Лекция № 6 "ЛИЗОЦИМ" (1,23 Kbytes)

Лизоцим
• 1922 Открыт сэром
Александром
Флемингом,
который изучал антибактериальное
действия слизи
носовой полости
• 1962 Пьер Жолле и
соавт. установили
аминокислотную
последовательность
лизоцима куриного
яйца
• 129 АА
• 1962
Дэвид Хилтон Филлипс,
барон Элсмирский
Трехмерная структура
низкого разрешения (6 А)
• 1966
Структура высокого
разрешения (2 А).
Трехмерная структура
129 аминокислотных остатков, молекулярная масса 17 кД.
«Неупорядоченный белок»
Разрушает полисахариды
клеточной стенки бактерий
Пептидная
сшивка
Сахара
Разрушает полисахариды
клеточной стенки бактерий
• Связывает фрагмент полисахарида из шести
аминосахаров
NAG — NAM — NAG  NAM — NAG — NAM
A
B
C
D
E
F
• Ингибируется NAG — NAG — NAG, гипотеза
напряжения (Филлипс, 1967)
• Левитт (1974) опровержение гипотезы
напряжения
Механизм катализа
Механизм Филлипса
• 1. Связывание субстрата
Механизм Филлипса
• 2. Образование первого промежуточного
состояния
Механизм Филлипса
• 3. Распад первого промежуточного состояния,
уход первого продукта реакции
Механизм Филлипса
• 4. Приход молекулы воды, переход ко
второму промежуточному состоянию
Механизм Филлипса
• Распад второго промежуточного состояния,
уход второго продукта реакции
Альтернативный механизм
(Кошланда, Уитерса, etc.)
• Отличается образованием ковалентного
комплекса на стадии первого
переходного состояния
Экспериментальная проверка
• мутантный фермент + легко уходящая группа
Музыка лизоцима
Human lysozyme C
Lysozyme C precursor
! = end of the
signal sequence
( ) = alpha helix
[ ] = beta strand
{ } = turn
MKALIVLGLVLLSVTVQG!
KVFE(RCELARTLKR)
{LG}M{DG}Y{RG}IS
(LANWMCLAKWES)
{GY}N{TR}A
[TNYN]{AGDR}[STDY]
{GIFQ}[IN]{SRYW}
CNDGKT{PG}AVN{AC}HLS
(CSALL)QDN(IADAVACAKRVV)
{R}D{PQ}
(GIRA)W(VAWRNR)
{CQN}RDV(RQY){VQG}CGV
Green monkey
Lysozyme C
Mouse
Lysozyme C
Echidna
Lysozyme C
MKAVIILGLVLLSVTVQG!
KIFER(CELARTLKR)
{LG}L{DG}Y{RG}IS
(LANWVCLAKWES)
{GY}N{TQ}A
[TNYN]{PGDQ}[STDY]
{GIFQ}[IN]{SHYW}
CNNGKT{PG}AVN{AC}HIS
(CNALL)QDN(IADAVTCAKRVV)
{R}D{PQ}(GIRA)W(VAWRNH)
{CQN}RDV(SQY){VQG}CGV
MKTLLTLGLLLLSVTAQA!
KVYER(CEFARTLKR)
{NG}M{AG}Y{YG}VS
(LADWVCLAQHES)
{NY}N{TR}A
[TNYN]{RGDQ}[STDY]
{GIFQ}[IN]{SRYW}
CNDGKT{PR}AVN{AC}GIN
(CSALL)QDD(ITAAIQCAKRVV)
{R}D{PQ}(GIRA)W(VAWRAH)
{CQN}RDL(SQY){IRN}CGV
(No signal in data)
KILK(KQELCKNLVA)
{QG}M{NG}Y{QH}IT
(LPNWVCTAFHES)
{SY}N{TR}A
[TNHN]{TDG}[STDY]
{GILQ}[IN]{SRYW}
CHDGKT{PG}SKN{AC}NIS
(CSKLL)DDD(ITDDLKCAKKIA)
{G}E{AK}(GLTP)W(VAWKSK)
{CRG}HDL(SKF)KC
By Mary Anne Clark