Зачетное задание №1 (FAR+EXCEL)

advertisement
Зачетное задание №1 (FAR+EXCEL)
Преподаватели сначала оценят качество выполнения обязательного минимума, а затем
количество выполненных заданий.
Обязательный минимум, вариант 1
0. Приведите рабочую директорию в порядок .
В каталоге Н:\ должен быть только подкаталог Н:\Term1 (1-ый семестр), а в нем – только два
подподкаталога Practices и Credits, Practices – для занятий; Credits – для зачетных заданий. В
подподкаталоге Practices - подподподкаталог Practic2 и Practic3 с рабочими файлами 2-го и 3-его
занятия, а в подподкаталоге Credits – Credit1. Из подподподкаталога Credit2 все перенесите в
Practic3.
1. Покажите преподавателю, как с помощью одной команды FAR manager Вы можете
изменить конфигурацию панели, т.е. сделать описание файлов более или менее подробным.
Для 2-х конфигураций (на Ваш выбор) объяснить, какие свойства файлов отображены на
панели.
2. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein.xls (ср. с
упр.3 занятия 3).
Данные находятся в файле AA_Eisenberg.txt на диске Р:\ .
Учтите, что
а) прежде, чем работать с файлом, скопируйте его в свою рабочую директорию!
в) преподаватель может подойти и спросить, какие именно свойства аминокислот
характеризуют данные файла;
с) в файле может быть полезный для Вас комментарий, который также имеет смысл любым
разумным образом включить в таблицу.
Файл My_Protein.xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
3. Используя редактор в FAR manager, а также файлы, созданные на занятиях 2 и 3, опишите
главные результаты данного этапа Вашего исследования. Сохраните отчет в виде файла
H:\Term1\Credits\Credit1\My_Conclusions.txt.
Формат отчета:
1. Имя генома. (см. тетрадь или файл Ecoli.embl).
2. Имя гена, его положение в геноме (см. файл *.cds).
3. Имя белка (см. файл *. aaf).
4. Аминокислотная последовательность в формате FASTA, (см. файл *. aaf).
5. Молекулярный вес белка (см. файл My_Protein.xls).
6. Аминокислотный состав белка (см. файл My_Protein.xls).
7. Словесное описание результатов сравнения со средним аминокислотным составом разных
групп белков (см. файл My_Protein.xls).
8. Любые другие Ваши наблюдения.
Дополнительные задания (для тех, кто хочет получить более 20 баллов)
4. Сравните аминокислотный состав Вашего белка со средним аминокислотным составом
белков 2-х структурных классов. Сопоставьте с результатами упр.6 занятия 3 и выскажите
предположение о том, можно ли отнести Ваш белок к какому-либо классу, или нет.
Результаты сохраните на отдельном листе в книге My_Protein.xls.
Данные о среднем аминокислотном составе -спиральных белков и -структурных белков
можно найти в файле A_B_F.txt на диске Р:\.
Файл My_Protein.xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
5. Найдите не менее 5-ти различий между файлами a11.txt и a12.txt на диске Р:\
(см. упр.6 на занятии 2).
Результаты описать в файле H:\Term1\Credits\Credit1\File_comp.txt.
6. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein.xls .
Новые данные можно найти в текстовых файлах, лежащих в директории
P:\Term1\DATA\Credit1\AA_Properties.
1
Зачетное задание №1 (FAR+EXCEL)
Преподаватели сначала оценят качество выполнения обязательного минимума, а затем
количество выполненных заданий.
Обязательный минимум, вариант 2
0. Приведите рабочую директорию в порядок .
В каталоге Н:\ должен быть только подкаталог Н:\Term1 (1-ый семестр), а в нем – только два
подподкаталога Practices и Credits, Practices – для занятий; Credits – для зачетных заданий. В
подподкаталоге Practices - подподподкаталог Practic2 и Practic3 с рабочими файлами 2-го и 3-его
занятия, а в подподкаталоге Credits – Credit1. Из подподподкаталога Credit2 все перенесите в
Practic3.
1. Покажите преподавателю, как с помощью одной команды FAR manager Вы можете
а) перейти с одной панели на другую;
в) сменить текущий диск панели.
2. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein.xls (ср. с
упр.3 занятия 3).
Данные находятся в файле AA_common_opinion.txt на диске Р:\ . Замените в новых столбцах
“-“ на 0, а “X” на 1.
Учтите, что
а) прежде, чем работать с файлом, скопируйте его в свою рабочую директорию!
в) преподаватель может подойти и спросить, какие именно свойства аминокислот
характеризуют данные файла;
с) в файле может быть полезный для Вас комментарий, который также имеет смысл любым
разумным образом включить в таблицу.
Файл My_Protein.xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
3. Используя редактор в FAR manager, а также файлы, созданные на занятиях 2 и 3, опишите
главные результаты данного этапа Вашего исследования. Сохраните отчет в виде файла
H:\Term1\Credits\Credit1\My_Conclusions.txt.
Формат отчета:
Имя генома. (см. тетрадь или файл Ecoli.embl).
Имя гена, его положение в геноме (см. файл *.cds).
Имя белка (см. файл *. aaf).
Аминокислотная последовательность в формате FASTA, (см. файл *. aaf).
Молекулярный вес белка (см. файл My_Protein.xls).
Аминокислотный состав белка (см. файл My_Protein.xls).
Словесное описание результатов сравнения со средним аминокислотным составом разных
групп белков (см. файл My_Protein.xls).
8. Любые другие Ваши наблюдения.
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
Дополнительные задания (для тех, кто хочет получить более 20 баллов)
4. Сравните аминокислотный состав Вашего белка со средним аминокислотным составом
белков 2-х структурных классов. Сопоставьте с результатами упр.6 занятия 3 и выскажите
предположение о том, можно ли отнести Ваш белок к какому-либо классу, или нет.
Результаты сохраните на отдельном листе в книге My_Protein.xls.
Данные о среднем аминокислотном составе -спиральных белков и -структурных белков
можно найти в файле A_B_F.txt на диске Р:\.
Файл My_Protein.xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
5. Найдите не менее 5-ти различий между файлами a11.txt и a12.txt на диске Р:\
(см. упр.6 на занятии 2).
Результаты описать в файле H:\Term1\Credits\Credit1\File_comp.txt.
6. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein.xls .
Новые данные можно найти в текстовых файлах, лежащих в директории
P:\Term1\DATA\Credit1\AA_Properties.
2
Зачетное задание №1 (FAR+EXCEL)
Преподаватели сначала оценят качество выполнения обязательного минимума, а затем
количество выполненных заданий.
Обязательный минимум, вариант 3
0. Приведите рабочую директорию в порядок .
В каталоге Н:\ должен быть только подкаталог Н:\Term1 (1-ый семестр), а в нем – только два
подподкаталога Practices и Credits, Practices – для занятий; Credits – для зачетных заданий. В
подподкаталоге Practices - подподподкаталог Practic2 и Practic3 с рабочими файлами 2-го и 3-его
занятия, а в подподкаталоге Credits – Credit1. Из подподподкаталога Credit2 все перенесите в
Practic3.
1. Покажите преподавателю, как с помощью одной команды FAR manager Вы можете
вывести в неактивной панели общую информацию о диске активной панели, а потом.
вернуть неактивной панели прежний вид.
2. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein.xls (ср. с
упр.3 занятия 3).
Данные находятся в файле AA_common_opinion.txt на диске Р:\ . Замените в новых столбцах
“-“ на 0, а “X” на 1.
Учтите, что
а) прежде, чем работать с файлом, скопируйте его в свою рабочую директорию!
в) преподаватель может подойти и спросить, какие именно свойства аминокислот
характеризуют данные файла;
с) в файле может быть полезный для Вас комментарий, который также имеет смысл любым
разумным образом включить в таблицу.
Файл My_Protein.xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
3. Используя редактор в FAR manager, а также файлы, созданные на занятиях 2 и 3, опишите
главные результаты данного этапа Вашего исследования. Сохраните отчет в виде файла
H:\Term1\Credits\Credit1\My_Conclusions.txt.
Формат отчета:
Имя генома. (см. тетрадь или файл Ecoli.embl).
Имя гена, его положение в геноме (см. файл *.cds).
Имя белка (см. файл *. aaf).
Аминокислотная последовательность в формате FASTA, (см. файл *. aaf).
Молекулярный вес белка (см. файл My_Protein.xls).
Аминокислотный состав белка (см. файл My_Protein.xls).
Словесное описание результатов сравнения со средним аминокислотным составом разных
групп белков (см. файл My_Protein.xls).
8. Любые другие Ваши наблюдения.
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
Дополнительные задания (для тех, кто хочет получить более 20 баллов)
4. Сравните аминокислотный состав Вашего белка со средним аминокислотным составом
белков 2-х структурных классов. Сопоставьте с результатами упр.6 занятия 3 и выскажите
предположение о том, можно ли отнести Ваш белок к какому-либо классу, или нет.
Результаты сохраните на отдельном листе в книге My_Protein.xls.
Данные о среднем аминокислотном составе -спиральных белков и -структурных белков
можно найти в файле A_B_F.txt на диске Р:\.
Файл My_Protein.xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
5. Найдите не менее 5-ти различий между файлами a11.txt и a12.txt на диске Р:\
(см. упр.6 на занятии 2).
Результаты описать в файле H:\Term1\Credits\Credit1\File_comp.txt.
6. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein.xls .
Новые данные можно найти в текстовых файлах, лежащих в директории
P:\Term1\DATA\Credit1\AA_Properties.
3
Зачетное задание №1 (FAR+EXCEL)
Преподаватели сначала оценят качество выполнения обязательного минимума, а затем
количество выполненных заданий.
Обязательный минимум, вариант 4
0. Приведите рабочую директорию в порядок .
В каталоге Н:\ должен быть только подкаталог Н:\Term1 (1-ый семестр), а в нем – только два
подподкаталога Practices и Credits, Practices – для занятий; Credits – для зачетных заданий. В
подподкаталоге Practices - подподподкаталог Practic2 и Practic3 с рабочими файлами 2-го и 3-его
занятия, а в подподкаталоге Credits – Credit1. Из подподподкаталога Credit2 все перенесите в
Practic3.
1. Покажите преподавателю, как с помощью одной команды FAR manager Вы можете
перевести неактивную панель в режим быстрого просмотра содержимого файла, а затем
возвратить панель к первоначальному виду.
2. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein.xls (ср. с
упр.3 занятия 3).
Данные находятся в файле AA_рК.txt на диске Р:\ .
Учтите, что
а) прежде, чем работать с файлом, скопируйте его в свою рабочую директорию!
в) преподаватель может подойти и спросить, какие именно свойства аминокислот
характеризуют данные файла;
с) в файле может быть полезный для Вас комментарий, который также имеет смысл любым
разумным образом включить в таблицу.
Файл My_Protein.xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
3. Используя редактор в FAR manager, а также файлы, созданные на занятиях 2 и 3, опишите
главные результаты данного этапа Вашего исследования. Сохраните отчет в виде файла
H:\Term1\Credits\Credit1\My_Conclusions.txt.
Формат отчета:
Имя генома. (см. тетрадь или файл Ecoli.embl).
Имя гена, его положение в геноме (см. файл *.cds).
Имя белка (см. файл *. aaf).
Аминокислотная последовательность в формате FASTA, (см. файл *. aaf).
Молекулярный вес белка (см. файл My_Protein.xls).
Аминокислотный состав белка (см. файл My_Protein.xls).
Словесное описание результатов сравнения со средним аминокислотным составом разных
групп белков (см. файл My_Protein.xls).
8. Любые другие Ваши наблюдения.
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
Дополнительные задания (для тех, кто хочет получить более 20 баллов)
4. Сравните аминокислотный состав Вашего белка со средним аминокислотным составом
белков 2-х структурных классов. Сопоставьте с результатами упр.6 занятия 3 и выскажите
предположение о том, можно ли отнести Ваш белок к какому-либо классу, или нет.
Результаты сохраните на отдельном листе в книге My_Protein.xls.
Данные о среднем аминокислотном составе -спиральных белков и -структурных белков
можно найти в файле A_B_F.txt на диске Р:\.
Файл My_Protein.xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
5. Найдите не менее 5-ти различий между файлами a11.txt и a12.txt на диске Р:\
(см. упр.6 на занятии 2).
Результаты описать в файле H:\Term1\Credits\Credit1\File_comp.txt.
6. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein.xls .
Новые данные можно найти в текстовых файлах, лежащих в директории
P:\Term1\DATA\Credit1\AA_Properties.
4
Материалы к занятию 4
Зачетное задание №1 (FAR+EXCEL)
Преподаватели сначала оценят качество выполнения обязательного минимума, а затем
количество выполненных заданий.
Обязательный минимум, вариант 5
0. Приведите рабочую директорию в порядок .
В каталоге Н:\ должен быть только подкаталог Н:\Term1 (1-ый семестр), а в нем – только два
подподкаталога Practices и Credits, Practices – для занятий; Credits – для зачетных заданий. В
подподкаталоге Practices - подподподкаталог Practic2 и Practic3 с рабочими файлами 2-го и 3-его
занятия, а в подподкаталоге Credits – Credit1. Из подподподкаталога Credit2 все перенесите в
Practic3.
1. Покажите преподавателю, как с помощью одной команды FAR manager Вы можете
сравнить содержимое 2-х директорий.
2. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein.xls (ср. с
упр.3 занятия 3).
Данные находятся в файле AA_рК.txt на диске Р:\ .
Учтите, что
а) прежде, чем работать с файлом, скопируйте его в свою рабочую директорию!
в) преподаватель может подойти и спросить, какие именно свойства аминокислот
характеризуют данные файла;
с) в файле может быть полезный для Вас комментарий, который также имеет смысл любым
разумным образом включить в таблицу.
Файл My_Protein.xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
3. Используя редактор в FAR manager, а также файлы, созданные на занятиях 2 и 3, опишите
главные результаты данного этапа Вашего исследования. Сохраните отчет в виде файла
H:\Term1\Credits\Credit1\My_Conclusions.txt.
Формат отчета:
Имя генома. (см. тетрадь или файл Ecoli.embl).
Имя гена, его положение в геноме (см. файл *.cds).
Имя белка (см. файл *. aaf).
Аминокислотная последовательность в формате FASTA, (см. файл *. aaf).
Молекулярный вес белка (см. файл My_Protein.xls).
Аминокислотный состав белка (см. файл My_Protein.xls).
Словесное описание результатов сравнения со средним аминокислотным составом
разных групп белков (см. файл My_Protein.xls).
8. Любые другие Ваши наблюдения.
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
Дополнительные задания (для тех, кто хочет получить более 20 баллов)
4. Сравните аминокислотный состав Вашего белка со средним аминокислотным составом
белков 2-х структурных классов. Сопоставьте с результатами упр.6 занятия 3 и выскажите
предположение о том, можно ли отнести Ваш белок к какому-либо классу, или нет.
Результаты сохраните на отдельном листе в книге My_Protein.xls.
Данные о среднем аминокислотном составе -спиральных белков и -структурных белков
можно найти в файле A_B_F.txt на диске Р:\.
Файл My_Protein.xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
5. Найдите не менее 5-ти различий между файлами a11.txt и a12.txt на диске Р:\
(см. упр.6 на занятии 2).
Результаты описать в файле H:\Term1\Credits\Credit1\File_comp.txt.
6. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein.xls .
Новые данные можно найти в текстовых файлах, лежащих в директории
P:\Term1\DATA\Credit1\AA_Properties.
5
Зачетное задание №1 (FAR+EXCEL)
Преподаватели сначала оценят качество выполнения обязательного минимума, а затем
количество выполненных заданий.
Обязательный минимум, вариант 6
0. Приведите рабочую директорию в порядок .
В каталоге Н:\ должен быть только подкаталог Н:\Term1 (1-ый семестр), а в нем – только два
подподкаталога Practices и Credits, Practices – для занятий; Credits – для зачетных заданий. В
подподкаталоге Practices - подподподкаталог Practic2 и Practic3 с рабочими файлами 2-го и 3-его
занятия, а в подподкаталоге Credits – Credit1. Из подподподкаталога Credit2 все перенесите в
Practic3.
1. Покажите преподавателю, как с помощью одной команды FAR manager Вы можете
сортировать файлы. Покажите не менее 2-х примеров сортировки по разным признакам.
2. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein.xls (ср. с
упр.3 занятия 3).
Данные находятся в файле AA_Eisenberg.txt на диске Р:\ .
Учтите, что
а) прежде, чем работать с файлом, скопируйте его в свою рабочую директорию!
в) преподаватель может подойти и спросить, какие именно свойства аминокислот
характеризуют данные файла;
с) в файле может быть полезный для Вас комментарий, который также имеет смысл любым
разумным образом включить в таблицу.
Файл My_Protein.xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
3. Используя редактор в FAR manager, а также файлы, созданные на занятиях 2 и 3, опишите
главные результаты данного этапа Вашего исследования. Сохраните отчет в виде файла
H:\Term1\Credits\Credit1\My_Conclusions.txt.
Формат отчета:
1. Имя генома. (см. тетрадь или файл Ecoli.embl).
2. Имя гена, его положение в геноме (см. файл *.cds).
3. Имя белка (см. файл *. aaf).
4. Аминокислотная последовательность в формате FASTA, (см. файл *. aaf).
5. Молекулярный вес белка (см. файл My_Protein.xls).
6. Аминокислотный состав белка (см. файл My_Protein.xls).
7. Словесное описание результатов сравнения со средним аминокислотным составом разных
групп белков (см. файл My_Protein.xls).
8. Любые другие Ваши наблюдения.
Дополнительные задания (для тех, кто хочет получить более 20 баллов)
4. Сравните аминокислотный состав Вашего белка со средним аминокислотным составом
белков 2-х структурных классов. Сопоставьте с результатами упр.6 занятия 3 и выскажите
предположение о том, можно ли отнести Ваш белок к какому-либо классу, или нет.
Результаты сохраните на отдельном листе в книге My_Protein.xls.
Данные о среднем аминокислотном составе -спиральных белков и -структурных белков
можно найти в файле A_B_F.txt на диске Р:\.
Файл My_Protein.xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
5. Найдите не менее 5-ти различий между файлами a11.txt и a12.txt на диске Р:\
(см. упр.6 на занятии 2).
Результаты описать в файле H:\Term1\Credits\Credit1\File_comp.txt.
6. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein.xls .
Новые данные можно найти в текстовых файлах, лежащих в директории
P:\Term1\DATA\Credit1\AA_Properties.
6
Зачетное задание №1 (FAR+EXCEL)
Преподаватели сначала оценят качество выполнения обязательного минимума, а затем
количество выполненных заданий.
Обязательный минимум, вариант 7
0. Приведите рабочую директорию в порядок .
В каталоге Н:\ должен быть только подкаталог Н:\Term1 (1-ый семестр), а в нем – только два
подподкаталога Practices и Credits, Practices – для занятий; Credits – для зачетных заданий. В
подподкаталоге Practices - подподподкаталог Practic2 и Practic3 с рабочими файлами 2-го и 3-его
занятия, а в подподкаталоге Credits – Credit1. Из подподподкаталога Credit2 все перенесите в
Practic3.
1. Покажите преподавателю, как с помощью одной команды FAR manager Вы можете
а) выделить файл;
в) снять выделение;
с) выделить группу файлов;
d) снять выделение.
2. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein.xls (ср. с
упр.3 занятия 3).
Данные находятся в файле AA_K&D.txt на диске Р:\ .
Учтите, что
а) прежде, чем работать с файлом, скопируйте его в свою рабочую директорию!
в) преподаватель может подойти и спросить, какие именно свойства аминокислот
характеризуют данные файла;
с) в файле может быть полезный для Вас комментарий, который также имеет смысл любым
разумным образом включить в таблицу.
Файл My_Protein.xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
3. Используя редактор в FAR manager, а также файлы, созданные на занятиях 2 и 3, опишите
главные результаты данного этапа Вашего исследования. Сохраните отчет в виде файла
H:\Term1\Credits\Credit1\My_Conclusions.txt.
Формат отчета:
Имя генома. (см. тетрадь или файл Ecoli.embl).
Имя гена, его положение в геноме (см. файл *.cds).
Имя белка (см. файл *. aaf).
Аминокислотная последовательность в формате FASTA, (см. файл *. aaf).
Молекулярный вес белка (см. файл My_Protein.xls).
Аминокислотный состав белка (см. файл My_Protein.xls).
Словесное описание результатов сравнения со средним аминокислотным составом
разных групп белков (см. файл My_Protein.xls).
8. Любые другие Ваши наблюдения.
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
Дополнительные задания (для тех, кто хочет получить более 20 баллов)
4. Сравните аминокислотный состав Вашего белка со средним аминокислотным составом
белков 2-х структурных классов. Сопоставьте с результатами упр.6 занятия 3 и выскажите
предположение о том, можно ли отнести Ваш белок к какому-либо классу, или нет.
Результаты сохраните на отдельном листе в книге My_Protein.xls.
Данные о среднем аминокислотном составе -спиральных белков и -структурных белков
можно найти в файле A_B_F.txt на диске Р:\.
Файл My_Protein.xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
5. Найдите не менее 5-ти различий между файлами a11.txt и a12.txt на диске Р:\
(см. упр.6 на занятии 2).
Результаты описать в файле H:\Term1\Credits\Credit1\File_comp.txt.
6. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein.xls .
Новые данные можно найти в текстовых файлах, лежащих в директории
P:\Term1\DATA\Credit1\AA_Properties.
7
Зачетное задание №1 (FAR+EXCEL)
Преподаватели сначала оценят качество выполнения обязательного минимума, а затем
количество выполненных заданий.
Обязательный минимум, вариант 8
0. Приведите рабочую директорию в порядок .
В каталоге Н:\ должен быть только подкаталог Н:\Term1 (1-ый семестр), а в нем – только два
подподкаталога Practices и Credits, Practices – для занятий; Credits – для зачетных заданий. В
подподкаталоге Practices - подподподкаталог Practic2 и Practic3 с рабочими файлами 2-го и 3-его
занятия, а в подподкаталоге Credits – Credit1. Из подподподкаталога Credit2 все перенесите в
Practic3.
1. Покажите преподавателю, как с помощью одной команды FAR manager Вы можете
a. выделить группу файлов;
b. скопировать выделенную группу в другую директорию
c. и удалить.
2. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein.xls (ср. с
упр.3 занятия 3).
Данные находятся в файле AA_Hexp.txt на диске Р:\ .
Учтите, что
а) прежде, чем работать с файлом, скопируйте его в свою рабочую директорию!
в) преподаватель может подойти и спросить, какие именно свойства аминокислот
характеризуют данные файла;
с) в файле может быть полезный для Вас комментарий, который также имеет смысл любым
разумным образом включить в таблицу.
Файл My_Protein.xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
3. Используя редактор в FAR manager, а также файлы, созданные на занятиях 2 и 3, опишите
главные результаты данного этапа Вашего исследования. Сохраните отчет в виде файла
H:\Term1\Credits\Credit1\My_Conclusions.txt.
Формат отчета:
Имя генома. (см. тетрадь или файл Ecoli.embl).
Имя гена, его положение в геноме (см. файл *.cds).
Имя белка (см. файл *. aaf).
Аминокислотная последовательность в формате FASTA, (см. файл *. aaf).
Молекулярный вес белка (см. файл My_Protein.xls).
Аминокислотный состав белка (см. файл My_Protein.xls).
Словесное описание результатов сравнения со средним аминокислотным составом
разных групп белков (см. файл My_Protein.xls).
8. Любые другие Ваши наблюдения.
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
Дополнительные задания (для тех, кто хочет получить более 20 баллов)
4. Сравните аминокислотный состав Вашего белка со средним аминокислотным составом
белков 2-х структурных классов. Сопоставьте с результатами упр.6 занятия 3 и выскажите
предположение о том, можно ли отнести Ваш белок к какому-либо классу, или нет.
Результаты сохраните на отдельном листе в книге My_Protein.xls.
Данные о среднем аминокислотном составе -спиральных белков и -структурных белков
можно найти в файле A_B_F.txt на диске Р:\.
Файл My_Protein.xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
5. Найдите не менее 5-ти различий между файлами a11.txt и a12.txt на диске Р:\
(см. упр.6 на занятии 2).
Результаты описать в файле H:\Term1\Credits\Credit1\File_comp.txt.
6. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein.xls .
Новые данные можно найти в текстовых файлах, лежащих в директории
P:\Term1\DATA\Credit1\AA_Properties.
8
Материалы к занятию 4
Зачетное задание №1 (FAR+EXCEL)
Преподаватели сначала оценят качество выполнения обязательного минимума, а затем
количество выполненных заданий.
Обязательный минимум, вариант 9
0. Приведите рабочую директорию в порядок .
В каталоге Н:\ должен быть только подкаталог Н:\Term1 (1-ый семестр), а в нем – только два
подподкаталога Practices и Credits, Practices – для занятий; Credits – для зачетных заданий. В
подподкаталоге Practices - подподподкаталог Practic2 и Practic3 с рабочими файлами 2-го и 3-его
занятия, а в подподкаталоге Credits – Credit1. Из подподподкаталога Credit2 все перенесите в
Practic3.
1. Покажите преподавателю, как с помощью одной команды FAR manager Вы можете
a. выделить группу файлов;
b. переименовать файлы, оставив их в прежней директории.
2. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein.xls (ср. с
упр.3 занятия 3).
Данные находятся в файле AA_K&D.txt на диске Р:\ .
Учтите, что
а) прежде, чем работать с файлом, скопируйте его в свою рабочую директорию!
в) преподаватель может подойти и спросить, какие именно свойства аминокислот
характеризуют данные файла;
с) в файле может быть полезный для Вас комментарий, который также имеет смысл любым
разумным образом включить в таблицу.
Файл My_Protein.xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
3. Используя редактор в FAR manager, а также файлы, созданные на занятиях 2 и 3, опишите
главные результаты данного этапа Вашего исследования. Сохраните отчет в виде файла
H:\Term1\Credits\Credit1\My_Conclusions.txt.
Формат отчета:
Имя генома. (см. тетрадь или файл Ecoli.embl).
Имя гена, его положение в геноме (см. файл *.cds).
Имя белка (см. файл *. aaf).
Аминокислотная последовательность в формате FASTA, (см. файл *. aaf).
Молекулярный вес белка (см. файл My_Protein.xls).
Аминокислотный состав белка (см. файл My_Protein.xls).
Словесное описание результатов сравнения со средним аминокислотным составом
разных групп белков (см. файл My_Protein.xls).
8. Любые другие Ваши наблюдения.
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
Дополнительные задания (для тех, кто хочет получить более 20 баллов)
4. Сравните аминокислотный состав Вашего белка со средним аминокислотным составом
белков 2-х структурных классов. Сопоставьте с результатами упр.6 занятия 3 и выскажите
предположение о том, можно ли отнести Ваш белок к какому-либо классу, или нет.
Результаты сохраните на отдельном листе в книге My_Protein.xls.
Данные о среднем аминокислотном составе -спиральных белков и -структурных белков
можно найти в файле A_B_F.txt на диске Р:\.
Файл My_Protein.xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
5. Найдите не менее 5-ти различий между файлами a11.txt и a12.txt на диске Р:\
(см. упр.6 на занятии 2).
Результаты описать в файле H:\Term1\Credits\Credit1\File_comp.txt.
6. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein.xls .
Новые данные можно найти в текстовых файлах, лежащих в директории
P:\Term1\DATA\Credit1\AA_Properties.
9
Зачетное задание №1 (FAR+EXCEL)
Преподаватели сначала оценят качество выполнения обязательного минимума, а затем
количество выполненных заданий.
Обязательный минимум, вариант 10
0. Приведите рабочую директорию в порядок .
В каталоге Н:\ должен быть только подкаталог Н:\Term1 (1-ый семестр), а в нем – только два
подподкаталога Practices и Credits, Practices – для занятий; Credits – для зачетных заданий. В
подподкаталоге Practices - подподподкаталог Practic2 и Practic3 с рабочими файлами 2-го и 3-его
занятия, а в подподкаталоге Credits – Credit1. Из подподподкаталога Credit2 все перенесите в
Practic3.
1. Покажите преподавателю, как с помощью FAR manager Вы можете
a.
b.
c.
d.
создать новый файл;
написать слово «файл»;
сохранить файл;
просмотреть содержимое файла.
2. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein.xls (ср. с
упр.3 занятия 3).
Данные находятся в файле AA_Hexp.txt на диске Р:\ .
Учтите, что
а) прежде, чем работать с файлом, скопируйте его в свою рабочую директорию!
в) преподаватель может подойти и спросить, какие именно свойства аминокислот
характеризуют данные файла;
с) в файле может быть полезный для Вас комментарий, который также имеет смысл любым
разумным образом включить в таблицу.
Файл My_Protein.xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
3. Используя редактор в FAR manager, а также файлы, созданные на занятиях 2 и 3, опишите
главные результаты данного этапа Вашего исследования. Сохраните отчет в виде файла
H:\Term1\Credits\Credit1\My_Conclusions.txt.
Формат отчета:
Имя генома. (см. тетрадь или файл Ecoli.embl).
Имя гена, его положение в геноме (см. файл *.cds).
Имя белка (см. файл *. aaf).
Аминокислотная последовательность в формате FASTA, (см. файл *. aaf).
Молекулярный вес белка (см. файл My_Protein.xls).
Аминокислотный состав белка (см. файл My_Protein.xls).
Словесное описание результатов сравнения со средним аминокислотным составом
разных групп белков (см. файл My_Protein.xls).
8. Любые другие Ваши наблюдения.
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
Дополнительные задания (для тех, кто хочет получить более 20 баллов)
4. Сравните аминокислотный состав Вашего белка со средним аминокислотным составом
белков 2-х структурных классов. Сопоставьте с результатами упр.6 занятия 3 и выскажите
предположение о том, можно ли отнести Ваш белок к какому-либо классу, или нет.
Результаты сохраните на отдельном листе в книге My_Protein.xls.
Данные о среднем аминокислотном составе -спиральных белков и -структурных белков
можно найти в файле A_B_F.txt на диске Р:\.
Файл My_Protein.xls сохраните в директории H:\Term1\Credits\Credit1\
5. Найдите не менее 5-ти различий между файлами a11.txt и a12.txt на диске Р:\
(см. упр.6 на занятии 2).
Результаты описать в файле H:\Term1\Credits\Credit1\File_comp.txt.
6. Включите новые данные в таблицу «Свойства аминокислот» в книге My_Protein.xls .
Новые данные можно найти в текстовых файлах, лежащих в директории
P:\Term1\DATA\Credit1\AA_Properties.
10
11
Download