Братцева Екатерина Валериевна ПРОТЕОМНЫЕ ТЕХНОЛОГИИ В ДИАГНОСТИКЕ ГРИБОВИДНОГО МИКОЗА

advertisement
На правах рукописи
Братцева Екатерина Валериевна
ПРОТЕОМНЫЕ ТЕХНОЛОГИИ В ДИАГНОСТИКЕ
ГРИБОВИДНОГО МИКОЗА
14.01.10 – кожные и венерические болезни
АВТОРЕФЕРАТ
диссертации на соискание ученой степени
кандидата медицинских наук
Москва - 2010 г.
2
Работа
выполнена
Федерального
в
отделении
Государственного
клинической
учреждения
дерматологии
«Государственный
научный центр дерматовенерологии Росмедтехнологий» и отделе
протеомики Института биомедицинской химии им.В.М. Ореховича
РАМН
Научные руководители:
доктор медицинских наук, профессор,
академик РАМН
Анна Алексеевна Кубанова
кандидат биологических наук
Сергей Александрович Мошковский
Официальные оппоненты:
доктор медицинских наук, профессор
Ирина Борисовна Трофимова
кандидат биологических наук
Мария Владимировна Савватеева
Ведущее учреждение:
Российский университет дружбы народов, г. Москва
Защита диссертации состоится «________» ___________2010 года в 12 часов
на заседании Диссертационного совета Д208.115.01 при Федеральном
Государственном
учреждении
«Государственный
научный
центр
дерматовенерологии Росмедтехнологий» по адресу: 107076, г. Москва,
ул.Короленко, д.3, стр.6.
С
диссертацией
можно
ознакомиться
в
библиотеке
ФГУ
«ГНЦД
Росмедтехнологий».
Автореферат разослан «______» ______________2010 г.
Ученый секретарь
Диссертационного совета
кандидат медицинских наук
Наталия Константиновна Иванова
3
ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ
Актуальность темы. Грибовидный микоз (ГМ) является наиболее
распространенным видом первичных Т-клеточных лимфом кожи (R.
Willemze и соавт., 2005). Диагностика грибовидного микоза, особенно на
ранних стадиях (I-II), является одной из наиболее сложных проблем в
практике дерматовенеролога. В настоящее время не существует единого
диагностического алгоритма грибовидного микоза. Однако большинство
авторов считает, что диагностика грибовидного микоза основывается на
клинической
картине
заболевания,
иммунофенотипического
перестройки
гена
вспомогательным
данных
исследований.
Т-клеточного
методом
Определение
рецептора
диагностики
гистологического
методом
клональной
ПЦР
(Клинические
и
является
рекомендации.
Дерматовенерология, 2008, P. Lenane и соавт., 2007, N. Pimpinelli и соавт.,
2005, S.J. Whittaker и соавт., 2003).
Трудности
диагностики
грибовидного
микоза
заключаются
в
разнообразии его клинических проявлений, а также их сходстве с
проявлениями хронических воспалительных дерматозов (А.А. Каламкарян,
1983, И.Б. Трофимова, 1997, H.S. Zackheim и соавт., 2002). Более того,
некоторые
дерматозы
иммунопатологические
имеют
сходные
механизмы,
с
например
грибовидным
псориаз,
микозом
как
Th1-
опосредованное заболевание (E.W.Cowen и соавт., 2007, K. Ghoreschi и
соавт., 2007).
Точность
клинического
диагноза
ГМ,
подтвержденного
гистологическим методом, составляет от 50 до 75% (А.Н. Родионов, 1997, S.J.
Whittaker и соавт., 2003). По данным G. Burg и соавт., точность
иммунофенотипического исследования на поздних стадиях ГМ достигает
80% (G. Burg и соавт., 2005), однако на ранних стадиях заболевания точность
диагностики оказывается ниже. Кроме того, все перечисленные методы
диагностики требуют проведения биопсии кожи.
4
Для своевременной диагностики наиболее перспективным в настоящее
время является поиск сывороточных биомаркеров (M.A. Tainsky, 2009). С
этой целью успешно применяются протеомные технологии, которые
представлены широким спектром различных методов. Одной из самых
мощных и широко применяемых в целях поиска биомаркеров технологий
является
масс-спектрометрия
MALDI-TOF,
позволяющая
получать
информацию сразу о сотнях белков (В.М. Говорун и соавт., 2002, T.C. Poon,
2007).
Однако
применение
масс-спектрометрии
ограничивается
чувствительностью этого метода. Для изучения белков, представленных в
сыворотке крови в более низких концентрациях, чем находится порог
чувствительности масс-спектрометрических методов, возможно применение
технологии
xMAP.
Данный
метод
дает
возможность
проводить
количественное определение десятков целевых белков одновременно. В
качестве целевых белков в настоящем исследовании были выбраны
цитокины, так как они играют ведущую роль в патогенезе грибовидного
микоза. В этом случае продукция цитокинов осуществляется как атипичными
лимфоцитами, так и различными иммунными клетками микроокружения. В
отечественной литературе отсутствуют работы, выполненные с применением
протеомных технологий при изучении различных аспектов грибовидного
микоза, а количество работ иностранных исследователей весьма ограничено,
что определило актуальность данного исследования.
Цель исследования: Установить молекулярные маркеры грибовидного
микоза на основании результатов изучения протеомного и цитокинового
профилей сыворотки крови с целью разработки алгоритма диагностики
заболевания.
5
Задачи исследования:
1
Провести анализ анамнестических данных больных грибовидным
микозом для оценки своевременности диагностики данного заболевания
2
Исследовать протеомные профили сывороток крови больных
грибовидным микозом, псориазом и здоровых доноров крови методом массспектрометрии MALDI-TOF
3
Изучить уровень цитокинов в сыворотке крови больных
грибовидным микозом с помощью технологии xMAP на различных стадиях
заболевания
4
Провести сравнительное изучение протеомного и цитокинового
профилей сыворотки крови больных грибовидным микозом, псориазом и
здоровых доноров с целью выявления молекулярных маркеров грибовидного
микоза
5
Разработать алгоритм диагностики грибовидного микоза на
основании данных, полученных в результате исследования профилей белков
и цитокинов сыворотки крови.
Научная новизна
- впервые в России изучен протеомный профиль сыворотки крови
больных грибовидным микозом с применением метода MALDI-TOF массспектрометрии. При сравнении протеомных профилей сыворотки крови
больных грибовидным микозом, больных псориазом и здоровых людей –
доноров крови выявлены пики белков, которые достоверно отличаются у
обследованных лиц.
- впервые изучен широкий профиль из 27 цитокинов в сыворотке
крови больных грибовидным микозом с применением технологии xMAP.
Выявлена прямая корреляционная связь концентрации цитокинов IP-10 и IL10, а также обратная корреляционная связь концентрации цитокина RANTES
в сыворотке крови больных грибовидным микозом со стадиями заболевания,
что подтверждает патогенетическую значимость данных цитокинов.
6
- впервые в сыворотке крови больных грибовидным микозом
установлено достоверное увеличение концентрации цитокина IP-10 по
сравнению с концентрацией этого цитокина у больных псориазом, а также
увеличение концентрации цитокинов IP-10, IL-4, IL-1ra и G-CSF по
сравнению с их концентрацией в сыворотке крови здоровых доноров. На
основании проведенных исследований установлено, что цитокин IP-10 может
использоваться в качестве диагностического маркера грибовидного микоза.
- впервые разработан алгоритм диагностики грибовидного микоза,
обладающий высокой точностью и основанный на определении в сыворотке
крови концентрации цитокина IP-10. При дифференциальной диагностике
грибовидного
микоза
последовательном
и
псориаза
определении
алгоритм
концентрации
в
основывается
сыворотке
на
крови
концентрации цитокинов IP-10 и IL-6 и имеет вид «древа принятия
решений».
Практическая значимость:
В сыворотке крови обследованных больных выявлены молекулярные
маркеры грибовидного микоза. С применением данных маркеров разработан
алгоритм,
позволяющий
диагностировать
грибовидный
микоз
и,
в
необходимых случаях, провести его дифференциальную диагностику с
псориазом. Применение алгоритма диагностики грибовидного микоза
позволит своевременно выявить больных «группы риска» по развитию
данного заболевания для диспансерного наблюдения.
Основные положения, выносимые на защиту:
1.
Установлено, что длительность периода от момента появления
первых симптомов заболевания у пациентов до постановки диагноза
«грибовидный микоз» составляет от 1 месяца до 23 лет (5,5 лет ± 0,84 года),
при этом у 23,1% больных грибовидный микоз диагностируется на третьей
стадии заболевания.
7
2.
Выявлены масс-спектрометрические пики белков, являющиеся
молекулярными маркерами грибовидного микоза. Точность диагностики с
применением данных маркеров составляет 69-75%, качество диагностики по
данным ROC-анализа расценивается как хорошее (AUK>0,7).
3.
Выявлены 4 цитокина (IP-10, IL-4, IL-1ra и G-CSF), уровень
экспрессии которых достоверно отличается у больных грибовидным микозом
и здоровых доноров крови (р<0.05). Уровень экспрессии цитокина IP-10 у
больных грибовидным микозом достоверно выше, чем у больных псориазом
(р<0,001), что позволяет использовать его в дифференциальной диагностике
этих заболеваний.
4.
Установлена
прямая
корреляция
концентрационная
связь
цитокинов IP-10 и IL-10 и обратная корреляционная связь цитокинов
RANTES в сыворотке крови больных грибовидным микозом со стадиями
заболевания, что свидетельствует об их патогенетической роли при данном
заболевании.
5.
Показана
высокая
точность
разработанного
алгоритма
диагностики грибовидного микоза, а также возможность выявления с его
помощью больных, относящихся к группам риска по развитию грибовидного
микоза.
Апробация работы. Основные материалы диссертации представлены
и обсуждены на научно-практической конференции ГУ ЦНИКВИ МЗ РФ
«Протеомные технологии в дерматовенерологии» (Москва, 2007 г.)
Внедрение результатов исследования. Результаты исследования
внедрены в лекционный курс кафедры дерматовенерологии лечебного
факультета Российского государственного медицинского университета и
врачей ординаторов ФГУ «ГНЦД Росмедтехнологий».
8
Публикации. По материалам диссертации опубликовано 3 работы, из
них 1 - в журнале, входящем в «Перечень ведущих рецензируемых научных
журналов и изданий», рекомендуемых ВАК РФ.
СОДЕРЖАНИЕ РАБОТЫ
Материалы и методы исследования
Клиническая характеристика больных. Обследование пациентов
проводилось в консультативно-диагностическом центре ФГУ «ГНЦД
Росмедтехнологий»,
в
условиях
стационара
городской
клинической
больницы №14, в отделении химиотерапии гематологических заболеваний и
интенсивной терапии Гематологического научного центра РАМН.
В работу включено 39 больных грибовидным микозом, среди которых
было 23 женщины и 16 мужчин (59% и 41% соответственно) в возрасте 28 –
82 лет, средний возраст которых составил 57,4 ± 2,2 лет [M±m].
Из 39 пациентов 18 (46,2%) имели первую стадию грибовидного
микоза, вторую стадию имели 13 (33,3%) человек, третью стадию - 8 (20,6%).
У всех больных грибовидным микозом была диагностирована классическая
форма Алибера-Базена (в соответствии с классификацией WHO-EORTC,
2008).
В лабораторное исследование с применением протеомных технологий
было включено 23 больных грибовидным микозом, в соответствии со
следующими критериями:

возраст от 18 лет и старше,

информированное согласие на участие в исследовании;

стадия грибовидного микоза I-III без генерализации патологического
процесса (без вовлечения периферической крови и внутренних органов);

диагноз грибовидный микоз, подтвержденный гистологическим и
иммунофенотипическим методами;

отсутствие терапии грибовидного микоза не менее 2-х недель до участия
в исследовании;
9

отсутствие
следующих
инфекционный
процесс,
патологических
наличие
состояний
онкологических
(тяжелый
заболеваний,
беременность), а также отсутствие серопозитивности в тестах на ВИЧинфекцию.
В группу сравнения вошли 29 больных псориазом: 8 женщин и 21
мужчина (28% и 72% соответственно) в возрасте от 21 до 76 лет (средний
возраст
45,9
±
2,9
лет).
У
всех
больных
был
диагностирован
распространенный псориаз, среднее значение индекса PASI составило 30,4 ±
1,37.
Контрольную группу составили 22 здоровых человека – доноров крови:
16 женщин и 6 мужчин (73% и 27% соответственно) в возрасте от 29 до 71
года (средний возраст 50,9 ± 2,4 года).
При попарном сравнении групп по возрасту выявлены статистически
значимые различия между группами больных грибовидным микозом и
псориазом (p<0.05). В работе мы допускаем, что возраст больных не
оказывает значимого влияния на результаты исследования (E.W. Cowen и
соавт., 2007). При сравнении группы больных грибовидным микозом с
группами контроля по полу статистически значимых различий не выявлено.
Протокол получения сывороток крови. Взятие венозной крови (8 мл)
у пациентов производили путем стандартной флеботомии в пластиковые
пробирки
без
наполнителя.
Пробирки
находились
при
комнатной
температуре в течение 2 часов до образования сгустка, затем их
центрифугировали в течение 15 мин при 2,5 тыс. об./мин. Сыворотку крови
разделяли на аликвоты по 1 мл, которые замораживали и хранили при
температуре – 800C. При транспортировке замороженных сывороток
использовали сухой лед.
Масс-спектрометрическое
исследование.
Профилирование
проводили на масс-спектрометре Autoflex, «Bruker Daltonics» в линейном
режиме в диапозоне масс 2-30 кДа. Для калибровки использовали следующие
внешние стандарты: гирудин (6964 Да), убиквитин, цитохром C (12230 Да),
10
карбангидраза (14511,5 Да) миоглобин (16951 Да). Спектры снимали
вручную, по крайней мере, в двух повторениях до суммарной интенсивности
около 105. В работе использовали нормальнофазовые чипы NP20, в качестве
матрицы - насыщенный раствор α-циано-4-гидроксикоричной кислоты
(Ciphergen) в 50% (об./об.) ацетонитриле, содержащем 0,5% (об./об.)
трифторуксусной кислоты, разведенный в два раза тем же растворителем.
Для анализа масс-спектрометрических пиков была использована программа
Biomarker Wizard™ (Ciphergen Biosystems) со следующими настройками:
соотношение сигнал/шум (первая ступень) 10, соотношение сигнал/шум
(вторая ступень) 5, пороговая интенсивность пика 0%, допустимая ошибка в
определении массы 0,2%. Массы пиков и их интенсивности экспортировали в
таблицы MS Excel, значения интенсивностей в повторных измерениях
усредняли.
Исследование
с
применением
метода
мультиплексного
анализатора. Для анализа на мультиплексном анализаторе Bio-Plex 200
System (Bio-Rad, США), основанном на технологии хМАР, была выбрана
панель из 27 цитокинов в составе коммерческой тест-системы Bio-Plex Pro
Human Cytokine 27-Plex Panel (Bio-Rad, США). В исследуемую панель
входили следующие цитокины: PDGF-bb, IL-1b, IL-1ra, IL-2, IL-4, IL-5, IL-6,
IL-7, IL-8, IL-9, IL-10, IL-12, IL-13, IL-15, IL-17, Eotaxin, FGF basic, G-CSF,
GM-CSF, IFN-γ, IP-10, MCP-1(MCAF), MIP-1a, MIP-1b, RANTES, TNF-a,
VEGF. Измерения проводили в соответствии с инструкцией производителя.
Для анализа сывороток на приборе Bio-Plex образцы размораживали,
центрифугировали 10 мин при 13.2 тыс. об./мин. и 40 С и разводили в 4 раза.
Для построения стандартной калибровочной кривой лиофилизованную
смесь стандартов растворяли в 500 мкл sample diluent и готовили серию из 8
разведений в standard diluent. Измерения проводили с низким и высоким
разрешением. В качестве контролей использовали standard diluent и sample
diluent. Все измерения проводили двух повторах.
Результаты измерений были представлены с помощью программы Bio-
11
Plex Manager 5.0. При статистической обработке значения уровня цитокинов,
выходящие за нижнюю границу чувствительности метода, принимались за 0
пг/мл. Если значение концентрации цитокина превышало верхнюю границу
чувствительности, то его концентрацию принимали равной верхней границе.
Статистическая
обработка.
Статистическая
обработка
данных
производилась с помощью пакета Statistica 6.0 и языка программирования R.
Для
описания
групп
больных
использовались
стандартные
методы
описательной статистики. Статистическая проверка данных на нормальность
осуществлялась с помощью критерия Шапиро-Уилкса, проверка гипотез о
значимости различий в исследуемых группах по количественному признаку
- с помощью дисперсионного анализа (тест Шеффи) и U-критерия Манна
Уитни с поправкой Бонферрони, по качественным признакам – с помощью
критерия Фишера с поправкой Бонферрони. Выбранный критический
уровень значимости р<0,05.
Оценка диагностического качества выбранных маркеров оценивалось с
помощью ROC-анализа. Качество диагностических маркеров оценивалась по
экспертной шкале для значений AUC (J.A. Hanley и соавт., 1982, M.H. Zweig
и соавт., 1993).
Сравнение диагностического исследования (маркера) с референтным
диагнозом. Для выявленных маркеров рассчитывали показатели точности,
чувствительности,
специфичности
и
прогностической
ценности
положительного диагноза (PPV). Расчет производился по формулам,
представленным в таблице 1.
Таблица 1. Формулы расчета показателей точности, специфичности,
чувствительности и PPV изучаемого маркера
Референтный диагноз
здоровы
выявлено заболевание
Изучаемый
здоровы
а
b
метод
выявлено
c (количество человек)
d
заболевание
Чувствительность = a/( a + c) (1)
Специфичность = d/( b + d) (2)
Точность = (a + d)/(a + b + c + d) (3)
Прогностическая ценность положительного диагноза (PPV) = a/( a + b) (4)
12
При
обработке
данных
масс-спектрометрического
исследования
детекцию и выравнивание пиков производили с помощью программы
ClinProTools (Bruker Daltonics). Кластерный анализ использовали для
выявления групп схожих по масс-спектрометрическим профилям образцов.
Для снижения размерности данных использовали двухступенчатый
подход: сначала выбирали среди групп коррелирующих пиков пики с
наибольшим значением площади под ROC-кривыми, а затем оставшиеся
пики ранжировали с использованием метода рекурсивного отбора признаков.
На втором этапе для отбора значимых признаков применяли алгоритм
рекурсивного исключения признаков (Recursive Feature Elimination algorithm,
RFE) (I. Gyuon и соавт., 2002). Для разработки диагностического алгоритма
использовали метод опорных векторов (Support Veсtor Mashine, SVM). Из-за
небольшого количества образцов точность диагностики определяли с
помощью 10-кратной кросс-валидации. Кросс-валидацию повторяли 50 раз и
вычисляли 95% доверительные интервалы для точности, чувствительности и
специфичности диагностики (M. Pyatnitskiy и соавт., 2010).
Результаты исследования и их обсуждение
У больных грибовидным микозом (39 человек) тщательно изучались
анамнез и клиническая картина заболевания. Основные клинические
характеристики представлены в таблице 2.
13
Таблица 2. Основные клинические характеристики больных грибовидным микозом
Клинические характеристики
Возраст, диапазон лет (среднее ± ст.ош. ср)
Пол
Мужчины
Женщины
Возраст дебюта заболевания, диапазон лет
(M ± m)
Длительность заболевания, диапазон лет (M
± m)
Стадия ГМ
I
II
III
Классическая форма (Алибера Базена)
У
всех
больных
была
Число больных ГМ
от 28 до 82 лет (57,4 ± 2,2)
16 (41%)
23 (59%)
от 26 до 71 года (46,1 ± 2,26 лет)
от 2 до 36 лет (10,3 ± 1,23 лет)
18 (46,2%)
13 (33,3%)
8 (20,5%)
39 (100%)
диагностирована
классическая
форма
грибовидного микоза (Алибера-Базена). Однако патологический кожный
процесс отличался большим разнообразием проявлений, особенно на первой
стадии заболевания. В этом случае высыпания были представлены
различными по окраске и размерам эритематозными пятнами с шелушением
на поверхности: псориазо- и парапсориазоподобными элементами, имели вид
пигментно-пурпурозного
дерматоза.
У
одного
пациента
имелся
единственный очаг грибовиного микоза. У пациентов со II стадией ГМ на
ряду с пятнистыми элементами имелись бляшки с различной степенью
инфильтрации, разных размеров, окраска которых варьировала от розового
до желтовато-красного и бурого цветов. На поверхности очагов поражения
наблюдались множественные чешуйки. У некоторых больных на отдельных
участках тела наблюдалась пойкилодермия. У пациентов с III стадией ГМ
наряду с пятнистыми и бляшечными элементами имелись опухоли,
формирующиеся как в области бляшек, так и на непораженной ранее коже. У
части больных процесс носил генерализованный характер и имелось
состояние близкое к эритродермии. Отмечалась разлитая эритема и
инфильтрация всего кожного покрова, кожа была покрыта крупными и
мелкими чешуйками. Эритродермическое состояние у некоторых больных
сопровождалось появлением эктропиона, выпадением волос, изменением
14
ногтевых
пластин.
У
некоторых
больных
отмечались
повышение
температуры тела, озноб, недомогание.
Пациенты предъявляли жалобы на зуд (53,8%) или жжение (15,4%) в
области высыпаний, у 30,8% больных субъективных ощущений не было.
При анализе данных анамнеза больных грибовидным микозом было
выявлено, что длительность заболевания (от момента появления первых
симптомов) до постановки диагноза грибовидный микоз составила от 1
месяца до 23 лет (5,5 ± 0,84 года). У 43,6% пациентов грибовидный микоз
был диагностирован на первой стадии, у 33,3% пациентов – на второй стадии
и у 23,1% пациентов на третьей стадии (рис. 1).
Рисунок 1. Распределение больных грибовидным
микозом по стадиям на момент постановки диагноза.
Наиболее часто грибовидный микоз у пациентов первоначально
диагностировался как дерматит (аллергический или контактный) – у 46,2%,
псориаз, атопический дерматит (нейродермит), экзема - по 10,3% на каждый
диагноз.
У
отдельных
пациентов
первоначально
диагностировались
парапсориаз (у 2 человек), васкулит (у 3 человек), генерализованный микоз (2
человека), В-клеточная лимфома кожи, болезнь Дарье, чесотка, болезнь
15
Девержи,
туберкулез
кожи,
саркоидоз,
отрубевидный
лишай,
гранулематозный панникулит.
Только у 18% пациентов грибовидный микоз был первым диагнозом
(рис. 2). Необходимо отметить, что у 15,4% пациентов устанавливали более 2
различных диагнозов, сменявших друг друга. Более 25% пациентов получали
системную терапию по поводу неверно установленного диагноза такими
препаратами, как метотрексат, неотигазон, циклоспорин. препараты ГКС
(преднизолон, метипред, дипроспан), плаквенил.
Рисунок 2. Первоначальные диагнозы больных грибовидным микозом
Результаты
исследования
с
применением
метода
масс-
спектрометрии MALDI-TOF. Образцы сыворотки крови от 23 больных
грибовидным микозом, 29 больных псориазом и 22 здоровых доноров крови
были проанализированы методом масс-спектрометрии. Для обработки
данных были использованы значения площадей масс-спектрометрических
пиков во всех образцах. Сравнение групп проводили по 182 пикам. На
первом этапе статистической обработки данных проводилась проверка
отдельных масс-спектрометрических пиков на возможность использования в
16
качестве биомаркеров, на втором этапе – разработка диагностического
алгоритма с применением панели пиков.
При сравнении масс-спектрометрических пиков в группах больных
грибовидным микозом и псориазом достоверные различия были обнаружены
по 2 белковым пикам с m/z 4326 Да и 7674 Да (р<0,05). При сравнении
данных в группах больных грибовидным микозом и здоровых доноров крови
статистически значимые различия (р<0,05) были обнаружены по 3 белковым
пикам: m/z 14689 Да, 7848 Да и 4184 Да. Для оценки диагностического
качества
данных
маркеров
проводили
расчет
чувствительности,
специфичности, точности и PPV, которые представлены в таблице 3.
Методом ROC-анализа определяли диагностическое качество данных
белковых
пиков,
в
соответствии
с
экспертной
шкалой
AUC
оно
расценивается как хорошее (AUC>0,7).
Результаты
проведенного
исследования
доказывают,
что
использование масс-спектрометрической технологии MALDI-TOF позволяет
с достаточно высокой точностью проводить диагностику грибовидного
микоза с использованием отдельных белковых пиков. Необходимо отметить,
что точность диагностического алгоритма, основанного на использовании
панели пиков, не превышала 77%. Таким образом, показано, что наиболее
перспективной является разработка метода диагностики грибовидного
микоза,
основанная
на
отдельных
белках-биомаркерах,
спектрометрические пики которых представлены в таблице 3.
масс-
17
Таблица 3. Пики белков, имеющие достоверные отличия между исследуемыми группами
m/z
AUС Точность, % Чувствительность, % Специфичность, %
PPV,%
Порог
пиков, Да
отсечения
Пики белков, имеющие достоверные различия в группах больных грибовидным микозом и псориазом
4326
0,78
75
65,2
82,7
75
71*
7674
0,76
69
60,9
75,9
70,9
14*
Пики белков, имеющие достоверные различия в группах больных грибовидным микозом и здоровых доноров
4184
0,73
71,1
56,5
86,3
81,3
25,2**
7848
0,75
75,5
69,5
81,8
72
9,9**
14689
0,73
77,7
78,2
77,2
77,2
14,23*
* достоверные различия между группами при р<0,005; ** достоверные различия между группами при р<0,001
Таблица 4. Цитокины, концентрация которых в сыворотке крови достоверно отличается между группами
Название
цитокина
AUC
IL-1Ra
0,85
Точность,
%
Чувствитель
ность, %
Специфичность,
%
Порог отсечения
концентрации цитокина,
пг/мл
Цитокины, концентрация которых достоверно отличается в сыворотке крови больных ГМ и здоровых доноров
PPV,%
82,2
91,3
72,7
88
58,77**
IL-4
0,77
75,5
91,3
59
86
4,53*
G-CSF
0,82
80
78,2
81,8
78
17,33**
IP-10
0,92
88,8
82,6
95,4
84
3233,9**
Цитокины, концентрация которых достоверно отличается в сыворотке крови больных ГМ и псориазом
IP-10
0,8
76,9
65,2
86,2
75
5264,84**
* достоверные различия между группами при р<0,005; ** достоверные различия между группами при р<0,001
18
Результаты изучения уровня цитокинов в сыворотке крови
больных грибовидным микозом с применением технологии xMAP. С
целью обнаружения молекулярных маркеров, представленных в сыворотке
крови в более низких концентрациях, чем это возможно определить
методами масс-спектрометрии, нами был проведен анализ ряда целевых
белков, в качестве которых были выбраны цитокины, с применением
технологии xMAP. На приборе BioPlex-200 (BioRad), в сыворотках крови
больных ГМ, псориазом и здоровых людей было проанализировано
содержание 27 цитокинов: PDGF-bb, IL-1b, IL-1ra, IL-2, IL-4, IL-5, IL-6, IL-7,
IL-8, IL-9, IL-10, IL-12, IL-13, IL-15, IL-17, Eotaxin, FGF basic, G-CSF, GMCSF, IFN-γ, IP-10, MCP-1(MCAF), MIP-1a, MIP-1b, RANTES, TNF-a, VEGF.
При сравнении полученных данных в группах больных грибовидным
микозом и здоровых доноров крови достоверные различия были обнаружены
в концентрациях 4 цитокинов: IL-1ra, G-CSF, IP-10 (p<0,001) и IL-4 (р<0,05).
Все перечисленные цитокины были значительно повышены в группе
больных
ГМ.
Результаты
представлены
в
таблице 4.
Установлено
достоверное увеличение концентрации IP-10 (р<0,001) у больных ГМ при
сравнении с больными псориазом.
Таким образом, наиболее значимое увеличение концентрации в
сыворотке крови у больных грибовидным микозом выявлено для цитокина
IP-10. В группе больных ГМ этот показатель составил 13,5± 2,8 нг/мл [M±m],
тогда как у больных псориазом – 3,3±0,5 нг/мл, у здоровых доноров крови –
1,8±0,2
нг/мл
(рис.3).
Таким
образом,
IP-10
является
наиболее
перспективным цитокином для использования в качестве молекулярного
маркера грибовидного микоза. IP-10 (interferon-γ inducible protein-10,
СХСL10) – индуцированный интерфероном-γ белок, является хемокином. Он
принадлежит к семейству CXC хемокинов и играет важную роль в процессе
воспаления, привлекая Т-лимфоциты в очаг воспаления путем модуляции их
адгезии к эндотелиальным клеткам и трансмиграции в ткани. В коже
продукция хемокинов осуществляется кератиноцитами в ответ
19
22000
Концентрация IP-10 в сыворотке крови, пг/мл
20000
18000
16000
14000
12000
10000
8000
6000
4000
2000
Mean
±0,95 Conf . Interv al
0
Больные ГМ
Больные
псориазом
Здоров ые доноры
кров и
Рисунок 3. Концентрация IP-10 в сыворотке крови
больных ГМ, псориазом и здоровых доноров
на различные стимулы, например, на синтез IFN-γ активированными Тлимфоцитами или TNF-α – макрофагами (D.M. Boorsma и соавт., 1994, X.S.
Wu и соавт., 2009, D.M. Boorsma и соавт., 1998). Рецептором IP-10 является
CXCR3, который экспрессируется на Т-лимфоцитах (преимущественно Th1типа), и, в меньшей степени, на эозинофилах, моноцитах и NK-клетках (R.
Bonecchi и соавт., 1998, D.D. Taub и соавт., 2001, T. Jinquan и соавт., 2000).
Гипотеза патогенеза Т-клеточных лимфом кожи с участием IP-10 была
предложена A.H. Sarris с соавторами (A.H. Sarris и соавт., 1995). Первый этап
заключается в хоуминге в кожу активированных или атипичных Тлимфоцитов, путем связывания лимфоцит-ассоциированного антигена (CLA)
с
Е-селектином,
который
экспрессируется
в
коже
при
реакциях
гиперчувствительности замедленного типа или хроническом воспалении,
часто предшествующих развитию ТКЛК. Эти лимфоциты продуцируют IFNγ, в ответ на который кератиноциты эксперссируют IP-10. Это второй этап,
заключающийся в эпидермотропизме активированных Т-лимфоцитов. На
третьем этапе кератиноциты связываются с лимфоцитами посредством
межклеточных молекул адгезии (ICAM), что, вероятно, приводит к
формированию микроабсцессов Потрие (A.H. Sarris и соавт., 1995).
Результаты наших исследований также согласуются с этой гипотезой, так как
20
концентрация IP-10 не только повышена в сыворотке крови больных
грибовидным
микозом,
но
и
увеличивается
при
прогрессировании
заболевания (см. далее), то есть при усилении инфильтрации кожи Тлимфоцитами.
Разработан
диагностический
алгоритм
грибовидного
микоза
с
применением цитокина IP-10 в качестве молекулярного маркера. Для
дифференцировки сыворотки крови больных грибовидным микозом от
сывороток крови здоровых доноров и больных псориазом методом xMAP
установлен пороговый уровень концентрации IP-10 – 5,3 нг/мл, который
может
использоваться
для
диагностики
грибовидного
микоза.
Чувствительность метода в данном случае составляет 65,2%, специфичность
– 86,2%, прогностическая ценность положительного диагноза – 75%.
Качество диагностики по данным ROC-анализа расценивается как очень
хорошее (AUC>0,8).
Распространенным подходом к увеличению точности диагностики
является совместное использование нескольких маркеров. С целью поиска
оптимальной
диагностической
панели
цитокинов
мы
использовали
различные методы многомерной статистики.
Наибольшая точность алгоритма диагностики ГМ была достигнута при
последовательном определении в сыворотке крови концентрации двух
цитокинов: IP-10 и IL-6 (рис. 4). При концентрации цитокина IP-10 в
сыворотке крови выше 7,3 нг/мл пациенту ставится диагноз грибовидный
микоз с точностью до 90%. Если концентрация IP-10 ниже 7,3 нг/мл, то
переходят к оценке концентрации IL-6 в сыворотке крови. Если она выше 13
пг/мл, то при наличии у пациента характерных клинических проявлений
диагностируется псориаз. В том случае если концентрация IL-6 в сыворотке
крови ниже 13 пг/мл, у пациента нельзя исключить наличие грибовидного
микоза. Данная категория пациентов является «группой риска», их
необходимо направлять на дополнительные методы обследования и они
должны оставаться на диспансерном учете.
21
Рисунок 4. Диагностический алгоритм "древо принятия решений" для дифференциальной диагностики ГМ, псориаза и нормы,
основанное на определении концентрации двух цитокинов IP-10 и IL-6 в сыворотке крови
22
При реализации алгоритма диагностики с определением в сыворотке
крови концентрации 27 цитокинов методом хМАР с последующей
обработкой данных с применением линейного дискриминанта Фишера, его
точность составила 80%.
Анализ
уровня
цитокинов
в
сыворотке
крови
больных
грибовидным микозом на разных стадиях заболевания. Выявлена прямая
корреляция концентрация цитокинов IL-10 и IP-10 в крови больных
грибовидным микозом со стадиями грибовидного микоза (rs=0,52 и 0,51
соответственно, при р=0,05). Напротив, концентрация цитокина RANTES
достоверно снижается по мере увеличения тяжести заболевания (rs=0,5, при
р=0,05).
Выводы
1.
При анализе данных анамнеза больных грибовидным микозом
установлено, что длительность периода от момента появления первых
симптомов заболевания до постановки диагноза «грибовидный микоз»
составила от 1 месяца до 23 лет (5,5 лет ± 0,84 года), при этом 23,1%
пациентов уже имели III стадию заболевания.
2.
Изучение протеомных профилей сыворотки крови больных
грибовидным микозом и псориазом методом MALDI-TOF показало наличие
2 пиков белков с m/z 4326 Да и 7674 Да (р<0,05), позволяющих их
использовать для дифференциальной диагностике этих заболеваний с
точностью 69% и 75% соответственно. Качество диагностики с применением
этих пиков по результатам ROC-анализа расценивается как хорошее
(AUC>0,7).
Выявлены 3 масс-спектрометрических пика белков с m/z 14689 Да;
7848 Да и 4184 Да, концентрация которых в сыворотке крови достоверно
отличается (р<0,05) у больных грибовидным микозом и здоровых доноров
крови. Точность диагностики в этом случае составляет 73%, 75% и 73%
23
соответственно, ее качество по результатам ROC-анализа расценивается как
хорошее (AUC>0,7).
3.
При
изучении
уровня
цитокинов
в
сыворотке
крови
с
применением технологии xMAP было показано, что у больных грибовидным
микозом определяется значительное увеличение концентрации 4 цитокинов:
IL-1ra, G-CSF, IP-10 (p<0,001) и IL-4 (р<0,05) по сравнению с результатами
здоровых лиц, и цитокина IP-10 (p<0,001) - по сравнению с больными
псориазом.
4.
Выявлена прямая корреляционная связь концентрации цитокинов
IP-10 и IL-10 (rs=0,52 и 0,5 при р=0,05) и обратная корреляционная связь
концентрации цитокина RANTES (rs=0,51 при р=0,05) в сыворотке крови
больных грибовидным микозом со стадиями заболевания, что указывает на
патогенетическую значимость этих цитокинов при данном заболевании.
5.
Разработан
алгоритм
диагностики
грибовидного
микоза,
основанный на определении концентрации цитокина IP-10. При уровне IP-10
в сыворотке крови выше 5,3 нг/мл, точность диагноза грибовидный микоз
составляет 76,9%. Качество алгоритма по результатам ROC-анализа
расценивается как очень хорошее (AUC>0,8). В случае необходимости
дифференциальной диагностики грибовидного микоза и псориаза возможно
применение алгоритма, основанного на последовательном определении в
сыворотке крови концентрации цитокинов IP-10 и IL-6 и имеющего вид
«древа принятия решений». Точность данного алгоритма диагностики
составляет 90%.
24
Список работ, опубликованных по теме диссертации:
1.
Братцева Е.В. Протеомные исследования в дерматологии/ Е.В.
Братцева// Сб. тез. науч. раб. X Всерос. съезда дерматовенерологов. – М.,
2008. – С.17.
2.
дерматозов
Братцева Е.В. Поиск потенциальных биомаркеров хронических
с
помощью
протеомного
анализа/
Е.В.
Братцева,
С.А.
Мошковский, Л.Ф. Знаменская и др.// Вестн. дерматол. венерол. – 2010 – №2.
- С.13-20.
3.
Братцева Е.В. Оценка возможности диагностики грибовидного
микоза с помощью прямого протеомного профилирования сыворотки крови/
Е.В. Братцева, Е.Е. Соколова, М.А. Пятницкий и др.//Сб. тез. науч. раб.
«Санкт-Петербургские дерматологические чтения». – СПб., 2010. – С.35-36.
Download