Таксономия вирусов

Лекция
Тема: Таксономия вирусов
В 1966г. в Москве на Международном
конгрессе микробиологов был создан
Международный комитет по
таксономии вирусов (МКТВ).
Критерии таксонов
1.Тип нуклеиновой кислоты (ДНК или РНК) и ее структура (количество и форма
цепей);
2.Стратегия вирусного генома;
3.Размер и морфология вириона, тип симметрии, число капсомеров;
4.Физико-химические свойства (устойчивость к температурам, рН, жирорастворителям и т.д.)
5.Наличие липопротеидной оболочки;
6.Антигенные свойства;
7.Патогенность, в т.ч. цитопатические изменения в клетках и внутриклет. включения;
8.Круг восприимчивых хозяев;
9.Способ передачи;
10. Географическое распространение
и т. д.
Таксоны вирусов
ОТРЯД
3
СЕМЕЙСТВО
ПОДСЕМЕЙСТВО
56
3
РОД
233
ВИД
1550
Внутри вида могут быть уровни:
СЕРОТИП
ВАРИАНТ
штамм
ИЗОЛЯТ
Вироиды классифицируются по правилам, которые применяются к вирусам.
Рекомбинантные вирусы классифицируются как виды или подвидовые сущности.
Вирусы-сателиты и прионы не классифицируются как вирусы, а имеют свою отдельную
классификацию
Вид – это политетический класс вирусов,
составляющих реплицирующуюся линию
и занимающих определенную экологическую
нишу.
Понятие «политетический класс» означает,
что этот класс создают вирусы, имеющие ряд одинаковых
признаков, среди которых нет единого общего признака.
Именно это и определяет вариабельность (изменчивость)
членов вида.
Понятие «реплицирующая линия» означает,
что вид образуют вирусы, имеющие общего
предшественника.
Понятие «экологическая ниша» означает
совокупность, т.н. биотических характеристик вирусов,
к которым относится спектр восприимчивых хозяев,
тканевой тропизм, вирулентность, патогенез, ответ со
стороны хозяина, переносчики, среда обитания и т.д.
Критерии вида
Антигенные свойства;
Патогенность, в т.ч. цитопатические изменения в
клетках и внутриклеточные включения;
Круг восприимчивых хозяев;
Способ передачи;
Географическое распространение
Номенклатура (название) вида вирусов
Название должно:
а. состоять из минимального количества слов;
б. состоять не только из названия хозяина и слова вирус;
в. обозначаться на русском языке, но не запрещается и на
английском.
Например:
а. ВИРУС КАЛИФОРНИЙСКОГО ЭНЦЕФАЛИТА
(вирус + название географического место выделения + название
болезни);
б. ГЕРПЕС СВИНЕЙ ( или ВИРУС ПСЕВДОБЕШЕНСТВА, или ВИРУС
БОЛЕЗНИ АУЭСКИ)
(название болезни + вид животного или вирус + название болезни,
или вирус + фамилия автора)
Род- это группа видов вирусов, имеющих определенные
общие признаки
Критерии рода:
1. Размер и морфология вириона, тип симметрии, число капсомеров;
2. Наличие липопротеидной оболочки;
3. Физико-химические свойства (устойчивость к температурам, рН
среды, жирорастворителям и т.д.)
Номенклатура рода:
Название рода обозначается одним словом на английском языке
с окончанием –virus.
Например: род Mastadenovirus, род Aviadenovirus
Семейство – это группа родов вирусов, имеющих
определенные общие признаки
Критерии семейства:
1. Тип нуклеиновой кислоты (ДНК или РНК) и ее структура
- количество цепей: односпиральная или двуспиральная;
- форма цепей:
линейная или кольцевая;
непрерывная или сегментированная;
2. Стратегия вирусного генома (способ репродукции по классификации
Балтимора)
Номенклатура семейства:
Название семейства обозначается одним словом на английском языке
с окончанием –viridae.
Например: семейство Adenoviridae, семейство Herpesviridae
Семейства, включающие вирусы только
одних позвоночных (человека и
животных):
Герпесвирусы
Аденовирусы
Папилломавирусы
Полиомавирусы
Гепадновирусы
Парамиксовирусы
Ортомиксовирусы
Аренавирусы
Коронавирусы
Семейства, включающие вирусы
позвоночных и беспозвоночных:
Буньявирусы
Тогавирусы
Рабдовирусы
Реовирусы
Асфавирусы
ДНК- содержащие вирусы
А. ДНК - двуспиральная линейная
Семейства:
1. Poxviridae,
вид – в. оспы кур.
2.Iridoviridae,
вид – Invertebrate iridescent virus 6
(выделен от членистоногих).
3. Herpesviridae, виды :
в. болезни Ауэски; в.инфекционного ринотрахеита крс;
в. инфекционного ларингита; в. болезни Марека.
4. Adenoviridae, вид – бычий аденовирус.
Б. ДНК - двуспиральная циркулярная
Семейства:
5. Asfaviridae,
вид - в. африканской чумы
свиней.
6. Polyomaviridae, вид – в. обезьян (SV-40).
7. Papillomaviridae, вид – папилломавир.американских
кроликов.
8.Нepadnoviridae,
вид - в. гепатита В.
В. ДНК односпиральная циркулярная
Семейства:
9. Parvoviridae, вид – в.алеутской болезни норок
10.Circоviridae, вид - в.анемии цыплят
РНК-содержащие вирусы
А. РНК односпиральная линейная плюс-нитевая
Семейства:
1. Picornaviridae, вид – в. ящура
2. Caliciviridae,
3. Astroviridae,
вид –в. геморрагической болезни
кроликов
вид – астровирус человека
4. Coronaviridae, виды:
в. инфекционного бронхита,
в.трансмиссивного гастроэнтерита свиней.
5. Arteriviridae, вид – в. артериита лошадей
6. Flaviviridae, вид – в.вирусной диареи крс
7. Togaviridae, вид – в.краснухи
8. Retroviridae, вид - в. лейкемии (лейкоза) крс
Род (свободный):
«Hepatitis E-like viruses», вид - в.гепатита Е
Б. РНК односпиральная линейная минус-нитевая
Семейства:
9. Bornaviridae, вид – в. болезни Борна
10. Filoviridae,
вид – в. Эбола
11. Paramyxoviridae, виды: в.парагриппа 3 крс,
в.ньюкаслской болезни,
в.респираторно-синцитиальный крс
12. Rhabdoviridae, вид - в. бешенства
В. РНК односпиральная сегментированная
минус-нитевая
Семейства:
13. Orthomyxoviridae, вид - в. гриппа А.
14. Bunyaviridae, вид – в. лихорадки Долины Рифт.
15. Arenaviridae, вид - в. лимфоцитарного
хориоменингита
Г. РНК односпиральная сегментированная плюс-нитевая
Семейство:
16. Nodaviridae, вид – в. Нодамура
Д. РНК односпиральная циркулярная плюс-нитевая
Род (свободный):
Deltavirus, вид – в. гепатита Дельта
Е. РНК двуспиральная сегментированная
Семейство:
17. Reoviridae, вид – ротавирус А
18.Birnаviridae, вид – в.инфекционной бурсальной
болезни
Новые семейства вирусов
Arteriviridae
Asfaviridae
Bornaviridae
Polyomaviridae
Papillomaviridae
Свободные роды
Род Deltavirus
Род «Hepatitis E-like viruses»
Семейство Arteriviridae
Род Arterivirus
4 вида: в. артериита лошадей;
в. подъема лактатдегидрогеназы;
в. респираторно-репродуктивного синдрома
свиней;
в. геморрагической лихорадки обезьян
Семейство Asfaviridae
Род
Вид
Asfavirus
в. африканской чумы свиней
Семейство Bornaviridae
Род
Вид
Bornavirus
в. болезни Борна
Семейство Polyomaviridae
Род
Polyomavirus
11 видов: полиомавирус зеленых мартышек
полиомавирус бабуинов
бычий полиомавирус
полиомавирус хомяков
полиомавирус человека
полиомавирус мышей
вакуолизирующий вирус почки кроликов
вирус обезьян 12
вирус обезьян 40
полиомавирус Budgerigar fledgling
Семейство Papillomaviridae
Род
Papillomavirus
7 видов: бычий папилломавирус
папилломавирус собачьих
папилломавирус американских кроликов
папилломавирус оленей
папилломавирус лосей
папилломавирус человека
папилломавирус овец
Свободные роды
Род Deltavirus
Вид в. гепатита дельта
Род «Hepatitis E-like viruses»
Вид в. гепатита Е