РСТУ

advertisement
Р
Радикальная
замена
аминокислоты
–
мутационная
замена,
приводящая к значительным изменениям структуры и функции белка.
Рамка считывания – один из трех возможных способов считывания
нуклеотидной последовательности в виде последовательного ряда триплетов.
Распределение Пуассона – функция, определяющая вероятности
проявления (осуществления) неограниченного числа событий определенного
типа.
Расходящаяся транскрипция – транскрипция с двух промоторов в
противоположных направлениях.
Реверсия мутации – замена в ДНК, восстанавливающая или
компенсирующая первоначальное повреждение. Может быть истинной и
ложной.
Ревертант – клетка или организм, у которого произошла реверсия
мутации.
Регулон – набор структурных генов или оперонов, локализованных в
различных областях одного генома, но имеющих общий механизм регуляции
экспрессии.
Редкие основания – см. минорные основания.
Рекогниция – узнавание каждой тРНК своей аминокислоты.
Рекомбинация – комбинация генов у потомков, отличающаяся от их
комбинации у родителей.
Ренатурация – переход нуклеиновой кислоты или белка из
денатурированного к биологически полностью активному состоянию.
Репарация генетического материала – восстановление структуры
поврежденной молекулы ДНК с участием различных групп ферментов.
Репликационная вилка – участок начала репликации.
Репликационный глазок – область реплицирующейся ДНК внутри
протяженного нереплицирующегося региона.
Репликация ДНК – синтез дочерней цепи ДНК на исходной (матричной) ее цепи.
Репликон – единица репликации молекулы ДНК; участок молекулы
ДНК от точки начала одной репликации до точки начала другой.
Реплисома – мультиферментный комплекс, формирующийся в
бактериальной репликационной вилке для осуществления синтеза ДНК.
Репрессор – белок, кодируемый геном–регулятором, способный блокировать ген-оператор.
Рестриктазы – ферменты, способные узнавать определенные последовательности нуклеотидов в молекуле нуклеиновой кислоты и разрезать ее в
этих участках на отдельные фрагменты с образованием липких или тупых
концов.
Рецессивный аллель – аллель, фенотипически проявляющийся
только в гомозиготном состоянии при условии полного доминирования.
РНК – нуклеиновая кислота, мономером которой является нуклеотид,
состоящий из азотистого основания (А, Г, Ц, У), рибозы и остатка фосфорной
кислоты.
С
Сайт – участок небольшого размера молекулы нуклеиновой кислоты
или белка, обычно равный одному нуклеотиду или одному аминокислотному
остатку, соответственно.
Секвенирование – процесс установления полных нуклеотидных или
аминокислотных последовательностей соответственно в ДНК или белке.
Селекционные
предназначенных
для
тесты
(тесты
определения
отбора)
вида
–
отбора
группа
в
методов,
аминокислотных
последовательностях белков и/или нуклеотидных последовательностях РНК
и ДНК, а также в их частях.
Серия кодонов – группа эквивалентных кодонов.
Синглетонные сайты – вариабельные сайты не менее 5 выровненных
последовательностей, в которых встречаются как минимум два нуклеотида
или аминокислотных остатка при преобладании частоты одного из них.
Синонимичная дистанция – эволюционная дистанция между
нуклеотидными последовательностями, равная числу синонимичных замен
на синонимичный сайт.
Синонимичная
замена
(молчащая,
изокодонная
замена)
–
нуклеотидная замена, не проявляющаяся на уровне кодируемого белка.
Синонимичный дрейф – процесс накопления в геноме нейтральных
мутаций в ходе эволюции.
Синонимичный сайт – сайт, в котором возможна синонимичная
замена. Если все замены в данном сайте синонимичны, сайт называется
абсолютно синонимичным. Если одна из замен в данном сайте синонимична,
сайт называется синонимичным на 1/3 (соответственно, несинонимичным на
2/3). Если две замены в данном сайте синонимичны, сайт называется
синонимичным на 2/3 (соответственно, несинонимичным на 1/3).
Систематика
–
раздел
биологии,
посвященный
описанию,
обозначению и классификации по группам (таксонам) всех существующих и
вымерших организмов.
Систематическая вырожденность – разновидность вырожденности,
при которой эквивалентные кодоны различаются пуринами (А и Г) или
пиримидинами (Ц, Т и У) в 3΄–концевом положении.
Скорость молекулярной эволюции – показатель, отражающий темп
эволюционных
изменений
генетических
макромолекул
и
равный
эволюционной дистанции, деленной на удвоенное число лет, прошедших
после эволюционной дивергенции двух цепей от общей для них предковой
цепи, что соответствует двум ветвям подразумеваемого филогенетического
древа.
Смысловая цепь – см. кодирующая цепь.
Собственно несинонимичная замена – см. миссенс–замена.
Согласованная (сопряженная) эволюция – см. коэволюция.
Соотношение пар оснований (коэффициент специфичности) –
соотношение содержания Г+Ц к содержанию А+Т. Для животных и
большинства
растений
он
ниже
единицы
(от
0,54
до
0,94),
у
микроорганизмов он колеблется от 0,45 до 2,57.
Состав оснований – нуклеотидный состав, соотношение нуклеотидов
в молекуле нуклеиновой кислоты или в геноме.
Спейсеры – небольшие участки ДНК прокариот, отделяющие друг от
друга структурные гены.
Спаривание оснований – специфическая реакция образования
водородных связей между комплементарными азотистыми основаниями (АТ, А-У, Г-Ц).
Специализированные
гены
–
гены,
кодирующие
белки,
синтезирующиеся в больших количествах в клетках определенных типов.
Сплайсинг – совокупность процессов, включающих вырезание
интронов из молекулы про-иРНК и лигирование экзонов.
Сравнительная биохимия – раздел биохимии, изучающий состав
веществ и их метаболические пути у организмов различных систематических
групп.
Стабильность гена – свойство гена, заключающееся в его редком
изменении.
Структурный ген – ген, кодирующий РНК или белок.
Субъединица – одна или несколько частей, которые вместе образуют
целую единицу или структуру.
Супермутагены
–
мутагены
(чаще
химической
природы),
повышающие частоту мутаций в сотни–десятки тысяч раз.
Супрессор (ингибитор) – ген, подавляющий действие другого неаллельного гена.
Считывание
–
процесс
нуклеотидов иРНК и их
декодирования
перевод
последовательностей
(трансляция) в соответствующие
последовательности аминокислот с образованием полипептидных цепей.
Т
Таблица генетического кода – таблица, в которой аминокислоты
сопоставлены с кодирующими их кодонами.
Таксон
–
категория,
представляющая
итог
произведенных
систематиком оценок степени эволюционной дивергенции, отражающий
уровень различий между классифицируемыми организмами.
Таксономия – теория научной систематики и классификации, раздел
систематики, учение о соподчинении таксономических категорий.
Тандемные
повторы
–
множественные
копии
одинаковых
последовательностей, расположенных одна за другой в одинаковом
направлении.
Теория мутационного давления (теория Н. Суеоки) – теория
молекулярной
эволюции,
признающая
существование
мутационного
давления и провозглашающая направленное мутационное давление основной
причиной возникновения генных мутаций.
Теория
фундаментальная
нейтральной
теория
эволюции
молекулярной
(теория
эволюции,
М.
Кимуры)
согласно
–
которой
большинство изменений на молекулярном уровне в ходе эволюции
происходят
за
счет
случайной
фиксации
нейтральных
или
почти
нейтральных мутаций.
Терминатор – участок оперона или транскриптона, где прекращается
процесс транскрипции.
Терминация – заключительный этап трансляции.
Тест Фишера – статистический тест, используемый в молекулярной
эволюции
для
определения
статистической
достоверности
результатов
селекционных
тестов
в
случае
малой
длины
сравниваемых
последовательностей.
Тесты отбора – см. селекционные тесты.
Тимин - 5-метилурацил, пиримидиновое основание, входящее в
состав нуклеотида ДНК.
Топология дендрограммы – порядок ветвления дендрограммы.
Точковые мутации – генные мутации, заключающиеся в изменении
одной пары оснований.
Транзиция
–
нуклеотидная
замена,
не
сопровождающаяся
изменением типа основания, т.е. замена пуринового основания на пуриновое
(А↔Г) или пиримидинового на пиримидиновое (Ц↔Т, У).
Трансверсия – нуклеотидная замена, сопровождающаяся изменением
типа основания, т.е. замена пуринового основания на пиримидиновое (А, Г
↔ Ц, Т, У).
Транскриптон – единица считывания генетической информации эукариот.
Транскрипция – процесс синтеза на кодирующей цепи ДНК
молекулы иРНК с участием РНК-полимераз.
Транслокация – разновидность хромосомной мутации: обмен
сегментами между негомологичными хромосомами.
Транслокация рибосомы – перемещение рибосомы вдоль иРНК
после включения каждой новой аминокислоты в полипептидную цепь.
Трансляция – "перевод" порядка нуклеотидов молекулы иРНК в определенную последовательность аминокислот полипептида.
Транспозоны (прыгающие, блуждающие гены) – повторяющиеся
последовательности нуклеотидов молекулы ДНК с непостоянной локализацией.
Третичная
структура
белка
–
пространственная
структура,
образующаяся в результате самоукладки отдельной полипептидной цепи.
Трехкратно вырожденный сайт – нуклеотидный сайт, в котором две
замены из трех возможных синонимичны.
Трехшаговая замена – замена всех трех нуклеотидов в кодоне.
Триплет – см. кодон.
Триплетность – свойство генетического кода, заключающееся в
соответствии триплета нуклеотидов молекулы ДНК или иРНК одной
аминокислоте в полипептидной цепи.
У
Универсальность – свойство генетического кода, заключающееся в
том, что у большинства организмов одинаковые аминокислоты кодируются
одинаковыми триплетами.
Урацил
–
2,4-диоксипиримидин,
пиримидиновое
основание,
содержащееся в РНК.
Усилитель транскрипции – см. энхансер.
Усредненная
последовательность
–
см.
консенсусная
последовательность.
Участки
сплайсинга
–
участки
последовательностей,
непосредственно окружающие границы между экзонами и интронами.
Download