Краткий отчёт ФГБУН НИИ ФХМ ФМБА России за 2013 год

Краткий отчет
о научно-производственной деятельности ФГБУН НИИ ФХМ ФМБА
России в 2013г.
Структура и численность ФГБУН НИИ ФХМ ФМБА России
Раздел «Наука» - 264 человек
Научные сотрудники – 169, в том числе в возрасте до 39 лет - 53
Кандидатов наук – 74 человек, в том числе в возрасте до 39 лет - 15
Докторов наук – 27 человек, в том числе в возрасте до 39 лет - 0
Академиков РАМН – 3
Член-корр. РАМН -3
Раздел «Поликлиника» - 78 человек
Недвижимость ФГУ НИИФХМ ФМБА России
Вид деятельности – бюджетная
Основные средства (наличие на конец 2013г.)
– 288 362945,21
- Жилые помещения
- Нежилые помещения
- 19 176 322,00
- Сооружения
3533,00
- Машины и оборудование
- 262 368 751,54
- Транспортные средства
- 2 542 592,00
- Производственный и хозяйственный инвентарь - 4 271 746,67
- Библиотечный фонд
Вид деятельности – приносящая доход деятельность
Основные средства (наличие на конец 2013г.)
– 80 463 870,48
- Жилые помещения
- Нежилые помещения
- Сооружения
- Машины и оборудование
- 75 851552,99
- Транспортные средства
- Производственный и хозяйственный инвентарь - 4 612 318,49
- Библиотечный фонд
-
Финансово-экономическое положение учреждения
В отчетном периоде (2013г.) для выполнения государственного задания
было выделено в виде субсидий на общую сумму 53 765 100 руб., в том
числе:
- раздел/подраздел 0908 0819900 611 –40 112 000 руб.;
- раздел/подраздел 0908, 4719900 611 – 13 653 100 руб.
По состоянию на 01.01.2014г. перечислено утвержденных субсидий в полном
объеме.
В рамках соглашения о порядке и условиях предоставления субсидий из
федерального бюджета на цели, не связанные с возмещением нормативных
затрат на оказание государственных услуг, целевых субсидий на 2013 год
перешел неиспользованный остаток 2012 года в размере 17 343 477,70
рублей. Получено субсидий в 2013 году 9 186 574,80 рублей.
Доходы, полученные от приносящей доход деятельности, - 188 356 674
руб.
Основные итоги научно-исследовательских работ
Научно-исследовательскаядеятельность
В соответствии с планом и техническим заданием на разработку
научно-технической продукции, утвержденными ФМБА России, в 2013 году
в НИИФХМ выполнялись три темы: «Разработка и внедрение методов
постгеномной биологии в клиническую практику» (Шифр «Маркер»),
«Разработка технологической платформы для создания диагностических
устройств нового поколения с использованием микрофлюидных технологий»
(Шифр «Микрофлюидика»), «Исследование молекулярных механизмов
патогенеза социально-значимых заболеваний» (Шифр «Патогенез»).
Основные итоги:
В ходе протеомного исследования был разработан метод выделения
из сыворотки крови наборов пептидов, репрезентативных для
колоректального рака. Такой подход основан на фракционировании
сыворотки
крови
с
помощью
магнитных
микрочастиц
с
функционализированной поверхностью и последующей регистрацией
выделенных пептидов МАЛДИ масс-спектрометрией. Использованные
методы разделения крови позволили достоверно выявить пациентов с раком
толстого кишечника и пациентов контрольных групп. Охарактеризован
набор наиболее информативных и воспроизводимых протеомных
маркеров, ассоциированных с патологией. Для оценки вклада
генетических факторов в патогенез колоректального рака были
проанализированы образцы ДНК, выделенные из биоптатов толстого
кишечника. В ходе секвенирования генов TP53, APC, KRAS, BRAF и
CTNNB1 был охарактеризован спектр генетических изменений,
ассоциированных с колоректальным раком. Существенно дополнена база
данных по патогенным мутациям в исследованных генах. В частности,
выявлено 8 новых вариантов мутаций в гене TP53, 20 - в гене APC, 6 – в гене
KRAS и ранее не охарактеризованная протяженная делеция гена CTNNB1.
Общая выявляемость патологических изменений составила 57,8 %, что
свидетельствует о высокой информативности анализа таких генетических
вариантов для оценки риска развития новообразований. Впервые проведена
оценка профиля метилирования промоторных областей ДНК трех
кандидатных генов колоректального рака: SMARCA3, SEPT9 и CDH1. В ходе
секвенирования бисульфит-конвертированной ДНК были показаны
достоверные различия в уровне метилирования промоторов генов SMARCA3
и SEPT9 в образцах опухолевой ткани и образцах неизмененного эпителия
тех же пациентов.
Сравнительный анализ оптически прозрачных поверхностей для
микрофлюидных систем методом атомно-силовой микроскопии показал
преимущества ПДМС и слюды с локальными шероховатостями не более 10
нм. Неоднородности поверхности полистирола превышают аналогичные
характеристики ПДМС и слюды. Химическая модификация оптически
прозрачных поверхностей посредством аминирования и изотиоцианирования
в органических растворителях приводит к нарушениям их прозрачности,
поэтому оптимальным является аминирование в водных растворах
полиаллиламинов.
Для диагностики разработаны способы получения: 1) коллоидного
золота с сорбцией очищенных антигенов; 2) наночастиц коллоидного серебра
или золота, покрытых оболочкой диоксида кремния и вследствие этого
стабильных при хранении и химических модификациях, необходимых для
иммобилизации антигенов и антител, и поэтому более перспективных для
дальнейших разработок микрофлюидных диагностических систем.
Для конструирования микрофлюидной системы были выбраны
оптически прозрачные материалы с наименьшей шероховатостью, получены
наночастицы коллоидов серебра и золота, покрытых оболочкой из диоксида
кремния, на поверхности которых иммобилизованы белковые антигены, и
предложены два способа детекции оптических сигналов коллоидного
серебра, для регистрации которых разработано программное обеспечение.
Таким образом, поставленные задачи первого этапа полностью решены.
Сформирована база данных, содержащая информацию о результатах
метагеномного анализа образцов микробных сообществ, выявлены
ассоциации между компонентами микробного состава и рядом заболеваний
человека (иммунодефицит у детей, связанный с химиотерапией; нарушение
баланса микробиоты у сотрудников вредного производства).
Показано, что рисперидон и зонд К-35, как и фенилбутазон,
связываются с альбумином в первом лекарственном центре, который служит
основным местом связывания лекарств. Обнаружено, что первый
лекарственный центр альбумина может находиться в разных структурных
состояниях, то есть имеется структурная гетерогенность альбумина. Разные
структурные формы этого связывающего центра различаются во много раз
способностью связывать лекарства, а жирные кислоты существенно влияют
на этот показатель.
Проведено исследование эффективности топического применения и
влияния на показатели противовирусного иммунитета иммунотропного
пептида аллоферона у 45 пациенток, страдающих папилломавирусной
инфекцией. Применение аллоферона у пациенток с
хронической
папилломавирусной инфекцией способствовало полному подавлению
репликацию ВПЧ у 11 из 45 (24,4%) обследованных женщин, в 22 случаях
(48,8%) отмечалась тенденция куменьшение концентрации ДНК ВПЧ (в
среднем на 30,1%) и в 12 случаях (26,6%) концентрации ДНК ВПЧ не
изменилась или даже увеличилась. Наибольшее количество случаев - 6 из 15
(40%), элиминации в цервикальном мазке ДНК ВПЧ наблюдалось в группе
женщин, получавших Аллоферон в дозе 0,5 мг.
При изучении влияния иммуноглобулинов на рост фибросаркомы у
мышей было установлено, что скорость роста опухоли у контрольных (без
инъекций IVIG) мышей линий СВА и С57/b достоверно не отличается. В то
же время на фоне применения IVIG наблюдалось замедление роста опухоли
по сравнению с контрольной группой у мышей СВА и ускорение – у мышей
С57b. Доля нейтрофилов в крови мышей СВА под действием IVIG
становилась достоверно выше, чем у интактных мышей и у мышей СВА без
введения IVIG. Сопоставление данных о размерах опухоли и о содержании
нейтрофилов указывает на связь между этими показателями
Было изучено влияние гормона тимуса тимулина и иммунотропных
препаратов из селезенки и кожи, не изученных ранее, на память,
обучение и болевую чувствительность в норме и при стрессе.
Был
проведен
химический
синтез
набора
аналогов
тромбиновогоаптамера TBA с триазольной модификацией межнуклеотидных
связей, их очистка методом ВЭЖХ и подтверждение чистоты/структуры
методом MALDI-TOF MS-спектрометрии. Физико-химическими методами
(УФ-спетроскопия, спектроскопия кругового дихроизма) исследована
структура полученных соединений. Определены стабильность новых
аптамеров по отношению к нуклеазам (кинетика нуклеазного расщепления с
детекцией методом EMSA) и их антикоагуляционная активность (IC50) в
тесте на тромбиновое время. Несколько аптамеров продемонстрировали
достаточно высокуюбиостабильность при сохранении ингибиторной
активности. Анализ результатов выявил лидерное соединение, которое может
быть использовано в антикоагуляционных препаратах в качестве основного
действующего вещества.
Кроме этого в 2013 году выполняются научно-исследовательские
работы по следующим программам:
ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям
развития научно-технологического комплекса России на 2007-2013
годы»
Разработка и выпуск опытных образцов тест-системы для
обнаружения лекарственно-устойчивого туберкулеза с учетом особенностей
геномной организации эндемичных для России штаммов
ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной
России»
- Создание мультифункциональной репортерной системы для оценки
биоактивности различных химических веществ и биологических факторов
неизвестного происхождения
Гранты РФФИ
- Разработка фундаментальных подходов к идентификации и коррекции
атерогенных форм липопротеинов низкой плотности, возникающих под
действием провоспалительного фермента – миелопероксидазы.
- Разработка методики оценки содержания наночастиц золота в крови и
исследование влияния наночастиц на клетки крови, а также систему
свертования.
- Расшифровка механизмов регуляции функции клеток природными
реактивными оксидантами, относящимися к необратимым ингибиторам
молекулярных мишеней.
- Нековалентная функционализация однослойных углеродных нанотрубок
как способ регуляции их взаимодействия с тромбоцитами и нейтрофилами.
- Механизмы регуляции миелопероксидазой функциональных ответов
клеток крови при воспалении.
- Анализ биологического потенциала важнейших белков во вторичном
метаболизме бактериальных симбиотов человека с использованием данных
метагеномноного секвенирования.
- Поиск новых систем регуляции экспрессии генов бактерий на модели
Mycoplasmagallisepticum
- Расшифровка механизмов формирования детерминант патогенности
стрептококками группы viridans на основании сравнения полноразмерных
нуклеотидных последовательностей их геномов
ФЦП «Развитие фармацевтической и медицинской промышленности
Российской Федерации на период до 2020 года и дальнейшую
перспективу»
-Разработка
технологии
и
организации
производства
иммунодиагностических тест-систем на основе микрофлюидных технологий
и наноструктурированных материалов.
Отраслевые программы ФМБА России
- Оценка уровня интенсивности каскадов биохимических реакций
метаболизма лекарственных препаратов на основе метаболомных и
протеомных показателей высококвалифицированных спортсменов в
различных фазах тренировочного процесса (шифр АТЛЕТИКА 13);
- Изучение индивидуальных особенностей генетического статуса
высококвалифицированных спортсменов различных видов спорта и
разработка
индивидуальных
алгоритмов
подготовки
на
основе
вариабельности генов, ассоциированных с метаболомом экзогенных
циклических липидов (шифр ЛИПИДЫ 13).
КОНТРАКТ № 004-2/13/2013-9 на выполнение составной части научноисследовательской работы «Поиск, синтез и тестирование новых
антигипоксических соединений пептидной природы» шифр «Поиск-2-ФХМ»
между ФГУ «НИИ ГПЭЧ» ФМБА России и ФГУ НИИ ФХМ ФМБА России.
По итогам научно-исследовательской работы опубликовано 60
научных статей (в том числе 25 в зарубежных изданиях), сделано 45 научных
докладов на отечественных и зарубежных конференциях, симпозиумах,
съездах, получено 2 патента, подано 6 заявок на патент, защищены 1
докторская и 2 кандидатские диссертации
Внебюджетная деятельность
В 2013г. внебюджетная деятельность ФГУ «НИИ физикохимической медицины» ФМБА России осуществлялась по следующим
программам и договорам:
 ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям
развития научно-технологического комплекса России на 2007-2013 годы»;
 ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России»;
 ФЦП «Развитие фармацевтической и медицинской промышленности
Российской Федерации на период до 2020 года и дальнейшую
перспективу»
 Программы ФМБА России по спорту;
 Гранты РФФИ;
 Платные услуги поликлинического отделения института.
Внедрение результатов
Внедрение результатов проведенных научных исследований
осуществляется путем участия в международных и отечественных
конференциях, выставках, проведения научных семинаров для врачейлаборантов, обучения специалистов по программам последипломного
образования, чтения лекций и проведения практических занятий для
студентов МФТИ, ММА им. И.М. Сеченова, МБФ РГМУ, МГМСУ, а также
внедрения новых разработок в лаборатории научно-исследовательских
институтов и клинических учреждений.
В отчетном периоде 2013г. сотрудники института принимали участие
в ежегодной сессии американской коллегии кардиологов (Сан-Франциско,
США), в международном симпозиуме «Здоровое сердце» (Кельн, Германия),
в совещании международного клинического испытания по оценке
клинических эффектов препарата Эвацетрабил (Берлин, Германия), в
ХХIYконгрессе международного общества по тромбозу и гемостазу
(Амстерам, Недерланды), 9 ежегодной конференции метаболомного
сообщества (Глазго, Великобритания), в международной научной
конференции Европейского общества генетиков (Париж, Франция) – 2 чел., в
конгрессе Европейского общества по атеросклерозу (Лион, Франция), в 23-м
Европейском конгрессе по клинической микробиологии и инфекционным
болезням (Берлин, Германия), в научной конференции международного
общества по изучению экстрацеллюлярныхмикровезикул (Бостон, США).в
конгрессе Европейского кардиологического общества (Амстердам,
Нидерланды)
–
2
чел.,
в
конференции
InternationalHumanMicrobiomeCongress(Ханчжоу, Китай), в конференции
TheEMBOMeeting 2013 (Амстердам, Нидерланды), в работе школы по
методам изоляции и характеристики экстраклеточныхмикровезикул
(Будапешт, Венгрия), в конференции международного сообщества против
туберкулеза (Париж, Франция), в 5-м конгрессе по сиквенсу (Лондон,
Великобритания).
Подготовка научных кадров
I. Диссертанты и дипломники.Под руководством сотрудников института
выполнены2 кандидатские диссертации и 12 дипломных проектов
студентами РГМУ, МФТИ, ММА им. И.М.Сеченова, МГМСУ.
II. Повышение квалификации – по программам последипломного
профессионального образования подготовлено 30 слушателей из разных
регионов России
Состояние гражданской обороны
Объекты недвижимости, которые находятся в оперативном
управлении института, в основном построены в начале прошлого столетия и
в связи с длительными сроками эксплуатации, а также по конструктивным
особенностям несущих конструкций, не могут быть оборудованы защитными
сооружениями,
объекты
не
имеют
автономных
источников
энергопотребления.
Разработан и согласован с Главным управлением МЧС России по г.
Москве план основных мероприятий ФГБУН НИИ ФХМ ФМБА России в
области гражданской обороны, предупреждения и ликвидации чрезвычайных
ситуаций, обеспечения пожарной безопасности и безопасности людей на
водных объектах на 2014 год. Работники нештатных аварийно-спасательных
формирований (НАСФ) ФГБУН НИИ ФХМ ФМБА России прошли обучение
в учебно-методическом центре ГО и ЧС ЦФО Москвы (Б. Факельный пер.
д2/32) в период с 17 по 21 января 2013 года. Директор института и его
заместители прошли обучение в УНЦ ГО и ЧС ЦАО г. Москвы. Институт
принял участие в проведении Всероссийской тренировки по гражданской
обороне в октябре 2013г.
Направления укрепления, совершенствования и развития
В целях укрепления, совершенствования и развития научно исследовательской работы в институте созданы и функционируют
лаборатория и инновационный центр медицинских нанотехнологий и
сиквенс-центр.
Эти
центры
оснащены
современным
высокопроизводительным оборудованием, что
позволяет осуществлять
разработку и внедрение новых высокопроизводительных методов чтения
биологических текстов для медицины (расшифровка структуры ДНК, РНК,
белков),
а
также
проводить
геномно-транскриптомный
анализ
эукариотических организмов и осущестлятьметагеномные проекты,
включающие в себя изучение популяционного состава как природных
географически изолированных микробиоценозов, так и особенностей
симбионтно-паразитарной колонизации различных отделов организма
человека.