Здесь представлен перевод мини-инструкции по работе с поисковой системой PubMed. Этот документ предназначен для слушателей второго семинара по Доказательной медицине. Он будет полезен для предварительного чтения перед вторым вебинаром. Распечатанная копия документа будет полезна Вам и во время проведения второго вебинароа. Перевод подготовлен компанией КОМСОФТ, которая в настоящее время занимается переводом расширенного руководства по работе с ресурсом PubMed. Материалы переводов будут в будущем Вам рассылаться. Быстрый Старт в PubMed? Оглавление Как искать в PubMed? Как осуществить поиск по автору? Как осуществить поиск по названию журнала? Как найти определенную ссылку на публикацию? У меня имеется исходная информация такая, как автор, название журнала и дата (год) публикации статьи Какие имеются особенности поиска по клиническим (относящимся к течению или симптомам болезни) поисковым запросам? Категории Клинических Исследований Как осуществить поиск по систематическим обзорам или медицинской генетике? Не могли бы вы объяснить результат поиска? Как посмотреть аннотацию? Как можно получить копию статьи? Как сохранить результаты поиска? На результирующей странице поиска очень много ссылок. Как можно уточнить (сузить) результаты поиска? На результирующей странице поиска слишком мало ссылок. Как можно расширить поисковый запрос? Я на нашел того, что нужно. Как заставить поиск в PubMed работать? Мне нужна дополнительная помощь и обучение o Связь с технической поддержкой o Другие NLM публикации Как искать в PubMed? 1. Определите ключевые слова, которые соответствуют поисковому запросу. 2. Введите термины (или ключевые слова) в поле поиска. 3. В момент ввода термина в поле поиска всплывет автоматическая подсказка. нажмите Turn off (Отключить) для временного отключения функции автоматической подсказки. 4. Нажмите Search (Поиск). Перейдите по этой ссылке для осуществления поиска в PubMed по запросу "sleep disorders" (нарушения сна). Пример Какую роль играет боль при расстройствах сна? Ключевые слова: pain (боль) sleep disorders (расстройства сна) Как осуществить поиск по автору? Введите фамилию автора и инициалы (инициалы - без знаков пунктуации(точек) и разделителей) в поле поиска на нажмите Search (Поиск). Примеры Watson JD Lederberg J Нажмите Расширенный поиск для использования Search Builder (Расширенная Форма Поиска), и затем выберите Author (Автор) из раздела меню All Fields (Все Поля). Поисковое поле по автору имеет функцию автозаполнения (при вводе текста). Пример Для поиска ссылок на статьи по gene therapy for cystic fibrosis patients (генной терапии для больных муковисцидозом), написанные Bonnie W. Ramsey, введите следующий поисковый запрос в поле поиска: cystic fibrosis gene therapy ramsey bw Пример Среди статей, опубликованных после 2002 года, можно осуществлять поиск используя полное имя автора (если в статье доступны полные имена авторов): Joshua Lederberg Garcia Algar, Oscar Если известна только фамилия автора, используйте поиск по Автору или специальный тег [au], формат записи: brody[au]. Игнорируемые слова - слова, которые игнорируются в поисковом запросе (по которым не осуществляется поиск) A B C D E F H I J K M N O Игнорируемые слова a, about, again, all, almost, also, although, always, among, an, and, another, any, are, as, at be, because, been, before, being, between, both, but, by can, could did, do, does, done, due, during each, either, enough, especially, etc for, found, from, further had, has, have, having, here, how, however i, if, in, into, is, it, its, itself just kg, km made, mainly, make, may, mg, might, ml, mm, most, mostly, must nearly, neither, no, nor obtained, of, often, on, our, overall P Q R S perhaps, pmid quite rather, really, regarding seem, seen, several, should, show, showed, shown, shows, significantly, since, so, some, such than, that, the, their, theirs, them, then, there, therefore, these, they, this, those, through, thus, T to U upon, use, used, using V various, very W was, we, were, what, when, which, while, with, within, without, would Если имя автора (или инициалы) содержит только игнорируемые слова, используйте тег поиска по автору [au] в комбинации с другими терминами (ключевыми словами), например, just by[au] seizure. Как осуществить поиск по названию журнала? Введите название журнала или аббревиатуру в поисковое поле. Пример Для поиска ссылок на статьи о drosophila (дрозофила) в журнале Molecular Biology of the Cell (Молекулярная биология клетки) введите следующий поисковый запрос: molecular biology of the cell drosophila Нажмите Расширенный поиск для использования Search Builder (Расширенная Форма Поиска), и затем выберите Journal (Журнал) из раздела меню All Fields (Все Поля). Поисковое поле по журналу имеет функцию автозаполнения (при вводе текста). Как найти определенную ссылку на публикацию? У меня имеется исходная информация такая, как автор, название журнала и дата (год) публикации статьи Используйте Single Citation Matcher (Поиск Соответствующей Ссылки) для поиска ссылок с помощью заполняемому бланку (формату): 1. Нажмите Single Citation Matcher с главной страницы PubMed или используйте в режиме Advanced search (Расширенный поиск) Search Builder (Расширенную Форму Поиска). 2. Введите информацию, которая имеется, в соответствующие поля ввода в бланке поискового запроса. 3. Нажмите Go (Начать поиск). Какие имеются особенности поиска по клиническим (относящимся к течению или симптомам болезни) поисковым запросам? На странице Clinical Queries (Клинические Запросы) можно осуществить поиск по clinical study category (категория клинические исследования), найти systematic reviews (систематические обзоры) и запустить поиск по исследованиям в области медицинской генетики Категории Клинических Исследований Для поиска в Clinical Study Categories (Категории Клинических Исследований) используются встроенные поисковые фильтры, которые сужают область поиска (и соответствующее число ссылок на статьи в поисковом отчете) в соответствии с выбранной методологией и поисковым запросом. Для поиска ссылок в определенно категории клинических исследований: 1. Нажмите Clinical Queries (Клинические Запросы) с главной страницы PubMed или используйте Advanced search (Расширенный поиск) 2. Нажмите Search by Clinical Study Category (Поиск Клинических Исследований по Категории). 3. Введите термины и ключевые слова в поле поиска. 4. Выберите соответствующую категорию: therapy (терапия), diagnosis (диагностика), etiology (этиология, причины болезней), или prognosis ( прогнозирование). 5. Выберите область (охват) поиска: narrow, specific search (узкий, определенный запрос) или broad sensitive search (широкий запрос, с учетом регистра). 6. Нажмите Go (Начать поиск). Пример Если Вы исследуете клинический аспект генотерапии для кистозного фиброза (gene therapy for cystic fibrosis), со страницы Clinical Queries (Клинические Запросы) выберите категорию “therapy” (терапия) и Область(охват) “narrow, specific search” (узкий, определенный запрос) и введите следующие термины в поле поиска: cystic fibrosis gene therapy Как осуществить поиск по систематическим обзорам или медицинской генетике? В PubMed Systematic Reviews (Систематические Обзоры) охватывают широкий набор статей, которые представляют собой объединенные сравнительные исследования и заключения по различным медико-биологическим темам. Поиск по Medical Genetics Searches (Исследования в области Медицинской Генетики) помогает найти ссылки на соответствующие темы по медицинской генетике. 1. НажмитеClinical Queries (Клинические Запросы) с главной страницы PubMed или используйте Advanced search (Расширенный поиск) 2. Выберите Find Systematic Reviews (Поиск по Систематическим Обзорам) или Medical Genetics Searches (Поиск в области Медицинской Генетики). 3. Введите ключевые слова (термины) в поисковое поле. 4. Для Medical Genetics Searches (Поиск в области Медицинской Генетики), выберите категорию поиска, если необходимо. 5. Нажмите Go (Начать поиск). Пример Если вы исследуете систематические обзоры по ингаляционной терапии при пневмонии (inhalation therapy for pneumonia), со страницы Clinical Queries выберите (Клинические Исследования) Systematic Reviews (Систематические Обзоры) и введите следующие термины в поле поиска: inhalation therapy pneumonia Пример Для поиска информации по серповидно-клеточной анемии и генетической консультации (sickle cell anemia and genetic counseling) со страницы Clinical Queries (Клинические Исследования) выберите Medical Genetic Search (Поиск в области Медицинской Генетики), нажмите на разворачивающийся список All и выберите Genetic Counseling (Генетическая Консультация). и введите следующие термины в поле поиска: sickle cell anemia Не могли бы вы объяснить результат поиска? Результат поиска в PubMed отображается в сжатой форме, смотрите Anatomy of Search Results Page (Структура Результирующей Страницы Поиска) ниже. На результирующей странице, по умолчанию, отображается 20 элементов(ссылок), последние размещенные ссылки отображаются в выше. Вы можете навести указатель мыши на название журнала, для просмотра полого названия журнала. (Структура Результирующей Страницы Поиска) Как посмотреть аннотацию? Нажмите на название статьи для просмотра аннотации. Для ссылок, не имеющих аннтоации, отобразится “No abstract available” (аннотация недоступна) . Как можно получить копию статьи? Результаты поиска в PubMed не включают электронную копию статьи из журнала. Однако, аннотация к статье может включать ссылку на электронные копии журналов из других источников (не PubMed), таких как, непосредственно сайты журналов или издательств. Для использования электронных материалов (электронные журналы) может потребоваться подписка, или они могу быть доступны (открытый доступ) через местную медицинскую библиотеку. В дополнение, некоторые электронные журналы могут предоставлять бесплатный доступ. Имейте ввиду возможность посещения местной медицинской библиотеки, в случае, если доступ к электронной версии статьи отсутствует (либо статья не представлена в электронном виде). Для получения подробной информации смотрите Как получить статью из Журнала. Как сохранить результаты поиска? Существует несколько способов для сохранения Результатов поиска в PubMed, которые включают использования буфера обмена (Clipboard) для временного сохранения ссылок и My NCBI Collections для сохранения результатов поиска на длительное время. 1. Установите флажки рядом со ссылками, которые нужно сохранить. 2. Из выпадающего списка Send to (Отправить), выберите Clipboard (Буфер Обмена). 3. Для просмотра сохраненных результатов выберите Clipboard item elements (Элементы буфера обмена). Для получения дополнительной информации смотрите Временное сохранения ссылок используя буфер обмена и My NCBI Colections. Для использования других возможностей сохранения, смотрите: Сохранение и Управления Результатами поиска Создание ссылки для Добавления Результата поиска в Избранное Сохранения ссылок в текстовый файл Экспорт ссылок в программу-справочник На результирующей странице поиска очень много ссылок. Как можно уточнить (сузить) результаты поиска? Для уточнения результатов поиска: Замените общие термины более специфичными (т.е., поиск "low back pain" заместо "back pain" "боли в пояснице", "боли в спине"). Добавить дополнительные термины и ключевые слова к поисковому запросу. Использовать ограничители для выборки ссылок по возрастным группам, языку, типу публикации, дате, типу исследования, и т.д. Нажмите Manage Filters (Настроить фильтры) в разделе Filter your results (Фильтрация результатов поиска) для изменения настроек фильтров в My NCBI. Пример Если поиск по pain sleep disorders (боль и расстройства сна) дал слишком много ссылок, добавьте более специфичные термины или ключевые слова к поисковому запросу, такие как facial pain sleep disorders (лицевая боль и расстройства сна). На результирующей странице поиска слишком мало ссылок. Как можно расширить поисковый запрос? Нажмите ссылку Related citations See all (Просмотр всех ссылок по теме) для просмотра автоматически подборки ссылок в PubMed, которые относятся к тематике статьи. Уберите посторонние или слишком специфичны термины из поикового поля. Попробуйте использовать схожие по смыслу термины для описания сути вашего поискового запроса. Пример Если поиск по facial pain sleep disorders (лицевая боль и расстройства сна), дал слишком мало ссылок, расширьте область поиска для получения большего количества ссылок, удалив специфичные термины из поискового запроса, например, pain sleep disorders (боль и расстройства сна). Я на нашел того, что нужно. Как заставить поиск в PubMed работать? PubMed может скорректировать ваш поисковый запрос для улучшения поиска. Для того, чтобы посмотреть как PubMed модифицирует ваш поисковый запрос, нажмите Advanced search (Расширенный Поиск) Details. Вы можете скорректировать поисковый запрос более детально. Для получения более подробной информации смотрите How PubMed works: Automatic Term Mapping. Пример Вы ищете ссылки по cystic fibrosis (кистозный фиброз) по аббревиатуре cf, а результат поиска cf search дает ссылки, которые не соответсвуют теме cystic fibrosis (кистозный фиброз). Для того, чтобы понять откуда возвращаются данные ссылки, нажмите Advanced search Details (Расширенный Поиск, Подробнее) для просмотра того, как PubMed преобразовал термины cerebrospinal fluid или cf в строке поискового запроса.