Современные аспекты биотехнологии и микробиологии

МИНИСТЕРСТВО ОБРАЗОВАНИЯ И НАУКИ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение
высшего профессионального образования
«Пущинский государственный естественно-научный институт»
(ПущГЕНИ)
«УТВЕРЖДАЮ»
И.о. Ректора ПущГЕНИ, к.б.н.,
Х.П. Тирас
___________________
«____»_______2012 г.
УЧЕБНО-ТЕМАТИЧЕСКИЙ ПЛАН
курсов повышения квалификации профессорско-преподавательского состава
по программе «Современные аспекты биотехнологии и микробиологии».
Целью программы является формирование у слушателей понимания проблем
сегодняшнего состояния биологической науки, в частности современные
теоретические и практические вопросы биотехнологии и микробиологии.
Категория слушателей: программа рассчитана на преподавателей высшей
квалификации (профессоров и доцентов) в области биотехнологии,
микробиологии и молекулярной биологии.
Срок обучения – с 07 октября по 19 октября 2013 г.
Форма обучения: лекции, мастер-классы, индивидуальные занятия
Режим занятий – очный
№
Наименование разделов
дисциплин и тем
В том числе
Всего, лекции мастер
час.
классы
1.
Биотехнология и
нанобиотехнология –
пущинские подходы
14
14
1.1 Кадры для биотехнологии: вызовы
3
1.2
2
1.3
1.4
1.5
2
и возможности - академик РАН,
Председатель Президиума Пущинского
Научного центра РАН, заместитель
директора Института биоорганической
химии им. академиков М.М. Шемякина и
Ю.А. Овчинникова РАН
Мирошников Анатолий Иванович
Нанобиология и нанабиотехнология
– проблемы и подходы - член-корр.
РАН, профессор, директор Института
теоретической и экспериментальной
биофизики (ИТЭБ) РАН, декан УЦ
биофизики и биомедицины ПущГЕНИ
Иваницкий Генрих Романович
История Пущинского научного
центра
в
свете
истории
российской науки - д.б.н.,профессор
ПущГЕНИ, МГУ им. М.В.Ломоносова, и
Института
теоретической
и
экспериментальной биофизики РАН
Шноль Симон Эльевич
Опыт
организации
магистерской
подготовки в Пущинском естественнонаучном институте - к.г.н., проректор
ПущГЕНИ Симонова Людмила Петровна
Существо
института
магистратуры как этапа высшего
образования
–
к.б.н.,
проректор
ПущГЕНИ,
Тирас Харлампий Пантелеевич
Фундаментальные
биотехнологии
проблемы 12
Устная
3
3
12
4
2.2
3
2.4
Форма
контроля
3
2.1 Положение
2.3
микроорганизмов
в
системе
живых
существ
и
современные представления об их
эволюции - член-корр. РАН, профессор
ПущГЕНИ
Калакуцкий Лев Владимирович
Научные основы биотехнологии
охраны окружающей среды - членкорр. РАН, профессор ПущГЕНИ
Боронин Александр Михайлович
Научные основы биотехнологии
охраны окружающей среды - д.б.н.
доцент ПущГЕНИ
Кошелева Ирина Адольфовна
Микробные механизмы разложения
устойчивых
и
чужеродных
соединений в биосфере - д.б.н.,
профессор
Головлёва Людмила Алексеевна
семинар
ские
занятия
Устная
4
4
2
2.5 Рекомбинантные
3
антитела.
Технология получения - к.б.н., доцент
ПущГЕНИ
Бровко
Федор
Александрович
2
Физико-химическая биология, 14
биохимия
14
3.1 Ключевые проблемы физики белка и
2
3.2
2
3.3
3.4
3.5
3.6
3.7
4
их значение для физико-химической
биотехнологию - д.б.н., профессор
член-корр. РАН
Финкельштейн Алексей Витальевич
Молекулярные
основы
нейроэндокринной сигнализации д.б.н., профессор ПущГЕНИ
Наволоцкая Елена Витальевна
Современное
состояние
химии
пептидов - к.х.н., ст. преподаватель
ПущГЕНИ
Родионов
Игорь
Леонидович
Биологические
функции
белков
рекомбинантной репарации ДНК к.х.н., доцент ПущГЕНИ
Данилкович Алексей Викторович
Молекулярные механизмы рецепции
и передачи сигналов в клетке - д.х.н,
профессор, член-корр. РАН, заместитель
директора Института биоорганической
химии им. академиков М.М.Шемякина и
Ю.А.Овчинникова РАН, декан учебного
центра физико-химической биологии и
биотехнологии
ПущГЕНИ
Липкин
Валерий Михайлович
Токсины в исследованиях ионных
каналов: механизм действия и путь
к новым лекарствам - член-корр.
РАН, Институт биоорганической химии
им. академиков М.М. Шемякина и
Ю.А.Овчинникова РАН
Цетлин Виктор Ионович
Физиологические функции фактора
некроза опухолей, установленные с
помощью
накаутных
и
трансгенных технологий - д.б.н.,
профессор,
член-корр.
РАН,
заведующий отделом молекулярной
биологии
НИИ
физико-химической
биологии им. А.Н. Белозерского, МГУ
Недоспасов Сергей Артурович
Актуальные
направления 6
молекулярной биологии
2
2
2
2
2
6
4.1 Физико-химические закономерности
2
4.2
2
биосинтеза нуклеиновых кислот.
Молекулярная
биология
вируса
гепатита С - член-корр. РАН,
профессор ПущГЕНИ и профессор МГУ
им. М.В. Ломоносова
Кочетков Сергей Николаевич
Механизмы
топологических
превращений ДНК - член-корр. РАН,
профессор ПущГЕНИ и профессор МГУ
им. М.В. Ломоносова
Устная
Устная
3
4.3
5
Габибов Александр Габибович
Полимеразная цепная реакция как
инструмент
современной
биотехнологии - д.б.н., профессор
ПущГЕНИ Патрушев Лев Иванович
Нанобиотехнология,
геномика, протеомика
2
8
8
5.1 Доменная организация генома (член-
2
5.2
2
5.3
5.4
6
корр. РАН, профессор МГУ
Разин Сергей Владимирович
Нанобиотехнология
д.б.н.,
профессор ПущГЕНИ и профессор МГУ
им. М.В. Ломоносова
Говорун Вадим Маркович
Протеомика,
как
современное
направление развития биологии
к.х.н, доцент ПущГЕНИ
Удовиченко Игорь Петрович
Биосенсорика на основе
нуклеиновых
кислот. Наноконструкции на основе
двухцепочечных
нуклеиновых
кислот. Создание, применение д.х.н.,
профессор,
заведующий
лабораторией Института молекулярной
биологии им. В.А.Энгельгардта РАН
Евдокимов Юрий Михайлович
2
2
Молекулярная медицина, как 14
результат
достижения
биотехнологии
12
2
6.1 Лабораторные экспериментальные
2
1
6.2
2
1
6.3
6.4
6.5
6.6
биомодели
в
доклинических
испытаниях
лекарственных
средств - д.б.н., профессор ПущГЕНИ
Мурашев Аркадий Николаевич
Генетическая инженерия растений
для
медицины
и
сельского
хозяйства - к.с.-х.н., доцент ПущГЕНИ
Долгов Сергей Владимирович
Механизм
переноса
энергии
в
биолюминесценции
и
его
применение - к.х.н., доцент ПущГЕНИ
Винокуров Леонид Михайлович
Биофармацевтика – состояние и
перспектив
д.х.н.,
Институт
биоорганической химии им. академиков
М.М. Шемякина и Ю.А.Овчинникова
РАН Байрамашвили Дмитрий Ильич
Новые
подходы к терапии и
диагностике
гриппа
д.х.н.,
профессор, заведующий лабораторией
химии углеводов ИБХ РАН
Бовин Николай Владимирович
Флуоресцентные белки: биология и
биотехнология – член-корр. РАН,
д.б.н,
заведующий
лабораторией
молекулярных технологий для биологии
и медицины ИБХ РАН
Лукьянов Сергей Анатольевич
Итоговая аттестация
ИТОГО
устная
2
2
2
2
4
72
4
Биотехнологические
микробиологии
4
аспекты 16
Научные основы биотехнологии охраны
окружающей среды - д.б.н. доцент
ПущГЕНИ
Кошелева Ирина Адольфовна
Микробные
механизмы
разложения
устойчивых и чужеродных соединений в
биосфере - д.б.н., профессор
Головлёва Людмила Алексеевна
ПРАКТИЧЕСКИЕ ЗАНЯТИЯ.
4.1
4.3
№
14
2
4
4
Темы практических занятий
п.п.
Количест
во часов
1 Лабораторные экспериментальные биомодели в доклинических
испытаниях лекарственных средств
Ал
2 Альтернативные биологические модели для фармакологии и
токтоксикологии
3 Генетическая инженерия растений для медицины и сельского
хозяйства
4 Проблемы разведения, содержания и использования лабораторных
животных в России.
ВСЕГО (часов)
2
3
3
4
12
УЧЕБНО-МЕТОДИЧЕСКИЕ МАТЕРИАЛЫ
3.1. Основная литература
1
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
9.
Иванов А.В., Кузякин А.О., Кочетков С.Н. Молекулярная биология вируса гепатита С.//
Успехи биологической химии, 2005, Т. 45, С. 37-86.
Козлов М.В., Поляков К.М., Иванов А.В., Филиппова С.Е., Кузякин А.О., Туницкая В.Л.,
Кочетков С.Н.
РНК-зависимая РНК-полимераза вируса гепатита С: исследование
механизма ингибирования производными пирогаллола // Биохимия 2006, Т. 71, С. 1253 –
1259
Ivanov A.V., Korovina A.N., Tunitskaya V.L., Kostyuk, D.A. Rechinsky,V.O., Kukhanova M.K.,
Kochetkov S.N. Development of the system ensuring a high-level expression of hepatitis C virus
nonstructural NS5B and NS5A proteins // Protein Expression and Purification, 2006, V.48, P. 1423
Tsetlin V.I. Snake venom -neurotoxins and other three-finger proteins. Eur. J. Biochem., 1999,
264, 281-286 (обзор).
Ю.Н.Уткин,
В.И.Цетлин,
Ф.Хухо.
Структурная
организация
никотиновых
ацетилхолиновых рецепторов. Биол. мембраны 16(2), 118-134 (1999) (обзор)
Кашеверов И.Е., Уткин Ю.Н., Цетлин В.И. Природные -конотоксины и их синтетические
аналоги в исследовании никотиновых ацетилхолиновых рецепторов. Биоорган. химия,
2006, 32, 115-129 (обзор).
Sine SM, Engel AG. Recent advances in Cys-loop receptor structure and function. Nature. 2006
;440 (7083):448-55. Review.
Ivankov D.N., Finkelstein A.V. Prediction of protein folding rates from the amino-acid sequencepredicted secondary structure. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2004, 101:8942-8944.
Finkelstein A.V. Galzitskaya O.V. Physics of protein folding. // Physics of Life Reviews, 2004,
1:23-56.
Гарбузинский С.А., Финкельштейн А.В., Галзитская О.В. К вопросу о предсказании ядер
сворачивания в глобулярных белках. // Молекулярная биология, 2005, 39, 1032-1041.
10. Финкельштейн А.В., Иванков Д.Н., Галзитская О.В. Предсказание скоростей и ядер
сворачивания глобулярных белков на основе теории их самоорганизации. // "Успехи биол.
химии", 2005, 45: 3-36.
11. Финкельштейн А.В., Птицын О.Б. Физика белка. 3-е издание. // Москва: Книжный Дом
Университет, 2005, 455c., + 32c. илл.
12. www.bernabiotech.com.
5
13. www.greenhillsbiotech.com.
14. www.cdc.gov/flu/professionals/antiviralback.htm.
15. Jones, J.C.; Turpin, E.A.; Bultmann, H.; Brandt, C.R.; Schultz-Cherry, S. Inhibition of influenza
virus infection by a novel antiviral peptide that targets viral attachment to cells. J. Virol. 2006, 80,
11960-7.
16. N.V.Bovin, A.B.Tuzikov, A.A.Chinarev, A.S.Gambaryan. Multimeric glycotherapeutics: new
paradigm. Glycoconjugate J., 21, 471-478 (2004).
17. Ю.М.Евдокимов, Жидкокристаллические формы ДНК и их биологическая роль, Жидкие
кристаллы и их практическое применение, 3, с.10 (2003).
18. Ю.М.Евдокимов,
Нуклеиновые
кислоты,
жидкие
кристаллы
и
секреты
наноконструирования, Наука и жизнь, 4, с.18, (2005).
19. Ю.М.Евдокимов и др. Нанотехнология на основе нуклеиновых кислот, Вестник РАН, 76,
с.112, (2006).
20. М.К. Роко, Р.С. Уильямс, П.Аливисатос, Нанотехнология в ближайшем десятилетии, М.,
Мир, (2002).
21. М. Ратнер, Д. Ратнер, Нанотехнология, М-С-Пб-Киев, (2004).
22. А.И. Гусев, Наноматериалы, наноструктуры, нанотехнологии. М.Физматлит., (2005).
23. И.П.
Суздалев,
Нанотехнология.Физико-химия
нанокластеров,
наноструктур
и
наноматериалов, М., КомКнига, (2006).
24. Липкин В.М. Зрительная система. Механизмы передачи и усиления зрительного сигнала в
сетчатке глаза // Соросовский Образовательный Журнал. 2001. Т 7, № 9. С. 2-8.
25. Липкин В.М., Обухов А.Н. Структура и механизмы функционирования белков зрительеной
системы. 1.Родопсин // Биол. мембраны. 1999. Т. 16, № 2. С. 135-158.
26. Филиппов П.П. Как внешние сигналы передаются внутрь клетки // Соросовский
Образовательный Журнал. 1998. Т 4, № 3. С. 28-34.
27. Атауллаханов Ф.И. Каскады ферментативных реакций и их роль в биологии // Соросовский
Образовательный Журнал. 2000. Т 6, № 7. С. 2-10.
28. Ю.А.Овчинников. Биоорганическая химия. М., Просвещение, 1987.
29. Б.Глик, Дж.Пастернак. Молекулярная биотехнология. Принципы и применение. М., Мир,
2002.
30. Nightingale P., Martin P. The myth of the biotech revolution. TRENDS in Biotechnology vol.22
No.11. 2004.
31. Hu X., Ma Q., Zhang S. Biopharmaceuticals in China. Biotechnol. J. 2006 Nov; 1(11):1215-24.
Revie
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------4. Заезд участников курсов – 06 октября 2010 г.
Открытие курсов – 07 октября 2010 г. в корпусе клетки Института
теоретической и экспериментальной биофизики РАН Регистрация
слушателей с 9 00.
Составитель программы - д.х.н, профессор, член-корр. РАН, Лауреат
Государственной премии СССР и премии им. Ю.А.Овчинникова, заместитель
директора Института биоорганической химии им. академиков М.М.Шемякина и
Ю.А.Овчинникова РАН, декан учебного центра физико-химической биологии и
биотехнологии ПущГЕНИ Липкин Валерий Михайлович
Ответственный секретарь
- Алешина Екатерина Федоровна
Телефон для справок: 73-05-46 или 8-915-456-21-35
5. Место проведения занятий
Лекции будут проводиться в корпусе клетки Института теоретической и
экспериментальной биофизики РАН.
Практические занятия и мастер-классы будут проводиться в помещениях
лаборатории биологических испытаний ФИБХ РАН и станции искусственного
климата «Биотрон» ФИБХ РАН (г. Пущино)
6