Работа с Prosite

Prosite.
1) Паттерн по множественному выравниванию.
ENO_PSEPK: MIELDGTENKAKLGANAILAVSLAAAKAAA
ENO1_PSESM:MIALDATENKASLGANAILAVSLAAAKAAA
ENO_ACIAD: MIELDGTENKEKLGANATLAVSLAAARAAA
ENO_BACCZ: MIELDGTPNKGKLGANAILGVSMAVAHAAA
ENO_CORDI: MIALDGTENKSRLGANAILGVSIAVAKAAA
ENO_RALSO: LIDLDGTENKGRLGANATLAVSMAVAKAAA
ENO_BUCAI: MIDLDGTINKSKLGANAILSVSLAVAKAAA
ENO_BUCAP: MINLDGTENKSNLGSNSILSVSLATAKAAA
ENO_WIGBR: MINLDGTKNKSNLGANAILAVSLANAKAAS
ENO_BUCBP: MINLDGTKNKSKIGANSILSVSIATAKAAA
Вид паттерна: [ML]-I-X-L-D-[GA]-T-X-N-K-X(2)-[LI]-G-[AS]-N-[AS]-[IT]-L-X-V-S[LMI]-A-X-A-[KRH]-A-A-[AS].
2) Поиск по паттерну в банке данных SWISS-Prot.
Результаты:
o Мотив, удовлетворяющий паттерну, найден в 76 последовательностях.
o Найдены ВСЕ(!) последовательности из данного выравнивания.
o Ни у одной из последовательностей название не «выбивается» из
общего ряда, у всех в названии есть ENO.
3) Все известные паттерны в белке ENO_ECOLI.
Известные сайты и мотивы в белке ENO_ECOLI.
Идентификатор
документа
PROSITE
(AC)
Идентификато
р документа
с описанием
мотива
Название мотива
PS00008
PDOC00008
Сайт
Nмиристоилирования
PS00001
PDOC00001
PS00005
PDOC00006
PS00006
PDOC00006
PS00007
PDOC00007
PS00009
PDOC00009
Паттерн
(регулярное
выражение)
Насколько
подпись
специфична
?
Сколько
мотивов
нашлось
в белке?
паттерн
G-[GASVMLIQ]x(2)-[GAST][MSLVDIQG]
неспецифич
на
11
паттерн
N-K-S-K
неспецифич
на
1
паттерн
[TS]-x-[KR]
неспецифич
на
3
паттерн
[TS]-x(2)-[ED]
неспецифич
на
8
паттерн
KmakDag.Y
специфична
1
паттерн
n-G-R-K
неспецифич
на
1
Тип
подписи
(паттерн,
профиль)
Например,
Сайт Nгликозилирования
Сайт
фосфорилирования
протеинкиназой С
Сайт
фосфорилирования
казеинкиназой II
Сайт
фосфорилирования
тирозинкиназой
Сайт
амидирования