МАТРИЧНОЕ ПРЕДСТАВЛЕНИЕ СИСТЕМЫ ГЕНЕТИЧЕСКОГО

1
«
,
. XXI
”(
.
. .
)–
, 2006, .216-250 (
).
. .
petoukhov@hotmail.com , http://www.petoukhov.narod.ru
“…
–
(
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,
)
”
,
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,
.
–
–
.
Genbank
,
«
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» [
, 1999, . 14].
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(
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–
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64
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1
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CCU
CUC
CUU
UCC
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UUC
UUU
111
110
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010
001
000
,
110
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CCG
CUA
CUG
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UCG
UUA
UUG
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101
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CAU
CGC
CGU
UAC
UAU
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UGU
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CAA
CAG
CGA
CGG
UAA
UAG
UGA
UGG
11
10
11
CC
CU
01
UC
00
UU
011
ACC
ACU
AUC
AUU
GCC
GCU
GUC
GUU
01
AC
AU
G
C
G
U
U
G
010
ACA
ACG
AUA
AUG
GCA
GCG
GUA
GUG
001
AAC
AAU
AGC
AGU
GAC
GAU
GGC
GGU
00
AA
A
G
G
A
G
G
000
AAA
AAG
AGA
AGG
GAA
GAG
GGA
GGG
(n)
. 2.
/
10
CA
C
G
UA
n = 1, 2, 3
, 2001/.
, , G, U.
,
,
[
, 2001; Petoukhov, 1999, 2001a].
,
U
,
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.
(
1,
U
),
0.
G–
(
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1,
, -
,
0 (
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. 2
.
–
.
,
,
101 (
,
),
–
110 (
,
).
.
AU
5
(3)
64
.
[Wittmann,
1961],
.
,
.
(n)
.
.
.
(
C=G=3, A=U=2),
.
P(n)
,
,
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.
3 3 2=18.
(n)
(
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G
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18 27 12 18 12 18 8 12
(3)
= 18 12 27 18 12 8 18 27
12 18 18 27 8 12 12 18
18 12 12 8 27 18 18 12
12 18 8 12 18 12 27 18
12 8 18 12 18 12 27 18
8 12 12 18 12 18 18 27
(n)
.17.1.
(n)
(3)
,
.
5n,
(n)
10n .
1000.
,
(C=G=3, A=U=2).
125,
,
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,
.
,
.17.1
,
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.
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= (1+50.5)/2 = 1,618…
(n)
«
»
= (
MULT
,
(n) 1/2
MULT ) ,
(
.17.2).
(
2004, 2006; Petoukhov, 2001, 2005]).
)1/2 =
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(P
=
-1
-1
.17.2.
(P
(n) 1/2
)
=
(3) 1/2
) =
=
(n)
;
)
=
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=(
(2) 1/2
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-
=
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0
0
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0
2
-2
0
0
-2
2
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0
0
2
3
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1
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1
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3
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,
,
…).
,
.
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,
.
,
,
.
,
,
,
(
-
).
,
. . [
,
,
, 2004; Petoukhov, 2005].
.
(n)
.
.
.
.
(
C=G=3, A=U=2),
P(n)
.
.
(3)
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P
G
(n)
(3)
(3)
,
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.
(
,
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18
18
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12
18
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12
18
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8
18
12
18
8
12
12
18
12
125
125
125
125
125
12
12
8
125
18
8
12
125
8
18
12
125
12
12
18
125
18
18
12
125
27
12
18
125
12
27
18
125
18
18
27
125
125
125
125
1000
(3)
. 3.
,
(C=G=3, A=U=2).
.
.
.
(n)
,
.
(n)
10n .
125,
.
,
1000.
(3)
(3)
512.
,
5n,
7
.
(n)
,
,
,
(
,
.).
,
.
:
-
,
,
,
.
,
.
= (1+50.5)/2 = 1, 618…
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«
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(n)
»
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3
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1
1
3
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1
-1
-1
-3
3
1
1
-1
-1
1
-3
-1
1
3
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1
-1
-3
1
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1
-1
3
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1
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1
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)1/2
.
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1
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2 3
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(n)
,
3
. 4.
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. 2)
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-1
= .
=G=
P
(3)
(n)
.
(n)
(3)
=
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3,
,
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(P
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.
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-
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[Petoukhov, 2001a].
–
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-1
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, 2004].
[Petoukhov, 2001a, 2003;
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.
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,
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-1
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)
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,
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(
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(
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(3)
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,
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,
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,
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64
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,
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. 7).
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*
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. 7.
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….
-1
0
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. 8.
(n)
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,
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,
[Petoukhov, 2003].
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,
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-
, 2004 ].
,
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,
[
, 1999].
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.
i = (-1)1/2
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:
i = Arch(1/(2* )) / arccos (1/(2* )) ; i = Arch[cos(0,4* )] / (0,4* ) ,
Arch
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(1)
.
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.
«
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, 2003, . 255],
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-1
3
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i
i
( )i
))
-1
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3
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i
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3
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i
( -3)i
i
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( )i
i
i
3
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-( -3)i - -1
i
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i
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- i
. 9.
=G=3, A=U=2
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(
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«
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» [Cook,
-
,
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-1
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,
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cos ].
72
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.
0
36
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:
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= ( 10/3 ) * asin( /2) ;
,
i,
(2)
,
,
(
).
«
.
,
»,
, .
.,
(
)
«
»,
( .
[
, 1981]).
,
,
,
.
.
.
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,
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(3)
.
.
,
,
,
,
.
64
12
20
,
,
.
,
[
,
, 2001].
(3)
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.
(3)
(2 2)
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NN-
,
.
.
NN-
,
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,
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«
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NN-
.
,
-
-
:
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,
.
,
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.
111
110
101
100
011
010
001
000
.
111
110
101
100
011
010
001
000
CCC
Pro
63
CCU
Pro
55
CUC
Leu
47
CUU
Leu
39
CCA
Pro
62
CCG
Pro
54
CUA
Leu
46
CUG
Leu
38
CAC
His
61
CAU
His
53
CGC
Arg
45
CGU
Arg
37
CAA
Gln
60
CAG
Gln
52
CGA
Arg
44
CGG
Arg
36
ACC
Thr
59
ACU
Thr
51
AUC
Ile
43
AUU
Ile
35
ACA
Thr
58
ACG
Thr
50
AUA
Met
42
AUG
Met
34
AAC
Asn
57
AAU
Asn
49
AGC
Ser
41
AGU
Ser
33
AAA
Lys
56
AAG
Lys
48
AGA
Stop
40
AGG
Stop
32
UCC
Ser
31
UCU
Ser
23
UUC
Phe
15
UUU
UCA
Ser
30
UCG
Ser
22
UUA
Leu
14
UUG
UAC
Tyr
29
UAU
Tyr
21
UGC
Cys
13
UGU
UAA
Stop
28
UAG
Stop
20
UGA
Trp
12
UGG
GCC
Ala
27
GCU
Ala
19
GUC
Val
11
GUU
GCA
Ala
26
GCG
Ala
18
GUA
Val
10
GUG
GAC
Asp
25
GAU
Asp
17
GGC
Gly
9
GGU
GAA
Glu
24
GAG
Glu
16
GGA
Gly
8
GGG
13
Phe
7
Leu
6
. 10.
Cys
5
Trp
4
Val
3
Val
2
Gly
1
Gly
0
(3)
20
/
(2 2)
, 2001, . 99
106/. 20
Pro, His, Gln
.
-
“stop”.
,
NN-
,
,
,
.
0
NN-
63
.
20
(3)
,
8
12
.
(3)
20
,
.
.
20
64
.
17
Information (
,
«National Center for Biotechnology
)»: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Utils/wprintgc.cgi .
20
.
.
20
,
1
, . .
8
8.
,
Thr
4,
-
. .
20
1
1
3
8
4
8
1 2 3 4 5 6 7 8
1) The Vertebrate Mitochondrial Code
2) The Standard Code
3) The Mold, Protozoan, and Coelenterate
Mitochondrial Code and the Mycoplasma
/Spiroplasma Code
4) The Invertebrate Mitochondrial Code
5) The Echinoderm Mitochondrial Code
6) The Euplotid Nuclear Code
7) The Bacterial and Plant Plastid Code
8) The Ascidian Mitochondrial Code
9) The Flatworm Mitochondrial Code
10) Blepharisma Nuclear Code
2
1
2
2
2
2
2
12
9
10
12
8
8
9
12
7
8
1
1
2
2
1
3
2
6
5
5
2
3
3
6
6
5
5
5
6
5
1
1
3
3
3
1
3
1
1
1
12
12
12
8
8
8
12
12
12
12
12
12
12
8
8
8
8
8
8
8
14
11) Chlorophycean Mitochondrial Code
12) Trematode Mitochondrial Code
13) Scenedesmus obliquus mitochondrial Code
14) Thraustochytrium Mitochondrial Code
15) The Alternative Yeast Nuclear Code
16) The Yeast Mitochondrial Code
17) The Ciliate, Dasycladacean and
Hexamita Nuclear Code
2
1
2
2
2
2
9
10
9
9
9
13
8
1
1
1
1
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, 2004a, . 482-513.
02.02.2004b, 30 .,
182- 2004
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964», 8, 2004 ).
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