1. ПОЯСНИТЕЛЬНАЯ ЗАПИСКА 1.1. Обоснование и место программы в системе подготовки аспиранта Курс «Экология микроорганизмов» представляет собой комплекс теоретических и практических вопросов, характеризующих различные экологические группы организмов, как компонентов биогеоценоза, особенности их строения и функционирования. Курс включает в себя некоторые аспекты общей экологии и предназначен для аспирантов специальности «Ботаника». Курс основан на знаниях, полученных слушателями в результате изучения науки о растительности, экологии растений и альгоиндикации. Специфика предлагаемого курса заключается в обобщении и анализе материала, касающегося особенностей места обитания и функционирования микроорганизмов в различных экосистемах. Курс «Экология микроорганизмов» относится к модулю Специальные дисциплины отрасли науки и научной специальности факультативного блока ФД.А.03 и читается на 1 курсе обучения. 1.2. Цель освоения дисциплины: углубленное изучение теоретических достижений экологии микроорганизмов и совершенствование практических навыков исследования микроорганизмов, изучения их места, роли и значения в экосистемах. 1.3. Задачи, реализуемые в процессе изучения курса В области педагогической деятельности Сформировать у аспирантов глубокие знания о предмете и задачах исследования экологии микроорганизмов, ее различных направлений. Продемонстрировать возможности применения различных современных технологий в обучении и воспитании. Использовать различные технические средства и информационные технологии для обеспечения качества образования. Обеспечить возможность профессионального самообразования и личностного роста через организацию самостоятельной и научно-исследовательской работы для дальнейшего проектирования образовательного маршрута и профессиональной карьеры. В научно-исследовательской деятельности: Изучить разнообразие методов научных исследований в области микробиологии. Научить постановке микробиологического эксперимента и исследованию научного материала. В области культурно-просветительской деятельности: Формировать морально-этический кодекс научного работника. Способствовать выработке активной жизненной позиции в деятельности по улучшению состояния природы. Формировать способность к популяризации профессиональной области знаний. 2 1.4. Планируемые результаты обучения В результате освоения дисциплины аспирант должен: уметь владеть профессиональным языком изучаемой дисциплины, корректно выражать и аргументировано обосновывать основные положение; владеть современными методами поиска, обработки и использования информации, уметь интерпретировать и адаптировать ее; уметь свободно пользоваться данными различных дисциплин, т.е. владеть навыками междисциплинарных исследований; владеть понятийно-категорийным аппаратом изучаемой науки; знать особенности функционирования микробных сообществ и уметь использовать это при характеристике естественных и искусственных сообществ в регионе; свободно ориентироваться в любом из направлений экологии микроорганизмов. 2. СТРУКТУРА И СОДЕРЖАНИЕ ДИСЦИПЛИНЫ 2.1. Содержание тематических разделов 2.1.1. Введение. Понятие о микроорганизмах как сборной биоэкологической группе. Основные таксоны, к которым относятся те или иные группы микроорганизмов. Некоторые известные классификации бактерий и их характеристика. Основы современной систематики микроорганизмов. Характеристика различных типов питания бактерий и их место в биосфере. Особенности функционирования бактерий в различных средах обитания в зависимости от выполняемого типа питания. Круговороты основных биогенных элементов (N2, О2, С2, Н2, S, Р), миграция которых осуществляется при непосредственном участии бактерий. 2.1.2. Основные представители группы. Бактерии как архаичная и анахроничная группа живых организмов на Земле. Строение бактериальной клетки как основа функционирования различных экологических групп микроорганизмов. Закономерности функционирования микробных популяций. Цианобактерии и микроводоросли. Фотоавтотрофный компонент микросообществ. Строение, метаболизм, адаптации группы в связи с местом обитания. Цианобактериальные сообщества: состав, структура, значение в экосистемах. Архебактерии – наиболее архаичная и анахроничная группа прокариот. Характеристика основных групп архебактерии и их роль в биосфере. Основные доказательства древности и примитивности данной группы. 2.1.3.Место и роль микроорганизмов в биосфере Микроорганизмы воздуха, воды и почвы. Распределение в среде обитания. Особенности их жизнедеятельности в воздушной среде и различных типах водоемов. Качественный состав микроорганизмов воздушной и водной сред обитания. Почва как трехфазная среда обитания микроорганизмов. Почвенная микрофлора. Концепции, принципы организации и функционирования микрофлоры почвы. Адаптивные особенности почвенной микрофлоры. Образование подстилки и плодородного слоя почвы различных типов биогеоценозов, как результат деятельности микроорганизмов. Влияние водно-термического режима, физико-химических свойств почвы, климата на МО. 3 Биогеохимическая деятельность микроорганизмов: рудообразование, почвообразование, формирование состава атмосферы. Бактерии – регуляторы газового состава атмосферы. Понятие о синтрофии. Трофические отношения внутри группы редуцентов. Роль бактерий и актиномицетов в процессах почвообразования. Почвенные грибы как основной компонент деструктивной флоры в биогеоценозах. Особенности деструктивной деятельности бактерий, актиномицетов и грибов в различных природных зонах. Микроорганизмы как космополиты. Специфический состав микробиальных ценозов в зависимости от качественного и количественного состава подстилки и типа почвы различных биогеоценозов. Сезонные и несезонные изменения численности почв. Биотические сообщества в зональных типах почв. Географические закономерности в распространении почвенных микроорганизмов. Участие МО в превращении веществ и энергии в экосистемах. Взаимоотношения микрофлоры с высшими растениями и животными. Ризосфера: понятие, состав, факторы, от которых зависит состав и численность. Трофические, метабиотические и метаболические (аллелохимические) взаимоотношения микроорганизмов с другими представителями органического мира. Особенности взаимоотношений внутри группы почвенных микроорганизмов. Влияние антропогенных факторов на состав и функционирование микрофлоры естественных экосистем. Воздействие лесных пожаров на биологическую активность почв. 2.2. Тематическое планирование Название раздела и тем курса Введение Основные представители группы Место и роль микроорганизмов в биосфере ИТОГО Трудоемкость, часов ЛЗ ПЗ Л 2 2 6 СР 16 20 8 20 14 56 Общая трудоемкость дисциплины составляет 2 ЗЕТ, 72 часов. 3. ОРГАНИЗАЦИЯ САМОСТОЯТЕЛЬНОЙ РАБОТЫ АСПИРАНТА 3.1. Технологическая карта Трудое Тематический план Задания для Форма мкость дисциплины самостоятельной работы отчета задани я, часы Характеристика основных Работа с Основными Письменная классификаций бактерий и определителями бактерий и работа 4 микроводорослей. водорослей. Составление таблицы. Метаболизм бактерий Заполнение таблицы Устный ответ на 3 семинаре 4 Роль микроорганизмов в круговоротах основных биогенных элементов. Характеристика известных классификаций цианобактерий. Экологические классификации цианобактерий и микроводорослей. Роль бактерий в экосистемах. Цианобактериальные комплексы и их значение. Характеристика почвы как среды обитания микроорганизмов. ИТОГО Работа с научной литературой, анализ схем круговоротов, их описание. Работа с классификаторами отечественных и зарубежных авторов Составление обзорного реферата Подготовка ЭУ Устный ответ на семинаре Письменная работа Устный ответ на семинаре Защита 9 10 10 10 Заполнение таблицы Письменная работа 10 56 4. ФОРМЫ КОНТРОЛЯ РЕЗУЛЬТАТОВ ОБУЧЕНИЯ 1. Обсуждение выполненных самостоятельных работ на семинарских занятиях. 2. Защита рефератов. 5. УЧЕБНО-МЕТОДИЧЕСКОЕ И ИНФОРМАЦИОННОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ ДИСЦИПЛИНЫ 5.1 Основная литература 1. Гусев М. В. Микробиология : учебник для вузов по направлению "Биология" и биол. специальностям : рек. М-вом образования РФ / М. В. Гусев, Л. А. Минеева. - Москва : Академия, 2010. - 464 с. : ил., табл. - (Классическая учебная книга) (Высшее образование) (Classicus). - Библиогр.: с. 440-441. - Указ.: с. 442-457. - ISBN 978-57695-7372-9. 2. Нетрусов А. И. Микробиология : учебник для вузов по направлению "Биология" и биологическим специальностям : доп. М-вом образования и науки РФ / А. И. Нетрусов, И. Б. Котова. - Москва : Академия, 2009. - 352 с. : ил. - (Высшее профессиональное образование. Естественные науки). - Библиогр.: с. 341-342. - Предм. указ.: с. 343-347. - ISBN 978-5-7695-6632-5. 3. Щелкунов С. Н. Генетическая инженерия [Электронный ресурс] : учебное пособие для вузов по направлению "Биология" и специальностям "Биотехнология", "Биохимия", "Генетика", "Микробиология" : рек. М-вом образования РФ / С. Н. Щелкунов. - Новосибирск : Сиб. университетское изд-во, 2010. - 514 с. : ил., табл., схемы - Режим доступа: http://www.biblioclub.ru/book/57527/. - Доступна эл. версия. ЭБС "Университетская библиотека ONLINE". - ISBN 978-5-379-01064-5. 5.2 Дополнительная и научная литература 1. Бабьева И. П. Биология почв : учебник для ун-тов по специальности "Агрохимия и почвоведение" : доп. Гос. ком. СССР по нар. образованию / И. П. Бабьева, Г. М. Зенова ; под ред. Д. Г. Звягинцева. - Москва : Моск. ун-т, 1989. - 336 с. : ил. Библиогр.: с. 333-334. - ISBN 5-211-00459-0. 5 2. Биология [Электронный ресурс] : Растения. Бактерии. Грибы. Лишайники : мультимедийное учебное пособие нового образца. - CD. - Москва : YDP interactive Publishing : Просвещение-МЕДИА : Новый Диск, 2005. - 2 CDR + Приложение: Руководство пользователя - Систем. требования: Pentium 166 МГц и выше ; 40 Mb HDD, 32 Мb RAM, 16-х CD-ROM, в/карта с разреш. 800х600 и цв. гаммой 16 bit, зв. карта, микрофон, модем ; Windows 98SE, Ме, 2000, ХР. 3. Вестник Московского университета. Серия 16. Биология : научный журнал - Основан в ноябре 1946 г.. - Выходит 4 раза в год. - Включен в перечень ВАК. 4. Вестник Университета Российской академии образования = Herald of the University of the Russian academy of education : научный журнал - Основан в 1996 г.. Выходит 5 раз в год. - Включен в перечень ВАК. 5. Громов Б. В. Экология бактерий : учебное пособие для ун-тов по специальности "Микробиология" : доп. Гос. ком. СССР по нар. образованию / Б. В. Громов, Г. В. Павленко ; Ленингр. гос. ун-т. - Ленинград : Изд-во Ленингр. ун-та, 1989. 248 с. : ил. - Библиогр.: c. 244-246. - Указ.: с. 236-243. - ISBN 5-288-00225-8. 6. Заварзин Г. А. Введение в природоведческую микробиологию : учебное пособие / Г. А. Заварзин, Н. Н. Колотилова. - Москва : Университет, 2001. - 256 с. - ISBN 5-8013-0124-0. 7. Пивоварова Ж. Ф. Биология с основами экологии [Электронный ресурс] : CDR / Ж. Ф. Пивоварова ; Новосиб. гос. пед. ун-т. - CD: электрон. текстовые, граф.. Новосибирск, 2008. - Систем. требования: SVGA ; CD-ROM ; 255 Mb на жест. диске ; Windows 95 и выше ; Mozilla Firefox. 8. Пивоварова Ж. Ф. Биосфера и человек [Электронный ресурс] : электронный учебник. Ч. 3 : Ноосфера / Ж. Ф. Пивоварова, А. Е. Влазнева ; программист Е. В. Бугровская ; Новосиб. гос. пед. ун-т. - CD с автозапуском: электрон. текстовые, граф., зв. данные и прикладная прогр. (110 Мб). - Новосибирск : НГПУ, 2003. - Систем. требования: Pentium 166 и выше, 32 МБ ОЗУ, привод CD-ROM, видеокарта с разреш. 640х480 с цв. гаммой 16 bit, зв. карта, колонки или наушники ; Microsoft Windows 95, 98, Me, 2000, XP ; Браузер интернета, совместимый с Microsoft Internet Explorer 4.0 и выше. 9. Почвенные организмы как компоненты биогеоценоза / отв. ред. Е. Н. Мишустин ; АН СССР, Научный совет по проблемам биогеоценологии и охраны природы, Ин-т эволюционной морфологии и экологии животных АН СССР. - Москва : Наука, 1984. - 247 с. : ил., табл., схемы - Библиогр. в конце ст.. - Ред. указ. на обороте тит. л.. 10. Спиридонова Н. Ю. Биология [Электронный ресурс] : Систематика и жизненные циклы растений : интерактивное наглядное пособие / Н. Ю. Спиридонова, Г. М. Пальдяева. - CD. - Москва : Дрофа, 2008. - Систем. требования: Pentium III, 256 Мb, СD-ROM 16х, видеосистема 800х600,16 bit. 11. Экология и жизнь = Ecology and Life : научно-популярный и образовательный журнал - Издается с 1996 г.. - Выходит ежемесячно. 12. Экология микроорганизмов : учебник для вузов по специальности "Микробиология" и другим биологическим специальностям / [А. И. Нетрусов, Е. А. БончОсмоловская, В. М. Горленко и др.] ; под ред. А. И. Нетрусова. - Москва : Академия, 2004. - 272 с. : ил. - (Высшее образование). - Указ.: с. 261-265. - ISBN 5-7695-1566-Х. 6 5.3 Электронные ресурсы 5.3.1 Электронные ресурсы НГПУ (авторизированный доступ) 1. Красноперова Ю. Ю. Характеристика изменений патогенного потенциала микроорганизмов-симбионтов в протозойно-бактериальных ассоциациях: монография [Электронный ресурс] / Ю. Ю. Красноперова. - Москва : Флинта, 2010. - 208 с. - Режим доступа: http://www.biblioclub.ru/book/79354/ - Доступна эл. версия. ЭБС "Университетская библиотека ONLINE". - ISBN 978-5-9765-1009-8. 2. Мигула, В. Бактерии и их роль в жизни человек [Электронный ресурс] / В. Мигула ; пер. А. Д. Карицкий. - Санкт-Петербург : Типография товарищества "Общественная польза", 1892. 109 с. Режим доступа: http://www.biblioclub.ru/book/72290/. - Доступна эл. версия. ЭБС "Университетская библиотека ONLINE". - ISBN 9785998995163. 3. Протасов А. А. Жизнь в гидросфере [Электронный ресурс] : очерки по общей гидробиологии / А. А. Протасов. - Киев : Академпериодика, 2011. - 704 с. : ил. - Режим доступа: http://www.biblioclub.ru/book/101042/. - Доступна эл. версия. ЭБС "Университетская библиотека ONLINE". - ISBN 978-966-360-185-4. 4. Щелкунов С. Н. Генетическая инженерия [Электронный ресурс] : учебное пособие для вузов по направлению "Биология" и специальностям "Биотехнология", "Биохимия", "Генетика", "Микробиология" : рек. М-вом образования РФ / С. Н. Щелкунов. - Новосибирск : Сиб. университетское изд-во, 2010. - 514 с. : ил., табл., схемы - Режим доступа: http://www.biblioclub.ru/book/57527/. - Доступна эл. версия. ЭБС "Университетская библиотека ONLINE". - ISBN 978-5-379-01064-5. 5.3.2 Интернет-ресурсы (открытый доступ) 1. Library.ru – Информационный справочный портал о библиотеках и для библиотек Режим доступа: http://www.library.ru/ 2. АРБИКОН договор № С/083-В от 18.12.2006 г Режим доступа: http://www.arbicon.ru 3. Консультант Плюс договор № 099/РДД от 12.10.2010 г. Режим доступа: http://www.consultant.ru/ 4. НЭИКОН регистрация №24375 дает доступ к базам данных: http://www.neicon.ru 5. Президентская библиотека им Б. Н. Ельцина соглашение о сотрудничестве от 11.03.2012. Режим доступа: http://www.prlib.ru 6. Система «Анти-плагиат» договор №38 от 20.03.2012 Режим доступа: http://www.antiplagiat.ru 7. Универсальные базы данных East Veiw. Издания по гуманитарным и общественным наукам договор № 256 от 04.07.2011 Режим доступа: http://www.ebiblioteka.ru/ 8. ЭБС «Университетская библиотека» договор № 16 от 10.02.2012. Режим доступа: http://www.biblioclub.ru/ 9. Электронная библиотека диссертаций РГБ договор № 095/04/0098 от 01.02.2012 г. Режим доступа: http://diss.rsl.ru/ 10. Электронная библиотека НГПУ на программном обеспечении СУБД MS SQL 2005; PERL, HTML, XML, JavaScript, jQuery. Режим доступа: http://lib.nspu.ru/elibrary/ 7