Лаборатория молекулярно-генетической диагностики

advertisement
СОЛИДНЫЕ ОПУХОЛИ ДЕТСКОГО ВОЗРАСТА
Лаборатория молекулярно-генетической диагностики Национального института рака ***г. Киев, ул. Ломоносова 33/43***
Маркер
Метод
исследования
Биоматериал для
исследования
Генетические
перестройки
хромосомы 22q12
(транслокации:
t(11;22), t(21;22),
t(7;22), t(17;22),
t(2;22))
FISH
(виявление
генетических
перестроек
хромосомы
22q12);
PCR
(виявление
химерных
транскриптов:
EWS-FLI1,
EWS-ERG,
EWS-FEV,
EWS-ETV1,
EWS-ETV4)
Опухолевая ткань,
парафинированная
опухолевая ткань
FISH
(виявление
генетических
перестроек
хромосомы
13q14);
PCR
(виявление
химерных
транскриптов
Опухолевая ткань,
парафинированная
опухолевая ткань
Генетические
перестройки
хромосомы 13q14
(транслокации:
t(1;13), t(2;13))
PAX3-FOXO1,
PAX7-FOXO1)
Костный мозг
Костный мозг
Каким пациентам
необходимо проводить
исследование
Пациентам с подозрением
на
саркому
Юинга/
примитивную
нейроэктодермальную
опухоль
Пациентам
с
верифицированным
диагнозом саркома Юинга
или
примитивнаю
нейроэктодермальнаю
опухоль
Цель исследования
Данный анализ необходим при
проведении дифференциальной
диагностики опухолей из малых
округлых клеток.
Наличие
транслокации является четким
диагностическим
маркером
саркомы Юинга и примитивной
нейроэктодермальной опухоли
Сроки
выполнения
анализа
FISH:
7-14 рабочих дней
PCR:
5-7 рабочих дней
Исследование позволяет выявить
в костном мозге метастазы (в
том числе микрометастазы)
саркомы
Юинга/примитивной
нейроэктодермальной опухоли
Пациентам з диагнозом Исследование необходимо для
рабдомиосаркома
уточнения
подтипа
рабдомиосаркомы и выбора
тактики
лечения.
Наличие
транслокации является четким
диагностическим
и
прогностичнским
маркером
альвеолярного
подтипа
рабдомиосаркомы
Пациентам з диагнозом Исследование позволяет выявить
рабдомиосаркома
в костном мозге метастазы (в
том числе микрометастазы)
альвеолярной рабдомиосаркомы
FISH:
7-14 рабочих дней
PCR:
5-7 рабочих дней
Примечания:
PCR (Polymerase Chain Reaction) – Полимеразная цепная реакция; FISH (Fluorescence in situ Hybridization) – флюоресцентная гибридизация in situ
СОЛИДНЫЕ ОПУХОЛИ ДЕТСКОГО ВОЗРАСТА
Лаборатория молекулярно-генетической диагностики Национального института рака ***г. Киев, ул. Ломоносова 33/43***
Маркер
Метод
исследования
Биоматериал для
исследования
Генетические
перестройки
хромосомы 18q11
(транслокации:
t(Х;18)(p11.23;q11),
t(X;18)(p11.21;q11))
FISH
(виявление
генетических
перестроек
хромосомы
18q11);
PCR
(виявление
химерных
транскриптов
SYT-SSX1
SYT-SSX2)
Опухолевая ткань,
парафинированная
опухолевая ткань
Генетические
перестройки
хромосомы 12q13
(транслокации:
TVS/EWS-CHOP
t(12;16)(q13;p11)
t(12;22)(q13;q12))
FISH
Опухолевая ткань,
парафинированная
опухолевая ткань
Делеция участка
хромосомы 1p36
(1p36 LOH)
FISH
Костный мозг
Костный мозг
Опухолевая ткань,
парафинированная
опухолевая ткань
Каким пациентам
Цель исследования
необходимо проводить
исследование
Пациентам с подозрением Данный анализ необходим при
на синовиальную саркому проведении дифференциальной
диагностики опухолей из малых
округлых клеток.
Наличие
транслокации является четким
диагностическим
и прогностическим маркером
синовиальной саркомы
Сроки
выполнения
анализа
FISH:
7-14 рабочих дней
PCR:
5-7 рабочих дней
Пациентам
с верифицированным
диагнозом синовиальная
саркома
Исследование позволяет выявить
в костном мозге метастазы (в
том числе микрометастазы)
синовиальной саркомы
Пациентам с подозрением
на липосаркому
Наличие транслокации является
четким
диагностическим
маркером
липосаркомы
(миксоидная/кругло7-14 рабочих дней
клеточная/смешанная формы)
Пациентам
с верифицированным
диагнозом липосаркома
Исследование позволяет выявить
в костном мозге метастазы (в
том числе микрометастазы)
липосаркомы
Пациентам
с верифицированным
диагнозом нейробластома
Данный анализ необходим для
уточнения
группы
риска
пациента с нейробластомой 7-14 рабочих дней
и выбора тактики лечения
Примечания:
PCR (Polymerase Chain Reaction) – Полимеразная цепная реакция; FISH (Fluorescence in situ Hybridization) – флюоресцентная гибридизация in situ
СОЛИДНЫЕ ОПУХОЛИ ДЕТСКОГО ВОЗРАСТА
Лаборатория молекулярно-генетической диагностики Национального института рака ***г. Киев, ул. Ломоносова 33/43***
Маркер
Метод
исследования
Биоматериал для
исследования
Делеция участка
хромосомы 11q23
(11q23 LOH)
FISH
Опухолевая ткань,
парафинированная
опухолевая ткань
Каким пациентам
необходимо проводить
исследование
Пациентам
с верифицированным
диагнозом нейробластома
Делеция участка
хромосомы 17p13
(TP53)
FISH
Опухолевая ткань,
парафинированная
опухолевая ткань
Пациентам
с верифицированным
диагнозом нейробластома
Данный анализ необходим для
уточнения
группы
риска
пациента с нейробластомой 7-14 рабочих дней
и выбора тактики лечения
Амплификация
гена MYCN
FISH, PCR
Опухолевая ткань,
парафинированная
опухолевая ткань
Пациентам
с верифицированным
диагнозом нейробластома
Данный анализ необходим для
уточнения
группы
риска
пациента с нейробластомой
и выбора тактики лечения
Костный мозг,
периферическая
кровь
Пациентам
с верифицированным
диагнозом нейробластома
Опухолевая ткань,
парафинированная
опухолевая ткань
Пациентам с подозрением
нейробластому
Опухолевая ткань,
парафинированная
опухолевая ткань
Пациентам
с верифицированным
диагнозом нейробластома
рабдомиосаркома,
саркома Юинга/PNET
Исследование позволяет выявить
в костном мозге метастазы (в
том числе микрометастазы) и
циркулирующие
опухолевые
клетки
нейробластомы 5-7 рабочих дней
в периферической крови
Экспрессия гена ТН является
дополнительным маркером для
дифференциальной диагностики
нейробластомы
Данный анализ необходим для
уточнения
группы
риска
пациента и
выбора тактики 7-14 рабочих дней
лечения
Экспрессия гена
тирозингидроксилазы (TH)
Плоидность ДНК
опухоли
PCR
Проточная
цитофлюориметрия
Цель исследования
Сроки
выполнения
анализа
Данный анализ необходим для
уточнения
группы
риска
пациента с нейробластомой 7-14 рабочих дней
и выбора тактики лечения
FISH:
7-14 рабочих дней
PCR:
5-7 рабочих дней
Примечания:
PCR (Polymerase Chain Reaction) – Полимеразная цепная реакция; FISH (Fluorescence in situ Hybridization) – флюоресцентная гибридизация in situ
ОПУХОЛИ ЛИМФАТИЧЕСКОЙ СИСТЕМЫ
Лаборатория молекулярно-генетической диагностики Национального института рака ***г. Киев, ул. Ломоносова 33/43***
Маркер
Метод
исследования
Биоматериал для
исследования
Реципрокная
транслокация с
вовлечением генов
IGH и CCND1
t(11;14)(q13;q32)
FISH
Опухолевая ткань,
парафинированная
опухолевая ткань
костный мозг
Реципрокная
транслокация с
вовлечением генов
IGH и MALT1
t(14;18)(q32;q21)
FISH
Реципрокная
транслокация с
вовлечением генов
IGH и BCL2
t(14;18)(q32;q21)
PCR
Генетические
перестройки
хромосомы 2р23
(транслокация t(2;5),
EML4-ALK)
FISH
Каким пациентам
необходимо проводить
исследование
Пациентам с диагнозом
лимфома
Опухолевая ткань,
парафинированная
опухолевая ткань
Пациентам с диагнозом
лимфома
Опухолевая ткань,
парафинированная
опухолевая ткань
Пациентам с диагнозом
лимфома
Опухолевая ткань,
парафинированная
опухолевая ткань
Пациентам с диагнозом
анапластическая
крупноклеточная
лимфома
Цель исследования
Данный анализ необходим при
проведении дифференциальной
диагностики лимфом из малых
лимфоцитов.
Транслокация
t(11;14)
является
диагностическим
маркером
лимфомы мантийной зоны
Данный анализ необходим при
проведении дифференциальной
диагностики
лимфом
маргинальной
зоны.
Транслокация t(14;18) является
диагностическим
маркером
MALT-лимфом
Данный анализ необходим при
проведении дифференциальной
диагностики лимфом из малых
лимфоцитов.
Транслокация
t(14;18)
является
диагностическим
маркером
фолликулярной лимфомы, а
также является прогностическим
маркером при некоторых других
подтипах лимфом
Исследование позволяет
определить подтип
анапластической
крупноклеточной лимфомы
Сроки
выполнения
анализа
7-14 рабочих дней
7-14 рабочих дней
7-14 рабочих дней
7-14 рабочих дней
Примечания:
PCR (Polymerase Chain Reaction) – Полимеразная цепная реакция; FISH (Fluorescence in situ Hybridization) – флюоресцентная гибридизация in situ
ОПУХОЛИ ЛИМФАТИЧЕСКОЙ СИСТЕМЫ
Лаборатория молекулярно-генетической диагностики Национального института рака ***г. Киев, ул. Ломоносова 33/43***
Маркер
Метод
исследования
Биоматериал для
исследования
Мутация гена
BRAF V600E
PCR
Опухолевая ткань,
парафинированная
опухолевая ткань,
костный мозг
Реципрокная
транслокация с
вовлечением генов
IGH и MYC
t(8;14)(q24;q32)
Реципрокная
транслокация с
вовлечением генов
IGH и MAF
t(14;16)(q32;q23)
Каким пациентам
необходимо проводить
исследование
Пациентам с диагнозом
лимфома селезенки
Опухолевая ткань,
парафинированная
опухолевая ткань
Пациентам с
установленным диагнозом
гистиоцитоз Х или с
подозрением
на гистиоцитоз Х
Периферична кров
Пациентам с
установленным диагнозом
гистиоцитоз Х
FISH
Опухолевая ткань,
парафинированная
опухолевая ткань
Пациентам с
установленным диагнозом
лимфома
FISH
Костный мозг,
периферическая
кровь
Пациентам с
установленным диагнозом
множественная миелома
Цель исследования
Сроки
выполнения
анализа
Данный анализ необходим при
проведении дифференциальной
диагностики лимфом селезенки.
Мутация гена BRAF V600Е
характерна исключительно для
волосатоклеточного
лейкоза
и
не
встречается
при
неходжкинских лимфомах
Анализ
позволяет
выявить
мутацию V600E гена BRAF,
которая
является 5-10 рабочих дней
дополнительным
диагностическим
маркером
гистиоцитоза Х
Анализ
позволяет
выявить
циркулирующие
опухолевые
клетки с мутацией V600E гена
BRAF в периферической крови
для уточнения группы риска
пациента с гистиоцитозом Х
Данный анализ необходим при
проведении дифференциальной
7-14 рабочих дней
диагностики лимфомы Беркита
Данный анализ необходим для
уточнения
группы
риска
пациента и выбора тактики 7-14 рабочих дней
лечения
Примечания:
PCR (Polymerase Chain Reaction) – Полимеразная цепная реакция; FISH (Fluorescence in situ Hybridization) – флюоресцентная гибридизация in situ
ДРУГИЕ ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫЕ
НОВООБРАЗОВАНИЯ
ОПУХОЛИ ЛИМФАТИЧЕСКОЙ СИСТЕМЫ
Лаборатория молекулярно-генетической диагностики Национального института рака ***г. Киев, ул. Ломоносова 33/43***
Маркер
Метод
исследования
Биоматериал для
исследования
Каким пациентам
необходимо проводить
исследование
Пациентам с
установленным диагнозом
множественная миелома,
В-клеточный хронический
лимфоцитарный
лейкоз/лимфома из малых
лимфоцитов
Делеция участка
хромосомы 17p13
(TP53)
FISH
Костный мозг,
периферическая
кровь
Делеция участка
хромосомы 11q23
FISH
Костный мозг,
периферическая
кровь
Пациентам с
установленным диагнозом
В-клеточный хронический
лимфоцитарный
лейкоз/лимфома из малых
лимфоцитов
Амплификация
гена HER2neu
FISH
Парафинированная
опухолевая ткань
Пациентам с диагнозом
рак
грудной
железы,
которым
планируется
назначение
таргетной
терапии
на
основе
моноклональных
антиHER2-антител
Цель исследования
Сроки
выполнения
анализа
Данный анализ необходим для
уточнения
группы
риска
пациента и выбора тактики
7-14 рабочих дней
лечения
Данный анализ необходим для
уточнения
группы
риска
пациента и выбора тактики 7-14 рабочих дней
лечения
Исследование
амплификации
гена HER2neu методом FISH
является обязательным если
результат
иммуногистохимического
анализа
статуса
HER2neu
опухоли
обозначен как 2+.
Наличие 7-10 рабочих дней
амплификации гена HER2neu
у таких пациентов
является
Пациентам с диагнозом показателем для для назначения
аденокарцинома желудка, таргетной анти-HER2 терапии
которым
планируется
назначение
таргетной
терапии
на
основе
моноклональных
антиHER2-антител
Примечания:
PCR (Polymerase Chain Reaction) – Полимеразная цепная реакция; FISH (Fluorescence in situ Hybridization) – флюоресцентная гибридизация in situ
ДРУГИЕ ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫЕ НОВООБРАЗОВАНИЯ
Лаборатория молекулярно-генетической диагностики Национального института рака ***г. Киев, ул. Ломоносова 33/43***
Маркер
Метод
исследования
Биоматериал для
исследования
Мутации гена
KRAS
PCR
Парафинированная
опухолевая ткань
PCR
Парафинированная
опухолевая ткань
(кодоны 12,13,61,146)
Мутации гена
NRAS
Каким пациентам
необходимо проводить
исследование
Пациентам с диагнозом
колоректальный
рак,
которым
планируется
назначение
таргетной
анти-EGFR терапии
(кодоны 12, 13, 61)
Мутация гена
BRAF V600E
Опухолевая ткань,
парафинированная
опухолевая ткань
Пациентам
с распространенными
стадиями или
неоперабельными
формами меланомы,
пациентам
c метастической
меланомой
Пациентам
новообразованиями
щитовидной железы
Цель исследования
Сроки
выполнения
анализа
Тестирование RAS (KRAS и
NRAS)
позволяет
отобрать
пациентов с диким типом (без
мутации)
генов
RAS
для
назначения таргетной терапии 7-10 рабочих дней
моноклональными антителами,
блокирующими
рецептор
эпидермального фактора роста
(EGFR)
Тестирование
позволяет
отобрать пациентов c наличием
мутации V600E в гене BRAF для
назначения
препаратов,
ингибирующих
активность
даного гена (BRAF-таргетной
терапии).
с Исследование необходимо при 5-7 рабочих дней
проведении дифференциальной
диагностики
фолликулярных
опухолей и папиллярного рака
щитовидной железы. Мутация
гена BRAF V600Е встречается
исключительно
в
опухолях
пациентов с папиллярной и
анапластической карциномой и
отсутствует при фолликулярном,
медуллярном раке, а также та
при
доброкачественных
процессах
Примечания:
PCR (Polymerase Chain Reaction) – Полимеразная цепная реакция; FISH (Fluorescence in situ Hybridization) – флюоресцентная гибридизация in situ
ДРУГИЕ ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫЕ НОВООБРАЗОВАНИЯ
Лаборатория молекулярно-генетической диагностики Национального института рака ***г. Киев, ул. Ломоносова 33/43***
Маркер
Метод
исследования
Биоматериал для
исследования
Генетические
перестройки
хромосомы 2р23
(транслокация t(2;5),
EML4-ALK)
FISH
Парафинированная
опухолевая ткань
Плоидность ДНК
опухоли
Проточная
цитофлюориметрия
Опухолевая ткань,
парафинированная
опухолевая ткань
Каким пациентам
необходимо проводить
исследование
Больным
с
распространенным
немелкоклеточным раком
легкого (прежде всего для
некурящих пациентов с
аденокарциномой
легкого,отрицательным
статусом EGFR, KRAS,
BRAF мутаций в опухоли)
Пациентам с дсагнозом
колоректальный рак, рак
ендометрия (рак тела
матки), рак почки, рак
мочевого пузыря, рак
простаты, рак грудной
железы,
трофобластические
опухоли
Цель исследования
Сроки
выполнения
анализа
Анализ
позволяет
отобрать
пациентов
с
наличием
транслокации
EML4-ALK
в опухоли,
что
является
показателем для назначения 7-10 рабочих дней
таргетного
препарата
–
ингибитора тирозинкинази ALK
Данный анализ необходим для
определения статуса плоидности
ДНК опухоли, что является
прогностическим маркером
течения заболевания, позволяет
уточнить группу риска пациента
и назначить оптимальный
протокол лечения.
7-10 рабочих дней
Примечания:
PCR (Polymerase Chain Reaction) – Полимеразная цепная реакция; FISH (Fluorescence in situ Hybridization) – флюоресцентная гибридизация in situ
Download