
"Инфекционные болезни у
детей: Диагностика, лечение и профилактика
секционный
всероссий-ский
Фаготерапия как путь
решения проблемы
антибиотикорезистентно
сти
5-6 октября
2011, СанктПетербург
Левен,
Бельгия
пленарный
международный
PCR-based genotyping of
therapeutic Pseudomonas
bacteriophages
1-3 декабря
2011, Пекин,
Китай
Viruses of
стендоMicrobes.
вый
From
exploration to
the - omics
era
международный
PCR-based genotyping of
therapeutic Pseudomonas
and Staphylo-coccus
bacterio-phages
16-20 июля
2012,
Брюссель,
Бельгия
Международна
я научнопрактическая
конференция
«Бактериофаги.
Теоретические
и практические
аспекты применения в медицине, ветеринарии и пищевой
промышленнос
ти
стендовый
международный
ПЦР система
типирования
терапевтичес-ких бактериофагов Pseudomonas
aeruginosa
23-25 апреля
2013,
Ульяновск
Международна
я конференция
«Высокопроизводительное
секвенировани
е в геномике»
пленарный
международный
Перспективы NextGen
секвенирования в
геномике бактериофагов
21-25 июля
2013, Новосибирск
1st
Symposium
on Antimicrobial
Research
Форма 2
Участие в выполнении грантов, контрактов, договоров
(2009–2014 гг.)
Фамилия, имя, отчество научного работника: Мирошников Константин Анатольевич
Структурное подразделение: Лаборатория молекулярной биоинженерии
Номер
гранта,
программы /
контракта /
договора
Тема, предмет
гранта,
программы /
контракта /
договора
Срок
(период)
действия
гранта,
программы /
контракта /
договора
Статус участия
(руководитель,
исполнитель)
Функции,
выполняемые
научным
работником
(его конкретная
роль)
1. Гранты, программы:
09-04-00335-а
Белковая
инженерия
с
использованием
пептидил-пролил
изомераз
типа
SlyD в качестве
матрицы
фолдинга
2009-2010
руководитель
Разработка
стратегии
проекта, анализ
данных
исполнителей,
взаимодействие с
коллабораторами,
ведение
отчетности
и
публикаций.
09-05-00725-а
Бактериофаги –
новое
трофическое
звено в
экосистеме
уникального
олиготрофного
озера Байкал
2009-2011
исполнитель
Разработка
методов экспрессочистки
и
характеристики
бактериофагов в
природных
пробах
11G34.31.0004
Химический
дизайн
бионаноматериалов
2011-2014
исполнитель
Клонирование,
синтез и очистка
рекомбинантных
пептидогликангидролаз,
специфических
против
стафилококков
12-04-00765-а
Генотипирование
Терапевтических
бактериофагов
псевдомонад и
стафилококков
2012-2014
руководитель
Идентификация
фагов
из
различных
источников
с
помощью ПЦР с
использованием
праймеров,
разработанных в
лаб.
молекулярной
биоинженерии
2. Контракты, договоры:
20-3/5-09-ИБХ
от 12.01.2009
Проведение
предполетной
подготовки
препаратов,
преднаначен. для
КЭ «Структура»
в период МКС 18.
Поиск
условий
кристаллизации,
подготовка
и
заправка УБК
2009
руководитель
Планирование
эксперимента,
подбор белков для
включения
в
программу
КЭ,
контроль чистоты
предоставленных
биопрепаратов,
комплекности
кристаллизатора,
постановка опыта,
отчетность
ИО-02-09-ИБХ
от 01.02.2009
Анализ
результатов
рентгенографиче
ских
исследований по
КЭ
«ИнтерлейкинК», «МиметикК»,
«ВакцинаК», «Гликопротеид»,
«КАФ».
Подготовка
итоговых
отчетов
2009
руководитель
Анализ
кристаллографиче
ских
данных,
полученных
в
ходе
эксперимента
«Структура»
в
период 2005 –
2008
гг.
Предложения по
стратегии
постановки
эксперимента на
ближайший
период
22-05-10-ИБХ
от 11.01.2010
Проведение
предполетной
подготовки
биопрепаратов и
осаждающих
агентов для КЭ
«Структура»
в
период МКС -22
и МКС-25
2010
руководитель
Планирование
эксперимента,
подбор белков для
включения
в
программу
КЭ,
контроль чистоты
предоставленных
биопрепаратов,
комплекности
кристаллизатора,
постановка опыта,
отчетность
от Конструирование 2010
руководитель
Разработка
стратегии
проекта, анализ
генетических
данных,
анализ
11-405/10
15.04.2010
ПЦРдиагностической
системы
для
характеристики
бактериофагов
Pseudomonas
aeruginosa
23/05-11 ИБХ Подготовка
биопрепаратов,
от 01.03.2011
результатов,
отчетность.
2011
руководитель
Планирование
эксперимента,
подбор белков для
включения
в
программу
КЭ,
контроль чистоты
предоставленных
биопрепаратов,
комплекности
кристаллизатора,
постановка опыта,
отчетность
2012
руководитель
Планирование
эксперимента,
подбор белков для
включения
в
программу
КЭ,
контроль чистоты
предоставленных
биопрепаратов,
комплекности
кристаллизатора,
постановка опыта,
отчетность
2012
руководитель
Планирование
эксперимента,
подбор белков для
включения
в
программу
КЭ,
контроль чистоты
предоставленных
биопрепаратов,
комплекности
кристаллизатора,
постановка опыта,
отчетность
2012
руководитель
Планирование
эксперимента,
подбор белков для
включения
в
программу
КЭ,
контроль чистоты
предоставленных
биопрепаратов,
комплекности
кристаллизатора,
постановка опыта,
отчетность
предназначен.
для проведения
КЭ «Структура»
в период МКС 27 и МКС-29,
оптимизация
условий
их
кристаллизации
24/3-11-ЦН
10.05.2011
от Исследования
кристаллизации
белков в период
МКС-27.
Обработка
результатов КЭ
«Структура»
основными
экспедициями
23-5/05-12-ИБХ
от 11.01.2012
25/3-12-ЦН
01.03.2012
Подготовка
предназначен.
для
экспериментов
биопрепаратов.
Поиск условий
их
кристаллизации
для
КЭ
«Структура»
в
период МКС -31
и МКС-33.,
от Исследования
кристаллизации
белков в период
в период МКС 31 и МКС-33.,
Обработка
результатов
реализации КЭ
«Структура
основными
экспедициями
2012г.
от Исследования
2013
руководитель
Планирование
эксперимента,
подбор белков для
включения
в
программу
КЭ,
контроль чистоты
предоставленных
биопрепаратов,
комплекности
кристаллизатора,
постановка опыта,
отчетность
№_23-7/05-13- «Подготовка
2013
предназначенных
ИБХ
от
для эксперимента
01.01.2013
руководитель
Планирование
эксперимента,
подбор белков для
включения
в
программу
КЭ,
контроль чистоты
предоставленных
биопрепаратов,
комплекности
кристаллизатора,
постановка опыта,
отчетность
№ 19-69/13 от Скрининг,
дифференциация
05.08.2013
руководитель
Характеристика
вирулентных
фаговых клонов
из терапевтических
препаратов
производства
НПО
«Микроген».
Разработка
и
реализация
стратегии
проекта.
26/3-13-ЦН
01.03.2013
кристаллизации
белков в период
в период МКС 33 и МКС-35.,
Обработка
результатов
реализации КЭ
«Структура
основными
экспедициями
2013г.
биопрепаратов.
Поиск условий
их
кристаллизации
для
КЭ
«Структура»
в
период МКС-35 и
МКС-37»
методом ПЦР и
выделение
вирулентных
фаговых клонов
Pseudomonas
и
Staphylococcus из
образцов
лечебнопрофилактически
х
препаратов
бактериофагов
2013
СВЕДЕНИЯ О ПЕДАГОГИЧЕСКОЙ ДЕЯТЕЛЬНОСТИ
(2009–2013 гг.)
Фамилия, имя, отчество научного работника: Мирошников Константин Анатольевич
Структурное подразделение: _Лаборатория молекулярной биоинженерии_______
Вид педагогической
деятельности и место
ее осуществления
Наименование
(тематика)
конкретного вида
педагогической
деятельности
1. Чтение курсов лекций:
Период
осуществления
конкретного вида
педагогической
деятельности
Спецкурс,
магистратура
МФТИ, кафедра
молекулярной
биофизики ФМБФ
2006-наст. время
Молекулярная
вирусология,
лекционный
спецкурс (осенний
семестр)
2. Проведение семинаров:
3. Научное руководство аспирантами:
Чупров Неточин
Роман Николаевич,
научное руководство
аспирантом, ИБХ РАН
Иванова Мария
Александровна,
научное руководство
аспирантом, ИБХ РАН
Цыганова
Маргарита
Романовна,
научное руководство
аспирантом, ИБХ РАН
Соловьева Наталья
Васильевна,
научное руководство
аспирантом, ИБХ РАН
Использование бетаспирального домена и
пептидид-пролил
изомеразы для
инженерии
биологически активных
рекомбинантных
белков бактериофагов
2008 – 2010,
Белковая инженерия с
использованием
пептидил-пролил
изомераз типа SlyD в
качестве матрицы
фолдинга
2009 – 2011
ПЦР-типирование
терапевтических
препаратов
стафилококковых
бактериофагов
2011 – 2012
Изучение функции
минорных структурных
белков бактериофага
phiKMV
2011 – н.в.
диссертация
защищена в 2012
отчислилась из
аспирантуры по
семейным
обстоятельствам
4. Другие виды педагогической деятельности1):
Шкатула Сергей
Валериевич,
научное руководство
дипломной работой,
Диплом магистра
МФТИ «Разработка
2008 - 2009
Документы,
подтверждающие
сведения
ИБХ РАН
Семенов Андрей
Михайлович,
научное руководство
дипломной работой,
ИБХ РАН
Бунтман Павел
Сергеевич,
научное руководство
дипломной работой,
ИБХ РАН
Цыганова
Маргарита
Романовна,
научное руководство
дипломной работой,
ИБХ РАН
Романова Ирина
Викторовна,
научное руководство
дипломной работой,
ИБХ РАН
метода хроматографической
очистки
бактериофагов
Pseudomonas
aeruginosa»
Диплом магистра
2008 - 2009
МФТИ
«Исследование
фибриллярных
рецепторсвязывающих
белков
бактериофагов
Pseudomonas
aeruginosa»
Диплом МГУ
2009 - 2010
(биологический ф-т
каф. вирусологии)
«Разработка метода
выделения и
очистки
бактериофагов с
помощью
различных типов
хроматографии»
Диплом МГУ
2009 - 2011
(биологический ф-т
каф. вирусологии)
«ПЦРдифференциация
терапевтических
бактериофагов
Staphylococcus aureus
по их
функциональным
генам»
Диплом МГУ
(биологический ф-т
каф. вирусологии)
«ПЦРдифференциация
терапевтических
бактериофагов
2009 - 2011
Pseudomonas
aeruginosa по их
функциональным
генам»
участие в
экспертном совете,
ЮЗАО Москва
III и IV конкурсы
научноисследовательских
работ «Школьная
академия наук»
2010 и 2011
УЧАСТИЕ В РЕДАКЦИОННЫХ КОЛЛЕГИЯХ НАУЧНЫХ
ЖУРНАЛОВ
Фамилия, имя, отчество научного работника: Мирошников Константин Анатольевич
Структурное подразделение: _Лаборатория молекулярной биоинженерии_______
Период
Наименование
научного журнала
(издания)
Сведения об участии
научного работника в
редколлегии научного
журнала (выполняемые
функции)
Какими документами
подтверждаются
сведения
2012 – наст.
время
The Bacteriophage
(Landes Bioscience,
Online ISSN:21597081)
Обсуждение
стратегии выпусков
журнала, переписка с
рецензентами и
авторами.
https://www.landesbio
science.com/journals/b
acteriophage/editorial
board/
Научный работник:
(с.н.с., и.о. рук. лабораторией)
(подпись)
(Мирошников К.А.)
(подпись)
(Иванов В.Т.)
Руководитель структурного подразделения:
(Директор ИБХ РАН)
Download